2017年9月- 2018年8月获奖者(2018财政年度)
•2018年6月- 8月
Yonathan Lissanu Deribe,医学博士博士。& Andrew Futreal, Ph.D.
瑞士/ SNF复杂突变诱发肺癌的通道对氧化磷酸化的依赖
肺癌是一种毁灭性的疾病,癌症死亡率的首要原因。尽管改进目标和免疫疗法,但多数肺癌患者缺乏有效的治疗方法,强调了需要额外的治疗方法。基因组研究发现频繁改变组件的瑞士/ SNF染色质重构复杂的包括SMARCA4和ARID1A。了解肿瘤发生机制由突变在这个复杂,我们开发出了一种转基因小鼠模型的肺腺癌消融Smarca4在肺上皮细胞。我们证明Smarca4作为一个真正的肿瘤抑制和合作p53损失和喀斯特激活。基因表达分析显示增强的氧化磷酸化的签名(OXPHOS)SMARCA4突变的肿瘤。我们进一步证明SMARCA4突变细胞增强了耗氧量,增加呼吸能力。重要的是,SMARCA4突变的肺癌细胞系和异种移植肿瘤标记对抑制OXPHOS新型小分子,iacs - 010759,在临床开发。从力学上看,我们证明SMARCA4缺乏细胞有钝化转录创建治疗可利用的能源压力的反应合成致命的交互。这些发现提供了进一步发展的机械基础OXPHOS抑制剂疗法对瑞士/ SNF突变的肿瘤。
Yonathan Lissanu Deribe个太阳,克里斯托弗•法蒂玛汗,胡安Martinez-Ledesma,杰森同性恋,光高,Robert a . Mullinax锡豪尔,Ningping冯,Yu-Hsi Lin Chia-Chin Wu克劳迪娅雷耶斯,钱,弗雷德里克·罗宾逊,彰井上,印度的七弦琴Kochat,长庚,约翰·m·Asara塞萨尔莫兰弗洛里安·穆勒,王静,Bingliang方Vali Papadimitrakopoulou,伊格纳西奥·i Wistuba,(Kunal拉伊约瑟夫·Marszalek和安德鲁Futreal
医学博士Michael Frumovitz
近红外荧光检测前哨淋巴结的女性宫颈和子宫癌症(电影):一个随机,第三阶段,多中心,non-inferiority审判
背景:准确识别癌症患者提高前哨淋巴结的转移性疾病的检测,减少手术并发症。我们试图确定吲哚菁绿荧光染料非劣isosulfan蓝色染料在检测前哨淋巴结在女性宫颈和子宫癌症。
发现日:2015年12月21日,6月19日,2017年,180名患者,随机分配到两组每组(90);176名患者接受了干预,可评价的人口(修改意向-治疗)。13主要协议侵犯患者随后人口排除在按方案。517前哨淋巴结识别人口按方案(n = 163),其中478(92%)被证实淋巴结病理处理:219(92%)的238个节点都是蓝色和绿色,蓝色只有所有7个节点,252只(95%)的265个节点,是绿色(p = 0·33)。七个前哨淋巴结是蓝色和绿色,但删除出现可疑或扩大视觉检查。总共有471(97%)的485个淋巴结与绿色的染料和226年(47%)与蓝色染料(差异50%、95% CI 39 - 62;p < 0·0001)。在修改后的意向处理人口(n = 176), 545个节点,其中513(94%)被证实淋巴结病理处理:229(92%)的248个节点都是蓝色和绿色,蓝色只有所有9个节点,266只(95%)的279个节点,是绿色(p = 0·30)。九sentinal淋巴结是蓝色和绿色,但删除出现可疑或扩大视觉检查。495(96%)的513个节点与绿色的染料和238年(46%)与蓝色染料(50%,39 - 61; p<0·0001).
解释:吲哚菁绿染料与近红外荧光成像识别前哨淋巴结比isosulfan蓝色染料在女性宫颈和子宫癌症,在节点组织的病理证实的病例中没有区别两个映射之间的物质。
教授Michael Frumovitz医学博士玛丽·普兰特教授,医学博士宝拉年代李医学博士,Samith Sandadi M.D., James F Lilja M.D., Pedro F Escobar M.D., Lilian T Gien M.D., Diana L Urbauer M.S. and Prof Nadeem R Abu-Rustum M.D.
约翰•Heymach医学博士博士。
STK11 / LKB1突变和PD-1抑制剂阻力喀斯特突变体肺腺癌
喀斯特在肺腺癌是最常见的致癌因素(LUAC)。我们先前报道,STK11 / LKB1(吉隆坡)或TP53(KP) co-mutations定义不同的子组喀斯特突变LUAC。在这里,我们在这些子组检查PD-1抑制剂的功效。客观反应率PD-1封锁KL之间的差距显著(7.4%)、KP(35.7%),和k只子组(28.6%)(P < 0.001) SU2C队列(174名患者)喀斯特突变患者LUAC和nivolumab在将军- 057年3期试验(0% vs 57.1%比18.2%,P = 0.047)。SU2C队列,KL LUAC展出短无进展(P < 0.001)和总生存期(P = 0.0015)喀斯特无足轻重的人;STK11 / LKB1WTLUAC。在924 LUAC,STK11 / LKB1改变是唯一的标记与三甲PD-L1消极显著相关中间/高LUAC。的影响STK11 / LKB1改变与PD-1 / PD-L1抑制剂临床结果扩展到PD-L1-positive非小细胞肺癌。在喀斯特突变鼠LUAC模型,STK11 / LKB1阻力损失提升PD-1 / PD-L1抑制剂,暗示因果作用。我们的结果确定STK11 / LKB1变化的主要驱动力主要阻力PD-1封锁喀斯特突变LUAC。
费迪南Skoulidis迈克尔·e·戈德堡丹尼尔·格里纳沃特·m·马修·d·张春马克·m·阿瓦德贾斯廷·f·Gainor Alexa施洛克,瑞安·j . Hartmaier莎莉e . Trabucco劳里同性恋,Siraj m·阿里·朱莉娅·a·艾文Gaurav信号,大卫•Fabrizio Jeffrey s .罗斯汉,彼得·m·萨博Stefan基洛夫Sujaya斯里尼瓦桑Ariella Sasson约瑟夫•Szustakowski帕特里克•Vitazka,罗宾·爱德华兹,何塞·a . Bufill Neelesh沙玛,Sai-Hong Ou, Nir贝利,David r .腾出空间,希拉Rizvi,伊丽莎白·吉梅内斯阿基拉布雷特•卡特(george w . bush),杰里米·伊拉斯谟,Darragh f·赫尔潘尼,安德鲁j . Plodkowski Niamh m长,Nishino水木,沃伦·l·丹宁安娜Galan-Cobo,海法,哈姆迪Taghreed Hirz,锅,王静Jaime Rodriguez-Canales帕梅拉·a·维拉波斯,埃德温·r·ParraNeda KalhorLynette m . Sholl,詹妮弗·l·萨德Achim a . Jungbluth Mari Mino-Kenudson,罗克珊娜阿,亚希尔y Elamin,Jianjun张范,会c . Leonardi江,Kwok-Kin Wongj .杰克李,Vassiliki a . Papadimitrakopoulou伊格纳西奥·i Wistuba文森特·a·米勒,加勒特·m·弗兰普顿研究d .吴克爱丽丝·t·肖,菲利普·j·斯蒂芬斯Pasi a .珍妮查尔斯·m·鲁丁William j .鹅,李Albacker和约翰诉Heymach
r·泰勒希尔曼,医学博士博士。& Andrew Futreal, Ph.D.
KMT2D/MLL2失活与复发有关成人型卵巢颗粒细胞瘤
成人型卵巢颗粒细胞瘤(aGCTs)是罕见的妇科恶性肿瘤,表现出高频率的躯体FOXL2c。C402G (p.Cys134Trp)突变。治疗复发aGCT仍然是一个重要的临床挑战。这里显示,使用whole-exome和面板癌症基因测序79 aGCTs从两个独立的组,删除突变的组蛋白赖氨酸甲基转移酶基因KMT2D(也称为MLL2)是一个周期性的体细胞在aGCT事件。Mono-allelicKMT2D删除突变更频繁复发(10/44,23%)与主(1/35,3%)aGCTs相比(p = 0.02,双边确切概率法)。包含IHC检测其他非KMT2D突变aGCTs与核的损失KMT2D表达式,表明遗传因素KMT2D失活可能发生在这个肿瘤类型。这些研究结果确定KMT2D失活小说在aGCTs司机事件,表明这个基因的突变可能会增加复发的风险。
r·泰勒希尔曼约瑟夫•Celestino克里斯托弗••汉娜c . Beird柯蒂斯Gumbs Latasha少,三阮,丽贝卡·桑顿,Samantha Tippen Jianhua张凯伦·h·卢,David m . Gershenson,(Kunal拉伊拉塞尔·r·Broaddus和安德鲁Futreal
珍妮弗·利顿,医学博士
Talazoparib晚期乳腺癌患者和生殖系BRCA突变
背景:保利(腺苷diphosphate-ribose)抑制剂talazoparib显示抗癌活性在晚期乳腺癌患者,在种系突变乳腺癌易感基因1和BRCA2(BRCA1/2)。
结果:431年病人的随机化,287年被分配接受talazoparib, 144被分配接受标准治疗。平均无进展生存在talazoparib大大延长组比标准治疗组(8.6个月和5.6个月;疾病进展或死亡风险比0.54;95%可信区间(CI), 0.41 - 0.71;P < 0.001)。临时平均死亡风险比为0.76 (95% CI, 0.55 - 1.06;P < 0.11[57%的预计事件])。客观反应率talazoparib组高于标准治疗组(62.6% vs . 27.2%;比值比,5.0;95%可信区间,2.9 - 8.8; P<0.001). Hematologic grade 3–4 adverse events (primarily anemia) occurred in 55% of the patients who received talazoparib and in 38% of the patients who received standard therapy; nonhematologic grade 3 adverse events occurred in 32% and 38% of the patients, respectively. Patient-reported outcomes favored talazoparib; significant overall improvements and significant delays in the time to clinically meaningful deterioration according to both the global health status–quality-of-life and breast symptoms scales were observed.
结论:在晚期乳腺癌患者和生殖系BRCA1/2突变,单talazoparib提供了一个重要的标准化疗对无进展生存受益。与talazoparib Patient-reported结果优越。(由Medivation(辉瑞);EMBRACA临床试验。政府的数字,NCT01945775。)
詹妮弗·k·利顿,希望美国Rugo Johannes Ettl萨拉·a·Hurvitz安东尼•Goncalves Kyung-Hun李,路易一定要,一举Yerushalmi1,丽达米娜,米格尔马丁,亨利·罗氏Young-Hyuck Im,鲁本G.W. Quek, Denka Markova,朱莉娅·c·都铎,艾莉森·l·汉娜,沃尔夫冈Eiermann和乔安娜·l·布卢姆
侯赛因Tawbi,医学博士博士。
结合Nivolumab和Ipilimumab黑色素瘤转移到大脑
背景禁用:脑转移是一个常见的原因转移性黑色素瘤患者的神经系统并发症和死亡。先前的研究排除转移性黑色素瘤的nivolumab结合ipilimumab治疗脑转移患者。我们评估的有效性和安全性nivolumab + ipilimumab治疗脑转移的黑素瘤患者。
结果:在94例患者平均随访14.0个月,颅内临床受益率为57%(95%可信区间(CI), 47 - 68);完全缓解率为26%,部分反应率为30%,和稳定的疾病至少6个月为2%。颅外的临床受益率为56%(95%可信区间,46到67)。治疗相关的3或4级不良事件被报道在55%的病人,包括7%的事件涉及中枢神经系统。一个病人死于几种心肌炎。方案的安全性报告类似于黑色素瘤患者没有脑转移。
结论:Nivolumab ipilimumab有临床意义的颅内功效相结合,整合与颅外活动,未经处理的脑转移的黑素瘤患者。(由百时美施贵宝和国家癌症研究所;将死204多,NCT02320058。)
侯赛因a Tawbi彼得·a·福赛斯Alain Algazi Omid哈米德,f·斯蒂芬•Hodi Stergios j . Moschos Nikhil Khushalani,卡尔·刘易斯,克里斯托弗·d·老挝Michael a . Postow迈克尔·b·阿特金斯大卫·a·里尔登马克·Ernstoff伊戈尔·Puzanov Ragini r . Kudchadkar丽娜·托马斯·艾哈迈德Tarhini,安娜·c·Pavlick Joel江亚历山大•阿维拉椎名Demelo Margolin和金姆
爱德华多Vilar桑切斯,医学博士博士。
免疫分析在林奇综合症患者癌变前的病变
重要性:大肠癌癌在林奇综合症患者(LS)出现在一个背景错配修复(MMR)不足,显示一个独特的免疫免疫档案与upregulation检查点,免疫疗法和响应。然而,仍有差距在理解MMR-deficient直肠癌癌变前的病变的发病机制,为小说的发展是至关重要的预防策略LS。
客观的:免疫的特征从一群患者LS癌变前的病变。
结果:分析共有28个息肉(管状腺瘤和2增生性息肉26日)和3早期LS结直肠肿瘤24例(15(62%)的女性;平均(SD)的年龄,48.12[15.38]年)诊断与FAP (n = 10)和LS (n = 14)。总的来说,LS息肉出现突变和neoantigen利率较低,但表现出显著的免疫激活配置文件以CD4 T细胞,促炎(肿瘤坏死因子、白介素12)和检查点分子(LAG3(淋巴细胞激活基因3]和PD-L1[细胞程序性死亡配体1])。这种免疫档案是独立的突变速率,neoantigen形成,和MMR状态。此外,我们发现了一个小的子集LS息肉突变和neoantigen率高与hypermutant肿瘤并显示额外的检查点(CTLA4[细胞毒性T-lymphocyte-associated蛋白4])和neoantigens参与DNA损伤反应(ATM和BRCA1信号)。
结论和意义:这些研究结果挑战规范化模型,基于癌的观察,强调免疫激活的依赖高水平的突变的收购和neoantigens,从而打开门的实现免疫抑制剂检查站在LS和疫苗预防癌症。
凯尔,梅丽莎·w·塔戈特劳拉Reyes-Uribe酯Borras,埃里克里克尔梅,里根·m·巴内特,圭多,f·安东尼·圣卢卡斯玛丽亚·t·Catanese Federica森玛丽亚·g·Diodoroy南希你,欧内斯特·t·霍克,杰森Roszik,保罗Scheet,斯科特Kopetz,Elisa Scarselli阿尔弗雷多尼科西亚帕特里克·m·林奇,的卡麦卡利斯特和爱德华多Vilar
•3月- 2018年5月
Rehan Akbani博士。
癌症细胞
一个全面的Pan-Cancer分子研究妇科和乳腺癌
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小东程博士。
细胞
DNA构象串联锌指蛋白诱导适应性强的约束力
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弗雷德里克·f·朗,医学博士FAANS,流式细胞仪
临床肿瘤学杂志
第一阶段研究dnx - 2401 (Delta-24-RGD)溶瘤腺病毒:复制和在复发性恶性神经胶质瘤免疫治疗效果
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汉梁博士。
细胞
Pan-Cancer分析增强器表达式在近9000个患者样本
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光彭博士。
自然医学
ARID1A缺乏促进可变性和强化治疗抗肿瘤免疫免疫检查站发动封锁
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Padmanee沙玛,医学博士博士。
新英格兰医学杂志》上
Nivolumab + Ipilimumab和舒尼替晚期肾细胞癌
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迈克尔•王医学博士
《柳叶刀》
Acalabrutinib复发或难治性套细胞淋巴瘤(ace - ly - 004):一个单臂,多中心,第二阶段试验
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布莱恩巴塞洛缪博士。
自然通讯
H2A INO80交流。Z为H2A把DNA近端组蛋白二聚体
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詹森•休斯医学博士博士。
自然
原产地Atrx失活驱动器disease-defining表型在神经胶质瘤细胞通过全球外遗传性重构
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汉梁博士。
癌症细胞
A-to-I RNA编辑有助于蛋白质组多样性癌症
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尼古拉斯·纳文博士。
细胞
药物抗性进化三阴性乳腺癌并由单细胞测序
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旅游爱好者Jacqulyne。萝勃塔,博士约翰·诉Heymach |医学博士博士。
自然医学
机制和临床活动的EGFR和HER2外显子20-selective激酶抑制剂在非小细胞肺癌
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安妮·曹医学博士
癌症细胞
胸腺上皮肿瘤的综合基因组景观
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Rehan Akbani博士。
一个全面的Pan-Cancer分子研究妇科和乳腺癌
我们分析分子数据2579肿瘤癌症基因组图谱(TCGA)四种妇科+乳房。我们的目标是识别共享和独特的分子特征,临床上重要的子类型,和潜在的治疗靶点。我们发现61体细胞人类基因组改变(大会)和46显著突变基因(smg)。十一大会和11个smg TCGA没有被确认在之前研究个人的肿瘤类型。我们发现功能重要的雌激素receptor-regulated长非编码rna (lncRNAs)和基因/ lncRNA交互网络。通路分析鉴定亚型高白细胞浸润,提高免疫治疗的潜在影响。使用16个关键的分子特性,我们发现5预后亚型和决策树分类患者发展成基于六子类型应税在临床实验室的功能。
阿什顿c·伯杰Anil Korkut,Rupa s凯蒂之一Apurva m .对冲基金,沃尔特Lenoir Wenbin刘,刘月新沈,慧慧的粉丝,回族,Visweswaran Ravikumar, Arvind Rao,安德烈•舒尔茨Xubin李帕维尔Sumazin,塞西莉亚·威廉姆斯Preethi h . Gunaratne Pieter Mestdagh克里斯蒂娜瑶族,9 Reanne鲍比,a·戈登•罗伯逊丹尼尔·g·Tiezzi陈,安德鲁·d·Cherniack安德鲁·k·古德温妮可·m·库德珍妮特雷德,迷迭香e .对此Anil k Sood,亚历山大·j·拉扎尔,克莱门特Adebamowo Akinyemi i Ojesina莎莉n . Adebamowo基斯·a·巴格利Ting-Wen Chen hua sheng赵,史蒂夫•Lefever梁Liu桑德拉Orsulic,凯伦·麦肯齐杰森Roszik西蒙•雪莱,卡尔千千的歌,克里斯托弗·p·Vellano尼古拉•Wentzensen癌症基因组图谱的研究网络,乐动体育LDsports中国约翰·n·温斯坦戈登·b·米尔斯道格拉斯·a·莱文和Rehan Akbani
布莱恩巴塞洛缪博士。
H2A INO80交流。Z为H2A把DNA近端组蛋白二聚体
ATP-dependent染色质remodellers调节核小体动力学通过动员或拆卸核小体,以及改变核小体组成。这些染色质remodellers一般函数把沿着nucleosomal H3-H4接口的DNA核小体。在这里,我们表明,不同于其他remodellers, INO80把沿着DNA核小体的H2A-H2B接口和持续取代DNA H2A-H2B的表面。DNA易位和DNA扭转应变创建进入位点附近的核小体由INO80促进核小体的动员和选择性H2A交换。Z-H2B二聚体的核小体和替换H2A-H2B二聚体没有任何额外的组蛋白陪伴。我们发现INO80把和动员H2A。包含H2A Z-containing核小体更有效地比,部分占INO80取代H2A的偏好。与H2A Z。我们的数据表明,INO80二聚物交换机制,不同于其他染色质remodellers包括paralogue SWR1。
Sandipan梵天,Maheshi Udugama, Jongseong金,阿扬哈达,Saurabh k . Bhardwaj所罗门g .张爱景Tae-Hee李和布莱恩巴塞洛缪
小东程博士。
DNA构象串联锌指蛋白诱导适应性强的约束力
串联锌指(ZF)蛋白质是最大和最迅速发散的家族在哺乳动物的dna结合转录监管机构。ZFP568压制的成绩单placental-specific胰岛素样生长因子2 (Igf2-P0)在老鼠身上。ZFP568结合一对24-base sequence-specific元素的上游Igf通过eleven-ZF 2-P0数组。DNA和蛋白质构象偏离传统finger-three基地之一的认可,与个别ZFs联系2、3或4基地和识别胸腺嘧啶的反链。这些交互产生于缩短小沟at富集造成的,建议ZF数组序列变化的适应性。尽管哺乳动物保护,突变Igf2和ZFP568减少他们的亲和力在黑猩猩和人类。我们的研究提供重要的见解ZF-DNA进化和结构动力学的相互作用,发挥关键作用在哺乳动物发展和演化。
彭Anamika Patel,马修·Tinkham Mihika Pradhan,安太阳,一轩王,唐黄平君,Gernot狼,约翰·r·霍顿兴张,托德Macfarlan和小东程
詹森•休斯医学博士博士。
Atrx失活驱动器disease-defining表型在全球外遗传性重塑神经胶质瘤细胞的起源
瑞士/ SNF染色质监管者突变失活ATRX神经胶质瘤中经常发生,最常见的原发性脑肿瘤。是否以及如何通过外遗传性ATRX缺乏促进肿瘤形成失调仍不清楚,尽管最近暗示基因组不稳定性和端粒功能障碍。这里我们报告Atrx损失概括特点疾病表型和分子特性在假定的神经胶质瘤细胞的起源、诱导细胞运动性虽然也将向一个病患而不是分化状态和潜在神经histiogenic概要文件。此外,Atrx缺乏驱动广泛的染色质易访问性的变化,组蛋白成分,和转录分布几乎完全局限于基因组网站通常受蛋白质。最后,直接基因的目标Atrx调解特定Atrx-deficient表型在体外表现出类似的选择性misexpressionATRX变异人类神经胶质瘤。这些发现表明ATRX缺陷及其外遗传性后遗症足以诱发disease-defining致癌表型在适当的细胞和分子上下文。
卡拉Danussi Promita Bose, Prasanna t高佩德罗·c·Silberman John s . Van Arnam Mark Vitucci奥利弗·y唐阿德里亚娜Heguy,渝王,蒂莫西·a . Chan Gregory j .湖底埃里克·人民弗雷德里克·朗、乍得j·克莱顿,本杰明•迪尼c·瑞恩•米勒Kannan Kasthuri和大卫·j·皮科特杰森·t·休斯
弗雷德里克·f·朗,医学博士FAANS,流式细胞仪
第一阶段研究dnx - 2401 (Delta-24-RGD)溶瘤腺病毒:复制和在复发性恶性神经胶质瘤免疫治疗效果
dnx - 2401 (Delta-24-RGD;tasadenoturev)是一个肿瘤的,replication-competent溶瘤腺病毒。临床前研究表明antiglioma功效,但行动的效果和机制尚未评估的病人。
方法:第一阶段,剂量递增,biologic-end-point dnx - 2401的临床试验是在37复发性恶性神经胶质瘤患者进行的。患者接受单个瘤内注射dnx - 2401活检确诊复发肿瘤评估安全性和响应在8个剂量水平(a组)。调查行动的机制,第二组患者(B组)进行了通过永久植入导管瘤内注射,之后14天,全体切除收购后处理标本。
结果:在A组(n = 25), 20%的患者存活3年>从治疗,和三个患者减少≥95%提高肿瘤(12%),与所有三个戏剧性的反应导致> 3年无进展生存时间的治疗。分析治疗手术标本(B组,n = 12)表明,dnx - 2401肿瘤内的复制和传播,记录患者的直接溶癌作用占据。除了影像学炎症的迹象,病理组织检查后处理标本显示肿瘤的免疫标记由CD8渗透+和T-bet+细胞跨膜免疫球蛋白治疗后差别mucin-3对这些。分析有关patient-derived细胞系的分子模式显示诱导肿瘤细胞的免疫原性细胞死亡后dnx - 2401管理。
结论:dnx - 2401治疗导致戏剧性的反应与长期生存在高档神经胶质瘤复发可能是由于病毒的直接溶瘤细胞的影响引出的免疫介导的antiglioma反应紧随其后。
弗雷德里克·f·朗查尔斯•康拉德这Gomez-Manzano,W.K.阿尔弗雷德·容雷蒙德·萨瓦亚,杰弗里·s·温伯格,Sujit s您正在Ganesh Rao,格雷戈里·n·富勒肯尼斯·d·Aldape欢乐Gumin,路易斯•旺斯附近的m .Ignacio WistubaJaime Rodriguez-Canales帕梅拉·a·维拉波斯,克莱门斯小说第一索尼娅Tejada,里卡多·d·瓦莱玛尔塔·m·阿隆索布雷特埃瓦尔德,乔安娜·j·彼得金,弗兰克Tufaro和胡安Fueyo
汉梁博士。
A-to-I RNA编辑有助于蛋白质组多样性癌症
腺苷(A)肌苷(I) RNA编辑介绍许多核苷酸癌症转录组的变化。然而,由于转录后调控的复杂性,RNA编辑到蛋白质组多样性的贡献人类癌症仍不清楚。在这里,我们进行一个综合的分析,TCGA基因组数据和CPTAC蛋白质组数据。尽管有限的网站的多样性,我们证明A-to-I RNA编辑有助于蛋白质组多样性在乳腺癌通过氨基酸序列的变化。我们验证编辑事件的存在在RNA和蛋白质含量。编辑国王杯蛋白增加扩散、迁移和入侵癌细胞在体外。我们的研究显示A-to-I RNA编辑到蛋白质多样性的一个重要贡献在癌症和突出其转化潜力。
心心彭,晓燕,大卫·h·霍克Yumeng Wang双Yu愣,周至诚Kamalika Mojumdar,康晋宋,Marilyne莱柏瑞,姚蔚曾荫权,如矿坑的张夷陵路帕特里克·胡,肯尼斯·l·斯科特,汉梁和戈登·b·米尔斯
汉梁博士。
Pan-Cancer分析增强器表达式在近9000个患者样本
增强子的作用,非编码DNA监管的关键类元素,在癌症的发展越来越被感激。这里,我们目前的检测和表征大量表达增强剂在33 8928肿瘤样本的全基因组分析癌症类型使用TCGA RNA-seq数据。与相应正常组织相比,全球观察增强器激活在大多数癌症。在癌症、全球增强活动与非整倍性呈正相关,但不是突变负载,提出一个假设集中在“chromatin-state”来解释他们的相互作用。整合eQTL mRNA co-expression,高c数据分析,我们开发了一种计算方法来推断因果enhancer-gene交互,揭示临床可行的基因的增强子。确定了一个增强器~ 1140 kb PD-L1下游,主要的免疫疗法的目标,我们实验验证它。这项研究提供了一个增强器活动在不同肿瘤的系统视图上下文,并建议增强剂的临床意义。
尼古拉斯·纳文博士。
药物抗性进化三阴性乳腺癌并由单细胞测序
三阴乳腺癌(TNBC)是一个激进的亚型,经常对化疗产生耐药性。一个悬而未决的问题是电阻的选择是由罕见的预先存在的克隆或者通过收购新基因畸变。探讨这个问题,我们应用单细胞DNA和RNA序列除了散装外显子组测序分析纵向样本20 TNBC患者新辅助化疗期间(NAC)。Deep-exome测序确定10个病人中,NAC导致克隆灭绝和10个克隆坚持治疗后的病人。8例,我们进行了更详细的研究使用单细胞DNA测序分析900个细胞单细胞RNA序列分析6862个细胞。我们的数据表明,耐药基因型被NAC预先存在的,自适应地选择,而转录概况收购重组TNBC患者对化疗的反应。
Charissa Kim Ruli高,Emi Sei,雷切尔·布兰德,约翰·哈特曼,托马斯•Hatschek Nicola Crosetto,塞奥佐罗斯•Foukakis和尼古拉斯·e·纳文
光彭博士。
ARID1A缺乏促进可变性和强化治疗抗肿瘤免疫免疫检查站发动封锁
ARID1A(1 at富集作用域,也被称为BAF250a)是一种最常见的突变基因在癌症。大多数的ARID1A突变是灭活突变并导致损失ARID1A表达,这使得ARID1A糟糕的治疗目标。因此,它是临床重要的识别分子ARID1A的后果缺乏创造治疗漏洞ARID1A突变的肿瘤。在蛋白质组学屏幕,我们发现ARID1A与错配修复(MMR) MSH2蛋白。ARID1A招募MSH2在DNA复制和推广MMR染色质。相反,ARID1A失活妥协MMR和提高诱变。ARID1A缺乏与微卫星不稳定基因签名和主要C > T突变模式和增加突变负载在多种人类癌症类型。肿瘤由ARID1A-deficient卵巢癌细胞系的同系的小鼠突变负载增加,显示数量的肿瘤浸润淋巴细胞升高,PD-L1表达式。值得注意的是,治疗anti-PD-L1抗体减少肿瘤负荷,延长小鼠的生存ARID1A缺乏但不ARID1A野生型卵巢肿瘤。这些结果表明ARID1A不足导致受损MMR癌症突变表型,并可能与免疫检查点封锁疗法。
Zhenlin榉沈剑锋,魏赵,露露,杨彭,启通用电气,扎卡里·d·内格尔,小君邹,陈Wang Prabodh Kapoor黎妈,丁马,忌用梁,捧的歌,劲松刘利昂娜·d·参孙,于jaf a Ajani李Guo-Min,汉梁沈Xuetong戈登·b·米尔斯和光彭
旅游爱好者Jacqulyne。萝勃塔,博士和约翰·诉Heymach医学博士博士。
机制和临床活动的EGFR和HER2外显子20-selective激酶抑制剂在非小细胞肺癌
尽管大多数表皮生长因子受体(EGFR)的激活突变突变非小细胞肺癌(nsclc)可用敏感表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(TKIs),改变外显子20的一个子集表皮生长因子受体和HER2有内在的抵抗力和缺乏一个有效的疗法。我们用于硅片、体外和体内试验模型结构改变引起20外显子突变和识别有效的抑制剂。3 d建模表示改变drug-binding口袋的大小限制,限制大的约束力,僵化的抑制剂。我们发现poziotinib,由于其体积小和灵活性,可以规避这些空间的变化,是一种最常见的表皮生长因子受体和HER2的有效抑制剂20外显子突变体。Poziotinib演示活动超过批准EGFR TKIs体外和patient-derived异种移植模型的表皮生长因子受体或HER2 20外显子突变非小细胞肺癌和非小细胞肺癌的转基因小鼠模型。在第二阶段试验中,与非小细胞肺癌患者的前11表皮生长因子受体外显子突变20接收poziotinib证实客观缓解率为64%。这些数据识别poziotinib作为一个有效的,临床活性的抑制剂表皮生长因子受体和HER220外显子突变和照亮的分子特性TKIs可能绕过这些突变引起的空间变化。
Jacqulyne p·罗比查乌克斯,亚希尔y Elamin智棕褐色,布雷特•卡特(george w . bush),Shuxing张李、刘Shengwu帅,陈Ting,艾莉萨Poteete,阿德里亚娜Estrada-Bernal,安·t·勒,安娜·Truini Monique b·尼尔森Huiying太阳,艾米丽Roarty,莎拉·b·戈德堡,朱莉·r·Brahmer穆罕默德Altan,查尔斯·卢,Vassiliki Papadimitrakopoulou怀中Politi,罗伯特·c·Doebele Kwok-Kin黄约翰诉Heymach
Padmanee沙玛,医学博士博士。
Nivolumab + Ipilimumab和舒尼替晚期肾细胞癌
Nivolumab + ipilimumab产生客观的反应在晚期肾细胞癌患者的初步研究。这第三阶段试验相比nivolumab + ipilimumab与舒尼替以前未经治疗的先进透明细胞肾细胞癌。我们随机分配成年人在1:1的比例获得nivolumab(3毫克/公斤体重)加上ipilimumab每3周(1毫克/公斤)静脉注射四剂,其次是nivolumab(3毫克每千克)每2周,或舒尼替(50毫克)每天口服一次4周(6周期)。coprimary终点总生存期(α水平,0.04),客观缓解率(α水平,0.001),和无进展生存(α水平,0.009)在中间或贫困患者预后的风险。共有1096名患者被分配接受nivolumab + ipilimumab(550例)或舒尼替(546例);425年和422年分别有中间或贫困风险。在平均随访25.2个月中间,poor-risk患者,18个月的整体存活率为75%(95%可信区间(CI), 70年至78年)nivolumab + ipilimumab和60%(95%可信区间,55 - 65)与舒尼替;中位总生存期是没有达到与舒尼替nivolumab + ipilimumab与26.0个月(的死亡风险比,0.63;P < 0.001)。客观缓解率为42%和27% (P < 0.001),完全缓解率分别为9%和1%。 The median progression-free survival was 11.6 months and 8.4 months, respectively (hazard ratio for disease progression or death, 0.82; P=0.03, not significant per the prespecified 0.009 threshold). Treatment-related adverse events occurred in 509 of 547 patients (93%) in the nivolumab-plus-ipilimumab group and 521 of 535 patients (97%) in the sunitinib group; grade 3 or 4 events occurred in 250 patients (46%) and 335 patients (63%), respectively. Treatment-related adverse events leading to discontinuation occurred in 22% and 12% of the patients in the respective groups.
总体存活率和客观缓解率明显高于nivolumab + ipilimumab比舒尼替在中间和poor-risk以前未经治疗的患者晚期肾细胞癌。
罗伯特·j . Motzer,医学博士,Nizar m . Tannir医学博士大卫·f·麦克德莫特,医学博士,Osvaldo Arén Frontera, M.D., Bohuslav Melichar, M.D., Ph.D., Toni K. Choueiri, M.D., Elizabeth R. Plimack, M.D., Philippe Barthélémy, M.D., Ph.D., Camillo Porta, M.D., Saby George, M.D., Thomas Powles, M.D., Frede Donskov, M.D., Ph.D., et al., for the CheckMate 214 Investigators (Padmanee沙玛,医学博士博士。)
安妮·曹医学博士
胸腺上皮肿瘤的综合基因组景观
胸腺上皮肿瘤(建立)是最罕见的成人恶性肿瘤之一。在建立中,胸腺瘤是最主要的,特点是一个独特的协会与自身免疫性疾病,其次是胸腺癌,临床上不常见但更咄咄逼人。使用多平台组学分析在117建立,我们定义四个亚型的这些肿瘤基因组特征和关联定义的生存和世界卫生组织的组织学亚型。我们进一步证明显著的流行thymoma-specific突变致癌基因,GTF2I,探索多平台的生物效应分析。我们进一步观察浓缩hra的突变,国家管制当局方面,TP53。最后,我们确定一个分子重症肌无力胸腺瘤与自身免疫性疾病之间的联系,以tumoral过度的肌肉自身抗原,并增加非整倍性。
米兰拉多维奇,柯蒂斯·r·皮克林Ina Felau,加文·哈,Hailei张Heejoon乔,凯瑟琳·a . Hoadley Pavana Anur,杰忻张Mike McLellan Reanne鲍比,托马斯·马修,柳德米拉Danilova之一Apurva m .对冲基金Jaegil金马克D.M.雷瑟尔森,创始人Geetika Sethi,查尔斯,迈克尔•瑞安小平苏安德鲁·d·Cherniack戈登•罗伯逊Rehan Akbani,保罗首位,约翰·n·温斯坦本•拉斐尔·d·尼尔·海耶斯,塔拉·利希滕贝格,克里斯汀Leraas, Jean Claude Zenklusen癌症基因组图谱网络,的藤淳弥黄,Cristovam Scapulatempo-Neto,安德烈·Moreira,大卫,詹姆斯·黄董事长米莱拉•马里诺罗伯特•Korst朱塞佩Giaccone, Yesim Gokmen-Polar,苏尼尔•Badve Arun Rajan菲利普Strobel,尼古拉•吉拉德明曹,亚历山大•马克思安妮·s·曹和Patrick j . loehr
迈克尔•王医学博士
Acalabrutinib复发或难治性套细胞淋巴瘤(ace - ly - 004):一个单臂,多中心,第二阶段试验
布鲁顿酪氨酸激酶是套细胞淋巴瘤临床验证的目标。Acalabrutinib (acp - 196)是一个具有高度选择性,强有力的布鲁顿酪氨酸激酶抑制剂开发以减少非目标的活动。在这个非盲、第二阶段的研究中,口服acalabrutinib每天两次(100毫克)给患者复发或难治性套细胞淋巴瘤,直到疾病进展或不可接受的毒性。主要终点是总体响应评估根据卢加诺分类、和安全分析是在所有参与者中完成。这个试验是在ClinicalTrials.gov注册,数字NCT02213926。从3月12日,2015年1月5日,2016年,124例复发或难治性套细胞淋巴瘤患者登记和所有的病人接受治疗;平均年龄68岁。患者接受两个(差1 - 2)以前的中位数疗法。在平均15·2个月的随访中,100名(81%)患者实现了总体响应和49例(40%)患者实现一个完整的响应。kaplan meier估计持续时间的中位数反应,无进展生存,和整体的生存是没有达到;12个月的利率分别为72%(95%可信区间62 - 80),67%(58 - 75)和87%(79 - 92%),分别为。治疗停止在54例(44%)患者中,主要是由于进步的疾病(39[31%])和不良事件(7 [6%])。Acalabrutinib治疗提供了一个高耐用的响应速度和良好的安全性在患者复发或难治性套细胞淋巴瘤。这些发现表明一个重要的角色acalabrutinib治疗这种疾病。
迈克尔•王,西蒙规则,安德烈异邦人,奥利维尔·Casasnovas Pier Luigi Zinzani斯蒂芬·D·史密斯,甘地Damaj,珍妮特Doorduijn,蒂埃里拉米,弗兰克Morschhauser,卡洛斯•Panizo伦敦国王,安德鲁•戴维斯(Richard唷,接过话头Dupuis,埃里克·雅各布森亚嫩河P卡特尔,露西Oberic,史蒂文•勒Gouill Taduesz可观,托德•柯维理查德Dua Ahmed Hamdy鑫黄拉克尔和泉,Priti Patel,韦恩Rothbaum J格雷格杂质煤和Wojciech Jurczak
•2017年12月- 2018年2月
医学博士Michael Andreeff博士。
癌症细胞
合成的杀伤力bcl - 2抑制和激活p53在AML:机制和优越Antileukemic功效
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小东程博士。
分子细胞
通用的结构基础和Methylation-Dependent绑定CTCF的DNA
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西蒙娜阿胶博士。
癌症细胞
ILF2是RNA拼接的调节器和DNA损伤反应1 q21-amplified多发性骨髓瘤
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医学博士罗伯特•Jenq |詹妮弗·a .沃戈医学博士,M.M.Sc。
科学
肠道微生物调节反应anti-PD-1黑色素瘤患者的免疫治疗
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尼古拉斯·纳文博士。
细胞
Multiclonal入侵在乳腺肿瘤被地形单细胞测序
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斯宾塞韦博士|詹姆斯•埃里森博士。
细胞
不同的细胞机制Anti-CTLA-4和Anti-PD-1检查点封锁
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选用一些Bar-Eli博士。
自然通讯
A-to-I mir - 378 a - 3 - p编辑可以防止黑色素瘤进展通过调节PARVA表达式
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弗朗西斯卡科尔博士。
细胞
年龄相关性变化在精母细胞减数分裂重组导致染色体分离错误
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碧塔海Esmaeli,医学博士,硕士| Scott E. Woodman M.D., Ph.D.
癌症细胞
综合分析确定四个分子和葡萄膜黑色素瘤临床子集
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亚历山大•拉扎尔医学博士博士。
细胞
全面、综合基因组描述成人软组织肉瘤
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有情Neelapu,医学博士
新英格兰医学杂志》上
Axicabtagene Ciloleucel汽车t细胞疗法耐火型大b细胞淋巴瘤
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杨Liuqing博士| Chunru林博士。
临床研究杂志
JAK2-binding长非编码RNA促进乳腺癌脑转移
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医学博士Michael Andreeff博士。
合成的杀伤力bcl - 2抑制和激活p53在AML:机制和优越Antileukemic功效
逃避凋亡是癌症的一个特点。bcl - 2和p53代表细胞凋亡信号通路中的两个重要的节点。我们发现伴随p53 bcl - 2激活和抑制细胞凋亡克服阻力和明显延长生存在三小鼠模型的抗急性髓系白血病(AML)。机械化,p53激活负调节Ras /皇家空军/ MEK / ERK通路并激活调节GSK3 mcl1磷酸化和促进其降解,从而克服AML抵抗bcl - 2抑制。此外,bcl - 2抑制相互地克服了细胞凋亡抵抗p53激活通过切换从G细胞反应1细胞凋亡被逮捕。效果,再加上机械的发现,揭示了潜在的同时针对这两个细胞凋亡监管机构和提供了合理依据这种治疗方法的临床测试。
熔清锅,维维安Ruvolo在香港μ,乔尔·d·Leverson格温尼克尔斯,约翰·c·里德,玛丽娜Konopleva和迈克尔Andreeff
选用一些Bar-Eli博士。
A-to-I mir - 378 a - 3 - p编辑可以防止黑色素瘤进展通过调节PARVA表达式
此前有报道称,转移性黑素瘤细胞系和肿瘤标本减少了表达ADAR1因此受损的能力执行A-to-I微rna (microRNA的)编辑。的A-to-I microrna编辑对黑色素瘤的生长和转移的影响尚未确定。这里我们报告,mir - 378 - a - 3 - p正在A-to-I编辑只有non-metastatic但不是在转移性黑色素瘤细胞。编辑表单的功能不同于其野生型。的编辑形式mir - 378 - a - 3 - p的3’utr优先结合PARVA致癌基因,抑制其表达,从而防止黑色素瘤的发展走向恶性表型。实际上,编辑mir - 378 - a - 3 - p但不是WT形式抑制体内黑色素瘤转移。这些结果进一步强调RNA编辑在黑色素瘤进展的作用。
Guermarie Velazquez-Torres Einav·索珊,克里斯蒂娜•伊万(音译),恩里克Fuentes-Mattei哈里森拳赛,金太阳金,克里斯蒂安·Rodriguez-Aguayo谢,维多利亚,丹尼斯·布鲁克斯,史蒂文J.M.琼斯,a·戈登•罗伯逊乔治Calin,加布里埃尔Lopez-Berenstein,Anil Sood和选用一些Bar-Eli
小东程博士。
通用的结构基础和Methylation-Dependent绑定CTCF的DNA
的多畴的CCCTC-binding因子(CTCF),包含一系列串联的11个锌指(ZFs),调节染色质的三维组织。我们人类的结晶CTCF dna结合域与一个已知的复杂CTCF-binding网站。虽然ZF2不让sequence-specific联系人,每个手指15-bp ZF3-7接触三个基地的共识序列。每个守恒的核苷酸base-specific氢键与特定的残渣。大部分核心内的变量碱基对序列也参与相互作用的蛋白质。这些交互补偿偏离共识序列,允许CTCF适应变化序列。CTCF胞嘧啶甲基化敏感在位置2,但不敏感的位置12 15-bp核心序列。这些差异可以合理化结构。虽然在结晶方法包括,ZF10 ZF11是不可见的,尽管ZF8和ZF9跨越了DNA双螺旋的支柱,赋予没有序列特异性但增加整体绑定的稳定性。
弗朗西斯卡科尔博士。
年龄相关性变化在精母细胞减数分裂重组导致染色体分离错误
忠诚在减数分裂染色体隔离需要交叉(CO)重组,这是监管,确保每同族体对至少一个有限公司。我们调查未能确保因为幼年雄性小鼠。通过监测复合全基因组使用细胞学检测和在热点使用分子检测,我们表明,幼年小鼠精母细胞更少因为相对于成年人。分析重组缺乏MLH3提供了证据青少年大利用率的途径包括structure-selective核酸酶和替代复合物,可行动前体生成noncrossovers中心化)因为为代价的。我们建议一些指定的公司网站不成熟的青少年由于不适当的活动有效地替代修复途径,导致染色体mis-segregation。我们还发现低MutLγ密度集中在少年人的精母细胞,表明弱公司成熟效率或许可以解释为什么年轻男性有更高的男性孕育出的孩子患唐氏综合症的风险。
Maciej j . Zelazowski玛丽亚·桑多瓦尔Lakshmi Paniker,霍莉·m·汉密尔顿,岁汉族,Mikalah a .科里布瑞亚康弗朗西斯卡科尔
西蒙娜阿胶博士。
ILF2是RNA拼接的调节器和DNA损伤反应1 q21-amplified多发性骨髓瘤
放大的温度系数发生在大约30%的重新和70%的复发多发性骨髓瘤(MM)和与疾病进展和耐药性。在这里,我们提供的证据1对方篮里amplification-driven过度ILF2 MM促进宽容的基因组不稳定性和抗dna有害。机械化,高架ILF2表达式产生耐药性基因毒性代理通过调制YB-1与剪接因子U2AF65核本地化和互动,促进mRNA加工和成绩单的稳定参与同源重组,以应对DNA损伤。之间的亲密联系1 q21-amplified ILF2和DNA修复基因的RNA拼接的监管可能会利用优化DNA有害的使用高危患者毫米。
马特奥Marchesini, Yamini Ogoti Elena不快,Anil Aktas Samur,路易吉Nezi,玛丽安娜D 'Anca, Paola Storti,穆罕默德凯末尔Samur,艾琳Ganan-Gomez江,他Mistry Maria Teresa Fulciniti山,Naran包,瓦伦蒂娜Marchica, Antonino内里,卡洛斯Bueso-Ramos李、吴Chang-Jiun张汉梁妮可·朱利安尼心心彭,,朱里奥Draetta,凯伦Clise-Dwyer,着KantarjianNikhil Munshi,罗伯特Orlowski,吉尔勒莫Garcia-Manero,罗纳德·a·DePinho和西蒙娜阿胶
碧塔海Esmaeli,医学博士,硕士& Scott E. Woodman M.D., Ph.D.
综合分析确定四个分子和葡萄膜黑色素瘤临床子集
多平台综合分析80年葡萄膜黑色素瘤(嗯)识别四个分子不同,临床相关的子类型:两个与不良预后相关的染色体3 (M3)和两个有更好的预后二体性3 (D3)。我们表明,BAP1遵循M3发生和损失与全球不同于D3-UM DNA甲基化状态。不良预后与不同的基因畸变M3-UM分成子集,转录功能,和临床结果。我们报告功能发生变化,SRSF2突变。在D3-UM,EIF1AX- - -SRSF2 / SF3B1突变的肿瘤有明显的躯体拷贝数变化和DNA甲基化资料,提供洞察这些低收入的生物学和临床变异亚型中度风险。
a·戈登•罗伯逊Juliann Shih,克里斯蒂娜瑶族,伊万·a·吉布Junna Oba,凯伦·l·Mungall朱利安·m·赫斯弗拉季斯拉夫•Uzunangelov——Vonn沃尔特,柳德米拉Danilova,塔拉·m··利希滕贝格,梅兰妮Kucherlapati,帕特里克·k·金明,亚历山大•人Ozgun巴布尔,Rehan Akbani,克里斯托弗·a·布里斯托凯瑟琳·a·Hoadley丽莎Iype,马修·t . Chang TCGA的研究网络,安德鲁·d·Cherniack克里斯托弗•奔驰戈登·b·米尔斯Roel G.W. Verhaak,克劳斯·g . Griewank艾娜Felau,吉恩·c . Zenklusen乐动体育LDsports中国杰弗里·e·Gershenwald林恩Schoenfield,亚历山大·j·拉扎尔默罕默德·h·任,塞尔吉奥•Roman-Roman Marc-Henri斯特恩,科琳·m·Cebulla米歇尔·威廉姆斯马丁尼j .贼鸥,莎拉·e·科普兰碧塔海Esmaeli,Cyriac Kandoth和斯科特·e .樵夫
医学博士罗伯特•Jenq &詹妮弗·a·沃戈医学博士,M.M.Sc。
肠道微生物调节反应anti-PD-1黑色素瘤患者的免疫治疗
临床前小鼠模型表明,肠道微生物调节肿瘤反应检查点封锁免疫治疗;然而,这并没有在人类癌症患者特征明显。在这里,我们研究了黑色素瘤患者的口腔和肠道微生物组接受anti-programmed细胞死亡1蛋白质(PD-1)免疫疗法(n = 112)。显著差异的观察病人的肠道微生物的多样性和组成人员和nonresponders。分析病人粪便微生物样本(n = 43岁,30反应者,13 nonresponders)显示α多样性显著升高(P < 0.01)和相对丰富的细菌Ruminococcaceae家族的反应患者(P < 0.01)。在肠道细菌宏基因组研究显示功能的不同反应,包括合成代谢途径的浓缩。免疫分析建议增强系统性和抗肿瘤免疫反应患者良好的肠道微生物以及无菌鼠收到回应粪便移植的病人。在一起,这些数据具有重要意义治疗黑色素瘤患者的免疫抑制剂检查站。
维迪雅葛c·n·斯宾塞,l . Nezi亚历山大·鲁本m·c·安德鲁斯,t . v . Karpinets p . a .普列托d .韦森特凯伦·伊丽莎白·霍夫曼,s . c, a . p . Cogdill l .赵c·w·哈金斯·d·s·哈钦森,t . Manzo m . Petaccia de马赛,t . Cotechini t·库马尔w·s·陈,s m . Reddy r·斯隆Szczepaniak j . Galloway-Pena香港江p·l·陈,伊丽莎白·j·Shpall,凯蒂Rezvani,阿明m . Alousi,罗伊·f·Chemaly,塞缪尔·a·Shelburne,旺斯附近的m . .巴勃罗·c·Okhuysen,凡妮莎·詹森a·g·Swennes,的卡麦卡利斯特大肠,大肠马塞洛·里克尔梅桑切斯y Zhang勒夏特列原理,l . Zitvogel n .脑桥j·l·奥斯汀- Breneman l . e . Haydu e·m·伯顿j·m·加德纳e . Sirmans j .胡亚历山大·j·拉扎尔t . Tsujikawa,Adi迪亚布,侯赛因a Tawbi,伊莎贝拉c Glitzaw·j·研究会会长,s·帕特尔斯科特·e .樵夫,Rodabe n Amaria,迈克尔·a·戴维斯,杰弗里·e·Gershenwald,p .研究会会长,杰弗里•李j·张,l . m . Coussens z . a . Cooper p . a . Futrea嘉莉R Daniel-MacDougall:j .贾米德j . f .彼得·m·泰兹拉夫t。Padmanee沙玛,詹姆斯·p·埃里森,罗伯特·r·Jenq和詹妮弗沃戈
亚历山大•拉扎尔医学博士博士。
全面、综合基因组描述成人软组织肉瘤
肉瘤是一种广泛的家庭间叶细胞恶性肿瘤表现出显著的组织学的多样性。我们描述了多平台206成人软组织肉瘤的分子景观代表6个主要类型。随着小说的见解个人肉瘤的生物类型,我们报告三个总体结果:(1)与大多数上皮恶性肿瘤,这些肉瘤(除了滑膜肉瘤)是主要由人类基因组的变化特征,较低的突变负载和只有少数基因(TP53,ATRX,RB1)肉瘤之间高度地变异类型;在肉瘤(2)类型,基因和regulomic司机路径定义的多样性的分子亚型与病人相关的结果;和(3)免疫微环境,推断出从DNA甲基化和mRNA概要,同事和结果可能通知检查点免疫抑制剂的临床试验。总的来说,这之前从未见过大规模的分析揭示了sarcoma-type-specific拷贝数的变化,甲基化,RNA和蛋白质,提供洞察精炼肉瘤治疗和其他癌症类型之间的关系。
癌症基因组图谱研究网络——领导:乐动体育LDsports中国亚历山大·j·拉扎尔
尼古拉斯·纳文博士。
Multiclonal入侵在乳腺肿瘤被地形单细胞测序
性导管癌原位(DCIS)是一个很少的早期乳腺癌的进展为浸润性导管癌(IDC)。基因组进化很难描绘在入侵期间由于intratumor异质性和肿瘤细胞的低数量的管道。为了克服这些挑战,我们开发了地形单细胞测序(tsc)来衡量基因拷贝数的单个肿瘤细胞,同时保留他们的空间环境组织部分。我们应用tsc患者1293单一细胞同步DCIS和IDC地区除了外显子组测序。我们的数据显示之间的直接基因家族原位和侵入性肿瘤亚种群,进一步表明,大多数突变和拷贝数畸变进化前导管内的入侵。这些结果支持multiclonal入侵模型,其中一个或多个克隆逃离导管并迁移到邻近组织建立浸润性癌。
安娜·k . Casasent Aislyn Schalck, Ruli高,Emi Sei, Annalyssa长,威廉•Pangburn Tod Casasent基础Meric-Bernstam,玛丽·e·艾顿和尼古拉斯·e·纳文
有情Neelapu,医学博士
Axicabtagene Ciloleucel汽车t细胞疗法耐火型大b细胞淋巴瘤
在这个多中心,第二阶段试验,我们招收了111名患者弥漫型大b细胞淋巴瘤,原发性纵隔b细胞淋巴瘤,或改变滤泡性淋巴瘤的难治性疾病,尽管接受之前推荐的治疗。患者接受目标剂量的2×106anti-CD19汽车T细胞每公斤体重在接受低剂量环磷酰胺和氟达拉滨的调节方案。主要终点是客观缓解率(计算相结合的完全缓解率和部分响应)。次要终点包括总生存期、安全和生物标志物评估。
111名患者中,axi-cel成功制造了110至101(99%)和管理(91%)。客观缓解率为82%,完全缓解率为54%。平均随访15.4个月,42%的病人继续有反应,有40%继续有一个完整的反应。生存在18个月的总体率为52%。最常见的不良事件在治疗嗜中性白血球减少症三年级或更高(78%的患者),贫血(43%)和血小板减少症(38%)。三年级或更高的细胞因子释放综合征和神经活动发生在13%和28%的患者,分别。三个病人死于治疗。更高的汽车t细胞水平在血液与反应相关。
在这个多中心研究中,耐火接受汽车t细胞的大b细胞淋巴瘤患者治疗与axi-cel高水平的持久的反应,安全性,包括myelosuppression,细胞因子释放综合征,神经活动。
有情s NeelapuF.L.洛克,N.L.巴特利特,l·j·Lekakis D.B. cooper米,c.a雅各布森,布伦瑞克,o Oluwole, t . Siddiqi y Lin J.M. Timmerman, P.J.僵硬,J.W.弗里德伯格,I.W. Flinn, a .异教徒B.T.山,核磁共振Smith, a . Deol Farooq, p .主编,j .穆尼奥斯Avivi, J.E.卡斯特罗,杰森·威斯汀而J.C.查韦斯,a . Ghobadi Komanduri, r·利维E.D.雅各布森,式样通过,p .里根,机器人,j·罗西,l . Navale y江,j .额寇卡·m·伊莱亚斯d . Chang j . Wiezorek W.Y.去
斯宾塞韦博士和詹姆斯·埃里森博士。
不同的细胞机制Anti-CTLA-4和Anti-PD-1检查点封锁
Immune-checkpoint封锁能够实现持久的反应患者的一个子集;然而,我们缺乏一个令人满意的理解底层机制anti-CTLA-4 anti-PD-1-induced肿瘤排斥。为了解决这些问题,我们利用质量血细胞计数全面概要文件检查点封锁的影响在人类黑色素瘤和肿瘤浸润免疫小鼠肿瘤模型。这些分析揭示肿瘤浸润的T细胞数量之间是高度相似的肿瘤模型和表明检查点封锁目标只有特定的肿瘤浸润T细胞亚群的数量。Anti-PD-1主要诱发特定肿瘤浸润的扩张exhausted-like CD8 T细胞的子集。相比之下,anti-CTLA-4诱发这个理事会的扩张+Th1-like CD4人口效应除了迷人的特定子集的疲惫像CD8 T细胞。因此,我们的研究结果表明,anti-CTLA-4 anti-PD-1检查点,封锁诱导免疫反应是由不同的细胞机制。
斯宾塞·c·魏雅各布·h·莱文亚历山大·Cogdill杨赵,Nana-Ama A.S. Anang,英里c·安德鲁斯Padmanee沙玛静王詹妮弗·a .沃戈达纳Pe怎样和詹姆斯·p·埃里森
杨Liuqing博士& Chunru林博士。
JAK2-binding长非编码RNA促进乳腺癌脑转移
传统治疗乳腺癌脑转移(BCBMs)很大程度上是无效的,因为血脑屏障的药物抗性和不渗透性。全面了解底层机制,允许乳腺癌细胞渗透到大脑规避治疗抵抗BCBMs是必要的。这里,我们确定长非编码RNA的表达(lncRNA)我们叫lncRNA与BCBM (Lnc-BM)预后的脑转移乳腺癌患者的进展。在临床前小鼠模型,开车BCBM Lnc-BM表达升高,而损耗的Lnc-BM nanoparticle-encapsulated siRNAs BCBM有效治疗。Lnc-BM JAK2激酶活动增加调解制瘤素M -和IL-6-triggered STAT3磷酸化。在乳腺癌细胞,Lnc-BM提升STAT3-dependent表达式ICAM1和CCL2,介导血管cooption和招募巨噬细胞在大脑中,分别。招募巨噬细胞进而制瘤素M和il - 6产生,从而进一步激活Lnc-BM / JAK2 / STAT3通路和加强BCBM。总的来说,我们的结果表明,Lnc-BM JAK2促进BCBMs调停乳腺癌细胞和大脑微环境之间的通信。此外,这些结果表明针对Lnc-BM作为一个潜在的战略对抗这种困难的疾病。
柯Shouyu Wang Liang,菁,Ping Li剑歌,强大,小君么,Lingegowda Selanere Mangala李Chunlai,朱文昊杨,Peter k .公园,大卫·h·霍克健胃周、燕,Weiya夏,Mien-Chie挂,加里•e . Gallick Jeffrey r标志加布里埃尔Lopez-Berestein埃尔莎·r·弗洛雷斯,Anil k SoodSuyun黄,Dihua余,Liuqing杨和Chunru林