我们提供了各种实验方案，用于对RNA或DNA样品的深度测序，这取决于您的实验的要求。在许多情况下，可以在测序运行的每个通道中成功地分析多个样本。给定通道的多个是由实验所需的读取深度的限制。

以下表提供了各种实验的典型多重性和测序要求的指南，核心的样本要求和估计成本。有关更多详细信息，请致电或发送电子邮件，以便与核心员工进行一次会议。

请注意，价格如有更改，恕不另行通知。

服务	样本类型	最低金额	最短 conc （ng /μl）	质量	额外要求
RNA-SEQ.
总RNA SEQ.	总RNA.	1.5µg	100.	rin> 8.0	DNase治疗
MRNA SEQ.	总RNA.	2μg.	200.	rin> 8.0	不需要DNase治疗
mirna seq.	总RNA.	2μg.	200.	rin> 8.0	不需要DNase治疗

^{*注意：RRB和WGBS文库都是由DNA甲基化分析核心制备并由科学园NGS核心测序。}

服务类型	测序	多重性（样品/车道）	预计＃阅读	成本/车道**
RNA-SEQ.
差异表达(TruSeq链总RNA)	76 nt，成对端	8.	> 20米	3372美元
差异表达（Truseq Stranded mRNA）	76 nt，成对端	8.	> 20米	2684美元
新型转录物（Truseq链状总RNA）	76 nt，成对端	4.	> 40米	$ 2,516
miRNA *	36nt，单读	12.	> 8米	$ 2,836
DNA-seq
人体exome.	76 nt，成对端	4.	> 40米	$ 2,820
鼠标exome.	76 nt，成对端	4.	> 40米	3120美元
芯片SEQ.	36 nt，单读	6.	> 18M	查询
降低表示亚硫酸氢盐测序（RRB）	36 nt，配对结束	4.	> 24米（覆盖范围20倍）	1,810美元
全基因组亚硫酸氢盐测序（WGBS）	76 nt，配对末端或100nt，配对结束***	1	查询	查询

^{*注意：MiRNA样品通常可以每巷复用至48个样本。
**注意：费用是基于使用Hiseq 3000计算的。如果使用nextseq 500，则此估计将是不同的。该成本是样品制备和测序成本的总和。一旦您决定测序的类型（读取长度，单个或配对端）和多个（每个车道的样本数），可以从下表中的参数计算成本。
***注意：根据准备的WGBS库的尺寸范围。}

样品制备	NGS用户组成员价	MDACC教师， UT系统，BCM W / MOU价格	*外部网络外的价格	数量
RNA-SEQ（Truseq Stranded总RNA **）	$ 266.05	321.47美元	$ 514.35.	每个样本
mRNA（Truseq Stranded mRNA）	$ 182.05	$ 237.47	379.95美元	每个样本
Quansseq 3'mRNA-SEQ Library Prep（Lexogen）	$ 58.83	77.98美元	$ 124.77	每个样本
超低输入RNA cDNA合成（clontech smart-seq v4）	162美元	202美元	256美元	每个样本
用于超低输入RNA（Illumina Nexteraxt）的库预备（不包括cDNA合成）	55美元	100美元	160美元	每个样本
Truseq RNA接入库准备（用于从FFPE组织分离的人RNA）	275美元	444美元	710.40美元	每个样本
microRNA-SEQ（Illumina Kit）	$ 176.34	286.03美元	430.83美元	每个样本
MicroRNA-SEQ（NEB套件）	$ 122.80			每个样本
ChIP-seq (NEB Ultra kit)(价格与珠子清理)	118.96美元	163.30美元	$ 261.28	每个样本
芯片SEQ（KAPA HEATH KIT）（用珠子清洁定价）	117.82美元	$ 162.15	259.45美元	每个样本
Exome-SEQ.	$ 175.09	312.19美元	493.19美元	每个样本（不包括捕获）
鼠标Exome捕获	$ 875.79	$ 985.46.	$ 1,130.26	每个样本（1-4个样本/捕获）
人类Exome捕获	566.19美元	$ 675.86.	820.66美元	每个样本（1-4个样本/捕获）
减少代表性亚硫酸氢铝合金SEQ（RRB）	245美元			每个样本
全基因组亚硫酸氢盐测序（WGBS）	255美元			每个图书馆

^{*注意：这些价格不包括我们机构可能收取的任何管理费用。
**注意：请联系核心工作人员进行套件选择咨询。}

服务	NGS用户组成员 价格（每车道）	MDACC教师，UT系统， bcm w / mou 价格（每车道）	*外部无线网络 价格（每车道）
Hiseq 3000.
50 bp，单读	$ 966.41.	$ 1,100.71	$ 2,177.47
75 BP，配对结束	$ 1,746.41.	$ 1,880.71	$ 3,425.47
100 BP，配对结束	$ 2,089.61.	$ 2,223.91.	$ 3,974.59
150 BP，配对结束	$ 2,431.25	$ 2,565.55	$ 4,521.22
nextseq 500.
高输出：
75 BP，单读	$ 1,632.95	$ 1,853.96.	$ 3,238.11
75 BP，配对结束	$ 3,085.83	3306 .84元	$ 5,562.72
150 BP，配对结束	$ 4,904.79.	$ 5,125.80	$ 8,473.06
中产量：
75 BP，配对结束	$ 1,232.55	$ 1,453.56.	美元2597 .47点
150 BP，配对结束	$ 1,941.83.	$ 2,162.84	$ 3,732.32
Miseq.
50 BP，单读（V2化学）	948.99美元	$ 1,132.53	$ 1,358.78
150 BP，配对结束（V2化学）	$ 1,202.19	$ 1,481.73	美元1707 .98点
300 BP，单读（V2化学）	$ 1,202.19	$ 1,481.73	美元1707 .98点
300 BP，配对结束（V3化学）	$ 1,782.99	$ 2,177.73	$ 2,403.98.

^{*注意：这些价格不包括我们机构可能收取的任何管理费用。}