CIMP甲基化分析
迹象:
甲基化是一种化学修饰,在蛋白质、DNA和RNA的特定位点上添加甲基(CH3)。在人类中,DNA甲基化仅影响胞嘧啶碱基(C),其后是鸟嘌呤(G)。这些胞嘧啶磷酸鸟嘌呤(CpG)双核苷酸在整个人类基因组中以非常低的频率存在,除非在CpG含量高得多的小区域称为CpG岛。大多数CpG岛存在于基因的5 '启动子区域。当启动子CpG岛甲基化时,相关基因被沉默。
CpG岛甲基化表型(CpG island methylator phenotype, CIMP)以广泛的启动子甲基化为特征,与大肠癌中的微卫星不稳定性(MSI)和BRAF突变相关。
CIMP分类:
- CIMP-HIGH:3个或更多CPG岛基因座甲基化
- CIMP-LOW:1至3个CPG岛基因座是甲基化的
- CIMP-DIALY:没有CPG岛基因座甲基化
在CIMP的这个亚组中有6个基因将要被测试:hMLH1;Mint1、Mint2 Mint31;好,p16。
方法:
进行基于PCR的DNA的焦磷酸,以检查每个测试基因的多个CpG岛基因座的甲基化状态。肿瘤克隆必须包含样品中的至少10%的细胞。
测试参数:
该测定将检测任何测试基因的CpG岛基因座的DNA甲基化。测定的敏感性是非甲基化DNA背景中甲基化DNA的10%。
回转时间:
7-10天
样本需求:
福尔马林固定,石蜡包埋的组织块含有足够数量的肿瘤供分析(见上面的敏感性),有需要检测的区域。比较正常和肿瘤,或几个不同的肿瘤区域可以做,额外收费。
请提供相应的病理报告的副本。
CPT代码:
81479
额外的费用可用于组织提取。
提供的CPT代码基于AMA指南,仅供参考。CPT编码是计费方的唯一责任。请指导有关编码的任何问题,以向付款人进行计费。