代谢组学工具
菲尔Lorenzi博士。
设备主管
代谢组学设施MD安德森为基础和临床癌症研究提供最先进的代谢产物质谱分析。乐动体育LDsports中国我们对两者都提供服务MD安德森和外部的调查人员。
代谢组学是什么?
- 代谢组学是研究生物样品中的小分子(一般指分子量小于1500道尔顿的分子),包括相对定量和绝对定量。
- “靶向代谢组学”指的是对分子子集的分析,而“非靶向代谢组学”指的是对所有可检测到的小分子的分析。
- 除了测量总代谢物水平外,第二个工作流程还包括同位素示踪分析(目标模式或非目标模式),其中稳定的同位素标记代谢物可用于跟踪新陈代谢中原子的流动。
- 我们测量代谢物最常见的生物基质有:细胞、培养基、血浆、全血、红细胞、尿液和组织。但更复杂的矩阵(如骨骼)也可以分析。
我们的服务
我们提供通用和专业的基于质谱的代谢组学技术和服务。
如何认识代谢的核心功能
为了在一个充满挑战的环境中继续获得核心支持,我们的用户在所有的出版物中确认以下授权是至关重要的(参见以下文本)。谢谢你!
“这项工作部分得到了德克萨斯州癌症预防研究所(CPRIT)拨款编号RP130397和NIH拨款编号S10OD乐动体育LDsports中国012304-01、U01CA235510和P30CA016672的支持。”
常见问题
我应该进行靶向性还是非靶向性代谢组学实验?
如果你知道你想要/需要测量的代谢物,一个有针对性的实验是理想的选择,因为它可以以一种稳健的方式提供绝对的定量。
如果你不确定你想要测量什么,一个非目标实验可以提供有价值的见解,任何有趣的结果都可以通过后续的目标实验来验证。
- 在非目标实验中,定量通常是相对的,而不是绝对的。实际上,经过一些思考和讨论,大多数用户(即使是那些认为他们需要做一个非目标实验的人)通常可以得出一些他们希望在实验中看到改变的代谢物或途径。
我应该运行一个标准的代谢组学实验或稳定的同位素示踪分析?
代谢物浓度本身往往不能说明全部问题;两种不同的环境(例如,未处理和药物处理)可能产生相同的特定代谢物的总浓度,但潜在的生化反应可能对两种环境中代谢物的测量水平有不同的贡献。这种现象可以通过稳定同位素示踪分析来识别。例如,细胞可以用13C标记的代谢物进行处理,并且可以有针对性地或非针对性地跟踪13C标记从初始代谢物向下游代谢物的转移。其他常用的同位素标签包括15N和18O。
- 注意:稳定同位素不应与放射性同位素混淆;稳定的同位素不具有放射性。
我选择在现场进行实验;下一步我该做什么?
如果您的实验涉及到一个细胞系,请提交最近的支原体检测结果,以确认该细胞系是支原体阴性。最好与MD安德森完成测试特征性细胞系核心(CCLC)。
请联络Phil Lorenzi (PLLorenzi@mdanderson.org)来安排你的实验。我们的员工在代谢物样品制备方面经验丰富;现场实验确保了最高质量的结果。
这是常见的下降关闭单元上周五,然后进行实验以下星期。当脱落的细胞,请:
1.将细胞置于有孔盖的烧瓶中,以确保细胞在运输过程中的无菌性。(如果你的实验室不用烧瓶,我们可以提供给你)一般建议用新鲜培养基喂养细胞,或将细胞运输到我们的设施后将其分裂。
2.实验前,请携带足够的培养基、PBS、胰蛋白酶、药物和/或任何其他处理方法,以进行实验和细胞传代。
如果您需要运送细胞、药物和/或其他材料给我们,邮寄地址为:
菲尔Lorenzi
后者街7435号
房间2 scr3.3207
休斯敦,TX 77054
713-563-4634