表观基因组学剖析核心
服务
- 表观基因组学剖析核心
- DNA甲基化分析服务
- 高通量芯片服务
该表观基因组学剖析核心（EpiCore）由中心癌症表观遗传学和表观遗传学系与分子致癌资助。这个核心的总体目标是促进研究人员的定义改变染色质在正常与疾病状态调节转录状态的表观遗传机制的努乐动体育LDsports中国力。
我们的目的
表观基因组学分析核心的目的是积极参与,为日益增长的表观遗传学MD安德森和德州医学中心的社区提供服务,分析双重关注表观遗传学改变DNA甲基化分析和高通量染色质免疫沉淀反应(芯片)服务。
EpiCore概述
DNA甲基化分析服务
在DNA的特定位点的甲基化发生的事件是最早确定的表观遗传修饰染色质之一。DNA甲基化是正常发育所必需，并且与数字键过程，如压印相关联。DNA甲基化，这是可以逆转，通常会影响基因的转录。当甲基化的基因组调控元件内发生，尤其如此。因此，在DNA甲基化模式的改变反映重要表观遗传变化。DNA甲基化分析服务提供通过各种各样的方法调查访问全局和基因特异性DNA甲基化分析。
我们的服务包括：
•咨询调查人员，选择最佳的分析方法
•样品制备
•试验设计
•用于基因特异性和基因组范围内的常用方法来研究DNA甲基化样品的处理：
——PyroMeth
——rrb
——Methyl-Seq
•通过焦磷酸测序分析重复元素(如LINE-1和Alu重复)来评估整体DNA甲基化
请联系马科斯Estecio博士。，安排DNA甲基化分析服务的预约和初步咨询。
有关其他调度，请使用iLab
高通量ChIP-Seq服务
其中，针对有意了解染色质动力学研究的主要问题是蛋白质-DNA相乐动体育LDsports中国互作用如何改变后生景观改变基因表达。染色质免疫沉淀（ChIP）用于在特定基因组位点诘蛋白-DNA相互作用。芯片起（芯片随后DNA的深度测序）使富集了跨基因组的染色质结合蛋白区域的鉴定。高通量的ChIP-Seq的服务提供了一个创新的，具有成本效益，96孔平台，提供高品质，测序就绪库组蛋白修饰，转录辅调控和转录因子的基因组全图。
我们的服务包括：
•咨询调查人员，选择最佳的分析方法
•高品质的染色质提取细胞和组织样本
•芯片使用一套验证过的抗体，用于特定的组蛋白标记(如下)，或研究者首选的抗体
-H3K4me3，H3K27me3的（启动子）
-H3K4me1，H3K27ac（增强子）
-H3K36me3, H3K79me2(基因体)
-H3K9me3(异染色质)
从免疫沉淀的物质•测序文库制备
请联系阿比纳夫耆那教，博士，为高通量晶片交换服务安排预约及初步谘询。
有关其他调度，请使用iLab
EpiCore工作流
在与核心董事就研究者的需求和样本要求进行讨论后，研究者将其样本提交给
生物信息学支持
联系信息
DNA甲基化分析服务
马科斯R. Estecio博士
联席主任，表观基因组学剖析核心
DNA甲基化分析服务中心主任
办公电话:713-792-9108
电子邮件：mestecio@mdanderson.org
高通量ChIP-Seq服务
阿比纳夫耆那教，博士
联席主任，表观基因组学剖析核心
高通量芯片seq服务总监
办公电话：713-834-6366
电子邮件：ajain@mdanderson.org