CPRIT儿科实体肿瘤综合数据资源核心

• 全基因组测序(WGS)
• 全外显子组测序(WES)
• RNA测序

平台和工具

• NovaSeq 6000
• Ilumina HiSeq 4000
• Ilumina HiSeq 3000
• Ilumina HiSeq 2000
• Ilumina NextSeq 500
• Ilumina MiSeq
• Ilumina芝加哥期货交易所
• Covaris售价
• 蓝皮聘

免疫组织化学（IHC）或多重由于以下优化抗体的单重使用面板：

• 免疫检查点
• 骨髓来源的抑制细胞(MDSCs)
• T细胞

流式细胞仪/质谱术/复用的离子束成像（MIBI）面板可用于以下情况：

• T细胞
• B细胞
• NK细胞
• 树突细胞
• t细胞上的共刺激和共抑制分子

功能评估

• 流式细胞术检测T细胞活化
• ELISPOT
• 新抗原发现
• T细胞受体（TCR）和B细胞受体（BCR）的识别

宿主因素

• 细胞因子分析

平台和工具

• 中尺度发现(MSD)
• Luminex公司
• ELISA
• 自动IHC / IF（徕卡^TM,Aperio at₂^TMAperio /精灵^TM， 精灵^TM;维克特拉^TM威达/通知^TM,通知^TM）
• 免疫荧光系统（蛋白石^TM-tsa系统多重威达IF，威达^TM(珀金埃尔默,威达/通知^TM
• MediMachine(肿瘤组织裂解)-流式染色采集与分析(BD CantoII, BD Fortessa X20)

DNA甲基化

• 基因特异性和全基因组方法
  • 硫酸氢盐测序
  • 减少表示亚硫酸氢盐测序（RRBS）
  • 全基因组硫酸氢盐测序（WGBS）
  • 焦磷酸测序DNA甲基化分析(PMA)

高通量的ChIP-Seq的

• 组蛋白修饰
  • 组蛋白H3-K4-me3，组蛋白H3-K27-me3(启动子)
  • 组蛋白H3-K4-ME1，组蛋白H3-K27-AC（增强）
  • 组蛋白H3-K36-ME3，组蛋白H3-K79-ME2（基因体）
  • 组蛋白H3-K9-me3(异染色质)
  • 转录因子(根据需要)

平台和工具

• PyroMark Q96ID
• Ilumina HiSeq 3000
• Ilumina NextSeq 500
• Ilumina MISeq
• Ilumina芝加哥期货交易所
• Bioruptor双床超声仪
• Covaris售价
• 蓝皮聘
• 安捷伦2100生物分析仪
• 安捷伦2200 TapeStation

• 高灵敏度LC/MS/MS分析
• RPPA(肿瘤组织和培养细胞)

平台和工具

• 高分辨率，精确质量(HRAM) -轨道轨道融合摩擦质谱仪。
• 基质辅助激光解吸电离(MALDI) (4700 MALDI TOF/TOF质谱仪)
• 三重四极质谱计