由Red和Charline McCombs癌症早期检测和治疗研究所建立的RNA干扰和非编码RNA中心(RNA Center)是一个独特的合作项目MD安德森包括美国贝勒医学院、德克萨斯大学休斯顿健康科学中心、莱斯大学和休斯敦大学的癌症研究中心,他们将重点研究新发现的rna在癌症的发生、发展和传播中的作用。
我们的任务是识别、设计和加速非编码RNA (ncRNA)发现的突破,从而开发出癌症生物标志物和治疗方法。
我们的短期目标是建立在现有的临床研究的基础上乐动体育LDsports中国MD安德森癌症中心通过合作和会员的RNA中心创建的ncRNA为中心努力通过评估,共同发展,促进和传播新的非编码RNA的技术,以推动癌症的分子标志物的发现。
我们的长期目标是建立一个全机构的非编码RNA的资源合作,并提供专长的临床和基础研究的非编码RNA和RNAi领域。乐动体育LDsports中国
联系我们
拉胡尔·米特拉博士
RNA中心项目主任
电子邮件:rmitra@mdanderson.org或rnacenter@mdanderson.org
概述
从减轻与癌症相关的慢性疼痛到治疗致命的脑转移,RNAi对每一种癌症的潜在应用。RNA干扰提供了切断促进癌细胞生长的基因的强大和高度特异的方法。我们的研乐动体育LDsports中国究旨在开发跨越癌症护理的全面,持续性这一潜力。
MicroRNA和其他短或长非编码rna的改变参与了人类癌症的发生、发展和转移。主要的分子变化表现为基因表达的变化,通常是轻微的,并对大量的靶蛋白编码基因产生影响。与正常细胞相比,非编码rna在恶性细胞中广泛表达差异的原因可以通过这些基因在癌症相关基因组区域的位置、表观遗传机制和处理机制的改变来解释。
微RNA的表达分析和其它短或在人类肿瘤长的非编码RNA已确定与诊断,分期,进展,预后和治疗反应相关联的签名。此外,分析已被利用来确定的非编码RNA,其可以代表活化的致癌途径的下游靶标或瞄准参与癌症的蛋白质编码基因。最近的研究表明,miRNA和非编码基因超保守是难以捉摸类的癌症易感基因主力人选,而其他类型的非编码RNA的参与遗传之谜引起恶性表型。这些发现可以被利用了的诊断和预后有重要意义的标记开发,以及为新的RNA为基础的癌症疗法的发展。
RNAi一目了然
RNAi是一种基因疗法,通过破坏蛋白质的生成过程来“沉默”基因。这一过程在一份被科学家称为“分子生物学中心教条”的声明中得到了本质上的解释:DNA制造RNA制造蛋白质。
DNA住在细胞核和由数千个基因,每一个保持的代码,或“蓝图”用于构建特定蛋白质分子和从而确保通过该蛋白质进行特定细胞功能。(蛋白质进行几乎每个细胞的功能,包括其它基因的激活)。当由主体,其遗传密码是从DNA复制所需要的特定的蛋白质;“复制”是已知为信使RNA(mRNA)的单个分子链。这一过程,被称为转录,发生在细胞核中。
但是,蛋白质是在细胞核外以称为核糖体的微观结构制造的。信使rna是至关重要的一环:“信使”从DNA中获取蛋白质生成指令,并将其传递给蛋白质生成核糖体。
RNA干扰包括将miRNAs或siRNAs引入细胞,使其靶向、结合并摧毁特定的mrnas——有效地关闭特定蛋白质的产生,以及它们触发或抑制的任何基因表达。
术语表
核糖核酸-核糖核酸的首字母缩略词,每个有机体的细胞中发现的两种核酸中的一种(另一种是脱氧核糖核酸,简称DNA)。RNA是由一种叫做核苷酸的小分子组成,它们排列成一条链。RNA负责运输制造蛋白质所需的信息。
非编码RNA (ncRNA)不被翻译成蛋白-a功能性RNA分子。非编码RNA的例子是短干扰RNA和微RNA。
短干扰RNA(siRNA)-小的双链分子,用于RNA干扰,阻止基因翻译成蛋白质。siRNAs也被称为小干扰rna或沉默rna。
小分子核糖核酸(microrna的)- 小,发夹样的单链RNA分子的结构,其能调节的蛋白质编码基因的表达。
核糖核酸干扰(RNAi)-a基因沉默革命性的技术。在该技术中,RNA被引入细胞以破坏信使RNA并防止其翻译成蛋白质。
服务
RNA干扰和非编码RNA中心(RNA Center)目前正在为微RNA和非编码RNA分析提供高通量原位杂交(ISH)技术。该中心提供设备和服务,以确定小鼠和人类组织中的基因表达模式。
设备:
- VENTANA发现超
灵活性:
- 无与伦比的协议的灵活性,快速测定开发&
- 对于改进的工作流程运行30个完全独立的协议
重现:
- 全自动载玻片加工,经染色烘干
- 准备使用的优化试剂
- 对每一张幻灯片进行精确加热
材料与方法:
- 冷冻和FFPE组织样本
- 来自Exiqon的microRNA探针或自定义LNA探针
- 其他使用LNA技术的ncRNA特异性探针
- 抗地高辛或抗fitc抗体/AP结合2抗体/ NBT-BCIP底物检测
- 在明亮视野显微镜下成像
- 数据解释由研究者自行决定(我们将使用Leica应用程序套件提供信号强度的量化)
处理时间:
- miRNA杂交最多7个工作日
- 其他ncRNA特异性杂交最多10个工作日
在这个阶段,RNA中心可以提供显色性ISH服务。在不久的将来,我们还将提供基于ISH的荧光和多重ISH/IHC。
更多信息,包括价格和提交请求,请联系张欣娜博士,助理教授,RNA中心xzhang12@mdanderson.org。