资源
我们的软件
CRISPR
ProTiler: CRISPR/Cas9 tilting - sgrna筛选的关键蛋白域从头鉴定的整合管道。
GuidePro:一个两层集成预测器,能够整合多个因素,以确定蛋白质敲除中sgrna的优先级。
此外,还提供了一个基于GuidePro的web应用程序,用于对人类、猴子和小鼠基因组中的蛋白质编码基因进行优先排序可获得的.
莫帕克:一个闪亮的驱动应用程序,用于分析和显示多个样本上的CRISPR/Cas9屏幕。
MaGeCK:一种基于模型的分析工具,用于从CRISPR/Cas9筛选中识别重要基因。
SSC:一种在CRISPR应用中预测sgRNA活性的在线工具。
CRISPR-DO:用于五个基因组(人类、小鼠、苍蝇、蠕虫和斑马鱼)中sgRNA序列的全基因组设计和优化的web应用程序
ChIP-seq
CCAT:基于信号噪声模型的ChIP-seq分析工具(非常快!)
奇普迪夫:一种基于隐马尔可夫模型(HMM)的应用程序,用于通过比较两个芯片序列库来识别差异修饰的组蛋白位点。
基因组分析
GS2A:一种分析工具,用于从肿瘤队列的表达谱中筛选与一组“特征基因”相关的基因。