乐动体育LDsports中国
为了更好地理解精氨酸甲基化的生物学作用，Bedford小组使用了许多不同的生物学方法来研究PRMT功能。这些包括小鼠PRMT功能获得和丧失模型，甲基结合蛋白的蛋白质微阵列筛选，PRMT底物的生化筛选，以及PRMT家族成员的化学抑制剂筛选。
基因敲除小鼠模型
该实验室已经产生了一些小鼠精氨酸甲基转移酶基因的靶向破坏为了这个翻译后修饰UNMASK细胞和组织特定的角色。小鼠模型包括CARM1，PRMT3和PRMT6缺失小鼠。该基团对这些无效小鼠进行转录组分析（RNA-SEQ）和芯片起来识别基因，它们调节剧目。此外，他们正在创建双基因敲除动物研究不同PRMTs之间的冗余。
功能小鼠模型
贝德福德实验室还在制造功能获得转基因小鼠模型，以观察体内PRMT过表达的影响。这些模型是用转基因小鼠开发的，这些转基因小鼠携带的基因可以通过与组织特异性cre系杂交而被激活。Cre表达移除lox/STOP/los盒并激活PRMT表达。他们已经使用这种方法生成了PRMT6功能获得小鼠，现在正在开发CARM1、PRMT1、PRMT5和TDRD3转基因小鼠。
蛋白质阵列和分析核心
蛋白质结构域是进化保守的蛋白内发现，用作信令单元基序。某些基序可以用于在识别特定的翻译后修饰，从而允许蛋白质 - 蛋白质相互作用的调节发生。该实验室已开发出有价值的蛋白质阵列平台鉴定结合修饰肽蛋白结构域。大多数内核芯片的设计，以确定蛋白质结构域“改为”组蛋白密码。
蛋白阵列和分析核心(PAAC)最初是在MD Anderson的环境和分子致癌中心的帮助下建立和发展起来的一个新设施。该核心项目现在得到了德克萨斯癌症预防和研究所(CPRIT RP 180804)的资助。乐动体育LDsports中国该核心提供了蛋白质结构域微阵列，一种高通量技术，以帮助研究人员识别新的蛋白质-蛋白质相互作用。
蛋白质宏阵列屏幕
蛋白质宏阵列技术是用于高通量筛选平行酶 - 底物，蛋白 - 配体或蛋白质化学化合物，和蛋白质 - 蛋白质相互作用的一个强有力的工具。使用这种方法，贝德福德实验室已经确定了一些用于CARM1和PRMT1基板和被延伸此方法来鉴定蛋白质与生物素化小分子相互作用。
潘抗体的方法
贝德福德组也正在开发和表征识别MMA，ADMA，SDMA和基序以画面和特征分析PRMT底物的抗体。例如，为了识别用于使用混合抗原池CARM1，它们已经产生泛CARM1基板抗体，其港口甲基许多已知CARM1基板中的基序新颖底物。然后将这些抗体用于富集CARM1甲基化的蛋白质，然后将其通过质谱法鉴定。
这些假定底物的一个子集已被选择以作进一步评价。通过功能研究确定这些底物上甲基化的重要性，将有助于我们更好地理解CARM1作为转录共激活物的作用。
TAP/MS方法研究蛋白质复合物
该实验室采用串联亲和纯化（TAP）/质谱法的技术来研究蛋白质 - 蛋白质相互作用，并已生成的数字表达TAP标记的表观遗传调节的稳定细胞系的。这些稳定的线包括异位PRMT6，PRMT7，PHF20和TDRD3。
在这种方法中，标记的蛋白首先与IgG珠结合。结合的蛋白质复合物通过TEV酶对标签上的连接区域的消化释放出来。链霉亲和素珠用于第二轮结合。洗脱后，蛋白复合物可用于质谱鉴定。
化学抑制剂
作为酶功能的化学调节剂的小分子是探测蛋白质功能和用作治疗剂的有价值的工具。大多数甲基转移酶使用甲基供体s -腺苷- l-蛋氨酸(AdoMet)作为辅助因子。目前的甲基转移酶抑制剂显示有限的特异性，不区分地针对所有使用AdoMet的酶。贝德福德实验室设计并实现了一种高通量筛选，用于识别特异性抑制蛋白精氨酸n -甲基转移酶(PRMT)活性的小分子。通过这种方法，他们发现了一种先导化合物AMI-1，它可以抑制PRMT活性，但不抑制赖氨酸甲基转移酶。
与药物化学家实验室collabortes识别AMI-1类似物，将显示更好的特异性和细胞渗透性。该实验室也投资于鉴定的化合物，其结合到甲基结合蛋白结构域，我们期望的芳香笼，以确定将阻止依赖甲基蛋白质 - 蛋白质相互作用的化合物。