这些科学的“寻宝猎人”都在MD安德森的研究人员乐动体育LDsports中国生物信息学和计算生物学部。他们有耐心和知识来分析的信息山和定位,这将极大地为我们癌症的内部运作的了解有助于数据的一个珍贵的静脉。他们认为,“分子分析”可能是开发新疗法的母亲矿脉。
它们包括韩亮,博士,谁是自信的抗癌药物休止符的未来在很大程度上分子谱。这是一个技术,科学家用它来分析单个患者的肿瘤,以确定遗传特性和任何独特生物标志物。生物标志物是分子能够指示的病症或疾病的存在,并且越来越多地被用来测量身体如何响应治疗。
有在每个人的小区3个十亿DNA代码字母和32000个十亿个细胞在体内。因此,每个人都有96000个十亿十亿DNA密码字母。这是超过10倍,许多字母代码,因为在所有地球上海滩的沙粒。而那些代码字母中的任何一个的一个不幸的突变可引发癌症或使其对我们的药物产生耐药性。这决定了我们的挑战 - 我们的机会。
- 约翰·温斯坦,医学博士,博士,生物信息学和计算生物学的椅子
“通过从多种癌症类型分析数据,我们可以评估预测模型,并确定基因的改变,导致肿瘤的形成,”他说。“这不会是由只来自一个癌症类型看肿瘤数据获得的。”
伪(基因)科学和超星系团
梁光烈还带领努力学习离奇的假 - 这是普遍认为没有什么用处,因为它失去了蛋白质编码能力的基因的失配。他最近在自然通讯研究有特别表现。
从患者的七种癌症审查2800余个样品后,梁的结论是,在很大程度上忽略了假很可能帮助医学专家的新靶点发现新的生物标志物。这些标记将允许医生为患者个体既个性化的治疗和更好地使他们能够预测癌症的存活率。
像梁,Roeland Verhaak,博士,助理教授,在生物信息学和计算生物学的双重任命,基因组医学部门也进行了大规模的研究,比较基因是如何在12个肿瘤亚型表达。他的团队的工作,发表于癌基因今年八月,确定了共享类似疾病的途径和基因表达8癌症“超星”。
在他的研究中,Verhaak识别的一个特别大的超聚类癌症的,所有这些共同的遗传突变和表达,DNA的改变和增加的细胞增殖。在这个超星系团,在蛋白质的突变TP53拒绝让细胞死亡,即使他们有经验丰富的DNA损伤导致癌症的增长。TP53通常抑制肿瘤的生长。
设计数据分析
像许多MD安德森科学家从事解开癌症的蜂窝原因奥秘,Verhaak依赖于高科技的方法来理解信息的山路,累计的数据库,如癌症基因组图谱。
要过程和系统化,自动化的方式分析上如此大规模的数据,他和其他科学家开发出管道的RNA测序数据分析,或者PRADA - 由Verhaak的时尚精明的妻子建议的首字母缩写。
不像它的同名时尚,PRADA不涉及看中香水或异国情调的皮革处理。更确切地说,它涉及到一个软件程序,从基因表达水平提供的遗传信息多方面分析,以检测项仅一个科学家可以识别或是热衷,如基因内融合变体和同源性得分。
该软件已被广泛并成功用于通过癌症基因组图谱计划更好地了解大脑和肾癌。
生物信息学和计算生物学的椅子上,约翰·温斯坦,医学博士,博士,监管部门有许多部门和跨人MD安德森是合作。这包括戈登·米尔斯,医学博士,博士,主席系统生物学,劳伦拜尔斯,医学博士助理教授胸/头颈部肿瘤内科和张炜博士,教授病理,谁结合分子数据纳入其工作,以改善预后。中心如研究所个性化癌症治疗中心的靶向治疗和Kleberg中心的分子标记也注重这方面的研究。
温斯坦是众所周知,他在上世纪90年代的集群热图,标记过的一些作为早期推出的“后基因组时代的最常见的可视化图标”。
热图是在工作韦恩斯坦建成,同时担任美国国家癌症研究所,在那里他开发的被称为基于Web的生物信息学软件包的集合基因组学和信息学组组长完成“矿工套房。”
该集群热图图形允许调查人员了解复杂的数据和今天是一个常用的生物信息学软件工具。
温斯坦目前领导的一组是上发现的分子分析的最前沿。他的研究方法,为此他提出了“in乐动体育LDsports中国tegromic,”被描述为“部分实验,部分计算。”
温斯坦的研究小组使用超过两打的微阵列平台和其他技术来解读这被认为是导致癌症的细胞过程的纠结网络。当正确破译,这些过程可以提供用于预防和治疗令人兴奋的新选择。
内政部斯图尔特·尤德尔美国前国务卿曾经写道:“采矿就像是一个搜索和摧毁任务。”它们的许多MD安德森的同事一起 - - 科学研究人员,如梁,Verhaak和温斯坦的工作是非常多的我们的基因组成的精髓搜索任务。并在深入研究新的解决方案的遗传奥秘的深处有一天可能会破坏癌症剥夺了我们的我们的健康。