2018年11月12日
新一代测序技术支持了乳腺癌、前列腺癌和血癌的研究乐动体育LDsports中国
由Clayton R. Boldt,Ph.D.
MD Anderson的载人登月计划™成立,为世界级临床医生和研究人员带来的团队在一起,以便在临床中迅速推进科学发现,以节省患者的生命。乐动体育LDsports中国驾驶月亮镜头™的工作是10个乐动体育LDsports中国研究平台为该计划提供独特的专业知识,技术支持和新颖的基础设施注重13疾病计划。
其中一个平台是癌症基因组学实验室(CGL),这使得moonshots的研究人员能够快速分析遗传信乐动体育LDsports中国息,尽可能多地了解病人的肿瘤。CGL的科学经理Maggi Morgan与癌症前线分享了更多关于该平台的工作以及它是如何支持登月计划团队的。
问:你能描述一下CGL和它在登月计划中的工作吗?
答:CGL平台是一个下一代测序实验室,用于驱动生成癌症的分子基础的发现。我们向可能通知的临床研究人员提供数据乐动体育LDsports中国个性化治疗策略并且有可能对癌症的检测,管理和治疗产生重大影响。
CGL为所有moonshots团队提供高质量的测序服务。新一代测序是一种可以让研究人员发现可能与癌症进展有因果关系的重要功能突变、基因乐动体育LDsports中国和途径的工具。了解肿瘤如何生长、转移和进化的分子基础是至关重要的,因为这些发现可能为早期检测、个性化治疗和改善结果提供方法。到目前为止,我们已经对13次“月球探测”中的7500多个样本进行了测序,产生了40多篇经过同行评审的论文。
问:该平台对MD安德森终结癌症的使命有何贡献?
答:利用下一代测序技术,CGL提供了一个强大的系统性突变发现工具。例如,通过对治疗前后肿瘤的DNA进行测序,研究人员希望了解癌症是如何适应治疗的,以及可能对治疗产生耐药性的。乐动体育LDsports中国我们目前正在调查这个问题乳腺癌月亮拍摄™。
这就是CGL如何有助于揭示推动癌症生长和传播的潜在的分子异常。因此,我们提供了有价值的数据,可能会通知新的途径,以便有针对性的治疗,最终实现MD安德森患者的生命的重大改进。
问:平台的影响如何通过合作增强?
答:CGL与所有Moon Shots和多个平台合作,包括阿波罗(自适应的以病人为导向的纵向学习和优化)和特拉(翻译研究加速器)。乐动体育LDsports中国虽然CGL不直接提供分析服务,但我们与之合作生物信息学分析团队为了确保来自多个平台的数据适当地利用并存放到企业大数据仓库(EBDW)中。
我们的生物信息学团队开发了先进的分析工具,挖掘序列数据并将其转化为结果,供疾病现场团队进行下游分析。此外,所有Moon Shot™数据都存储在EBDW中,成为一种对患者和研究人员都有利的机构资源。乐动体育LDsports中国
问:你最引以为傲的项目或成就是什么?
答:我直接与疾病网站PI进行互动,以制定由月亮射击领导的审查和批准的提案;因此,我觉得与每个项目的个人联系。也就是说,有几个项目我想突出。
这HPV相关的癌症Moon Shot™表征罕见的HPV相关癌症,具有有限的治疗方案,特别是对于晚期疾病。该团队认为这是对这种癌症的全部全面分析,有可能揭示多种癌症基因促进肿瘤发育的涉及。目标是在2019年在美国临床肿瘤学会癌症癌症研讨会上提出结果。
这骨髓增生综合征和急性髓性白血病月亮射击™有一项关于不确定潜力克隆造血(CHIP)的研究,CHIP被定义为在一个或多个白血病相关基因中发现体细胞突变的恶性前状态。该团队和其他人的研究发现,CHIP患者患血液系统恶性肿瘤的风险更高,患治疗相关髓系肿瘤(t-MNs)的风险也更高。这项工作已经由Dr。Koichi Takahashi.和同事柳叶刀肿瘤学和血液进步。
下一步是使用这些发现,以鉴定患者,以特别高的发展T-MNS的风险,并制定减轻风险的策略。该团队正在提出10,000例患者的研究,以了解芯片的患病率和预后意义。
问:你认为5年后这个平台会是什么样子?
答:五年之内,我认为,我们将液体活检添加液体活检作为筛选早期癌症的标准程序,监测对治疗的反应,并帮助解释为什么有些癌症对治疗有抵抗力。目前,用于获得高质量测序数据的金标准是使用新鲜活检肿瘤组织,冷冻或福尔马林固定。然而,患者增加了风险和不适。从中有一种浪潮乐动体育LDsports中国前列腺癌月亮拍摄™例如,使用循环肿瘤DNA,这具有能够通过微创手段进行全肿瘤基因组特征。
问:月亮镜头计划如何使您的工作成为可能?
答:CGL的独特之处在于,我们与每一个登月计划互动,这是登月计划启动时所设想的多学科团队努力的缩影。我们的工作得益于登月计划,作为回报,我们提供了高质量的科学技术基础设施,从而支持和加快了疾病现场的研究工作。乐动体育LDsports中国此外,我们的平台生成的数据将用于推进moonshot团队的工作,并促进与其他平台团队的更多合作。例如,我们与乳腺癌登月计划的合作,为治疗靶点提供了有价值的见解,他们现在正在用共同临床试验中心。