2014年6月30日
癌症预后的挖掘分子数据
由Ron Gilmore.
任何一位患者在癌症治疗期间和之后的情况如何?这是一个很难回答的问题。
而是一个被称为癌症基因组图谱可以深入了解为什么结果在患者中不同。
地图集,一个项目国家癌症研究所和国家人类基因组研究所乐动体育LDsports中国他正在对各种癌症的基因组变化进行分类。该项目于2005年开始,目标是在2014年底完成20至25种癌症的基因组测序和分析。这样的分析将有助于更好地了解这种疾病的基础,并将帮助科学家诊断、治疗和预防癌症。
汉梁博士。,助理教授生物信息学与计算生物学在MD Anderson Cancer Center,认为,如此综合的“分子分析”可以有一天可以帮助确定可能对某些疗法抵抗或可能指导临床医生对每个患者独特的遗传造成的治疗策略来指导临床医生的患者。
梁先生对来自癌症基因组地图集的数据进行了多种制度研究,包括来自四种癌症类型的953种样品 - 肺,卵巢,脑和肾。
他说,这项研究的目标是解决来自癌症基因组图谱的分子数据如何以及在多大程度上影响癌症治疗。它揭示了分子谱分析虽然仍处于婴儿期,但最终可能为癌症患者的预后带来希望。
《自然生物技术》杂志6月份网络版上发表了一篇详细介绍他的发现的文章《评估肿瘤类型中癌症基因组和蛋白质组学数据的临床效用》。
专注于研究中检测的四种癌症,梁朝通过评估来自多种肿瘤的分子数据,单独或与患者年龄和肿瘤阶段的临床变量组合来预测患者存活的可能性。然后,他开发了一个开放式访问数据库,允许研究人员根据数据构建和评估癌症生存预测模型。乐动体育LDsports中国
“通过分析来自多种癌症类型的数据,我们能够评估预后模型并鉴定导致肿瘤形成的基因改变,”他说。“这是通过从一种癌症类型看肿瘤数据来获得的。”
通过组合分子数据和临床变量,梁观察了四种癌症中三种癌症预后的更好预测:肾,卵巢和肺。但是,他注意到需要进一步分析。
其他MD Anderson合作者包括戈登米尔斯,M.D.,Ph.D.系统生物学主席;Lauren Byers,M.D.,胸椎和颈部医学肿瘤学助理教授,以及John Weinstein,M.D.,Ph.D.,生物信息学和计算生物学的主席。其他参与机构包括贝勒医学院,波士顿大纳 - 巴士癌研究所,加州大学,圣克鲁斯,俄勒冈州波士顿大都市的马萨诸塞州综合医院,以及德克萨斯大学奥斯汀。
这项研究由美国国立卫生研究院(NIH)资助(CA143883), (CA175486), (CA016672);国家癌症研究所- md安德森癌症中心子宫孢子职业发展奖;以及由Michael & Susan Dell基金会资助的George S. Hogan遗产和Lorraine Dell生物信息学癌症药物个性化项目。