2016年5月11日,
检测单个癌细胞的DNA突变
由罗恩·吉尔摩
乐动体育LDsports中国MD安德森癌症中心的研究人员宣布了一种检测单个癌细胞DNA突变的新方法,与目前分析数百万细胞的技术相比。他们认为,这一进展可能在癌症诊断和治疗方面有重要应用。研究结果发表在4月18日的《科学》杂志网络版上自然方法。
现有的技术,被称为下一代测序(NGS),测量来自数百万个细胞的基因组,而较新的单细胞测序方法,被称为Monovar。由MD安德森研究人员开发的Monovar允许科学家乐动体育LDsports中国检查来自多个单细胞的数据。该研究部分由MD安德森公司资助载人登月计划这是一项旨在显著降低癌症死亡率的前所未有的努力。
“NGS技术极大地提高了我们对人类基因组及其在癌症等疾病中的变异的理解,”他说肯Chen博士。的助理教授生物信息学和计算生物学也是《自然方法》那篇文章的合著者。“然而,由于NGS测量大量细胞,组织样本中的基因组变异往往被掩盖。”
这导致了被称为单细胞测序(SCS)的新技术的发展,该技术对生物学的许多领域产生了重大影响,包括癌症研究、神经生物学、微生物学和免疫学,并极大地提高了对癌症中某些肿瘤特征的理解。乐动体育LDsports中国Monovar进一步改进了新的SCS的计算工具,科学家们发现这些工具“缺乏”,更准确地检测DNA组成的微小变化,即单核苷酸变异(SNVs)。
“为了改善SCS数据集中的snv,我们开发了Monovar,”他说尼古拉斯·纳文博士。的助理教授遗传学也是这篇论文的合著者。“Monovar是一种新的统计方法,能够利用多个单细胞的数据发现snv,并提供高度详细的遗传数据。”
Chen和Navin表示,Monovar将在癌症诊断和治疗、个性化医疗和产前遗传诊断等领域具有重要的转化应用,SNVs的准确检测对患者护理至关重要。
这种对现有技术的改进可以很好地推动除癌症以外的许多生物医学领域的研究。研究人员乐动体育LDsports中国认为,这是在SCS数据集中评估snv的一个重大进展,SCS数据集是各种疾病的关键信息。