“你是个搞统计的。你在医院里做什么?”
安德森大学流行病学系教授Sanjay Shete博士偶尔会回答这个问题。
他在这里,因为癌症的原因是复杂的,相互关联和埋藏在需要尖锐统计分析的数据中,以挖掘它们。
“我觉得统计学处于科学的前沿,”Shete说,“因为我们有很多因素在癌症风险中发挥作用:多种基因的影响,个人行为,如饮食、锻炼和吸烟,然后是肿瘤的基因构成。”你是如何将所有这些整合在一起的?”
它通过统计建模的行为和遗传因素来完成,以预测一个人的癌症风险,然后开发出现干预措施,以试图预防疾病。
“你不能改变一个人的基因组(遗传信息),所以干预很可能通过行为改变来实现,”Shete说。
GWAS寻找遗传因素
他是头颈癌全基因组关联研究(GWAS)的首席研究员。该项目分析了近1500名头颈部癌症患者的基因组,以发现增加癌症风险的遗传因素。
十五年前,基因组扫描可能会在基因组中的300个斑点分析。现在,刺伤和同事可以在每位患者中仔细审查660,000个单点变异。
如果说GWAS是遗传流行病学的应用工作,那么Shete的同事Paul Scheet博士,流行病学系的助理教授,更侧重于风险评估的基础研究方面。乐动体育LDsports中国
“要知道基因组中的不寻常,你需要知道什么是正常的,”Scheet说。
是什么成功的模特?
通过分析染色体的遗传学来了解遗传模式 - 如何随着时间的推移改变 - 一种成功的模型需要填充未直接观察到的染色体部分的基因型。
作为华盛顿大学的研究生,Scheet写了一份计算机程序,以估计缺少的基因型和染色体的部分被称为单倍型。该计划是他的博士论文,称为Fashphase,广泛用于染色体分析。
Scheet还从事特定疾病项目,在荷兰合作进行一项人类行为遗传学研究,其中包括对多动症、自闭症和精神分裂症等病症的分析。
在彼此相邻的办事处的Scheet和Shete开始了德克萨斯大学生物医学科学大学统计遗传学的课程,其中震护前往生物疗法和生物统计学中的计划。