研究表明,新的“驱动程序”,以评估癌症患者的生存和药敏

RNA编辑的事件另一种方式来探讨生物标志物和治疗靶点


MD安德森新闻发布10/01/2015

癌症专家长期以来一直在研究基因突变和DNA复制变化,以帮助预测患者的生存和药物敏感性。德克萨斯大学MD安德森癌症中心领导的一项研究为理解为什么有些人活得更久或对治疗反应更好的生物学原因——RNA编辑事件——开辟了另一条途径。

患者从癌症基因组图谱取17种不同类型的癌症的样品6226的评估揭示了新的信息有关的RNA编辑事件在肿瘤中相对于正常组织,并且提供的证据表明,RNA编辑可能选择性地影响药物的敏感性。RNA编辑是其中遗传信息的RNA分子中改变的过程。曾经以为在人类和其他脊椎动物罕见,RNA编辑是目前公认的人类基因组中广泛存在。

这项研究的结果发表在10月1日的《癌细胞》网络版上。

生物信息学和计算生物学副教授韩亮博士表示:“这些结果表明,RNA编辑是研究癌症机制、生物标记和治疗的一个令人兴奋的主题。”“在这项研究中,我们发现了相当数量的临床相关编辑事件,其中许多发生在非编码区。”

梁说,特定的RNA编辑过程,腺苷到肌苷(A-to-I),在人类基因组中是丰富的,但尚未深入研究。这项研究为这一鲜为人知的生物学现象提供了新的细节,可能具有重要的临床意义。

“如果一个蛋白只在高肿瘤蛋白在正常的蛋白质编辑,但没有,那么它可能是一个特定的药物可以用来抑制编辑的突变蛋白,”梁说。“以前的研究都集中在DNA突变,主要集中在RNA在正常组织编辑。RNA在人类癌症编辑的作用仅仅是开始从个体患者样本的这些早期研究中的几个癌症类型出现“。
在较大规模的癌症基因组图谱的研究提供了所需来改变蛋白质或RNA序列,其可以称为“驱动程序”用于预后生物标记物或治疗靶标起作用的信息。RNA编辑增加了另一层复杂性在寻求预测患者存活并建议新的治疗方法,梁光烈说。

MD安德森研究的参与者包括冷汉,博士,历下刁,博士,杨洋,博士,元元,博士,李骏博士和振林菊,博士,一切生物信息学和计算生物学的;Shuangxing Yu, M.D., Jie Li, Karina Eterovic, Ph.D., Lydia Cheung, Ph.D., Kang Jin Jeong, Ph.D., Yiling Lu, M.D. and Gordon Mills, M.D., Ph.D., Systems Biology; and Jason Roszik, Ph.D. and Scott Woodman, M.D., Ph.D., Melanoma Medical Oncology.

其他参与的机构包括:中国医科大学,沉阳市,中国;斯坦福大学,斯坦福大学,加州;在公共卫生学院休斯敦德州大学健康科学中心大学;Haukeland大学医院,挪威卑尔根;医药,休斯敦贝勒医学院;与孙中山大学,广州,中国。

这项研究是由美国国立卫生研究院(CA168394、CA098258 U24CA143883, R01CA175486, CA016672和R01GM102484),德州的癌症预防研究所(RP140462),珍妮·f·谢尔比奖学金基金,洛林戴尔计划在个性化的癌症医学生物信息学,阿德尔森医疗研究基金会和阿斯利康。乐动体育LDsports中国