同样的癌症，不同的时区
2014年7月30日，MD Anderson新闻发布
发现分子钟在肿瘤生长中的作用可能会影响乳腺癌的治疗
MD安德森新闻发布07/30/14
正如没有两个人拥有相同的基因组成，最近的一项研究表明，乳腺癌患者中没有两个单一的肿瘤细胞拥有相同的基因组。
事实上，根据德克萨斯大学休斯顿安德森癌症中心遗传学系助理教授尼古拉斯·纳温博士领导的一项研究，根据肿瘤细胞的不同，它们以截然不同的速度生长。该研究结果可能对乳腺癌的诊断和治疗具有重要意义。该研究还乐动体育LDsports中国可能有助于对抗乳腺癌患者化疗耐药性的发展。
纳温的研究结果发表在本周的《自然》杂志上，加深了人们对肿瘤“基因组多样性”的理解。对乳腺肿瘤的大组测序研究已经确定了许多普遍的突变，但对多样性的认识有限。Navin的团队开发了一种新的测序方法，称为nucl - seq，揭示了不同亚型的乳腺癌显示出不同的肿瘤多样性。
“我们发现两个不同的‘分子钟’在肿瘤生长的不同阶段运行，”Navin说。“来自三阴性乳腺癌的肿瘤细胞有更高的突变率，而来自雌激素受体阳性(ER+)乳腺癌的肿瘤细胞没有。”
大约75%的乳腺癌是雌激素受体阳性，并在雌激素的作用下增长。通常用激素疗法治疗。三阴性乳腺癌占所有乳腺癌的15%到25%，通常对激素治疗或标准化疗反应不佳。
Navin的团队开发了nucc - sec作为一种单细胞基因组测序方法，并将其应用于研究细胞突变如何在两种类型的乳腺癌中发生。结合单细胞分子测序，他们能够分析数千个细胞。
“在单细胞基因组学领域，一个常见的问题是无法验证在单个细胞中检测到的突变，”遗传学系博士后研究员、该研究的第一作者王勇博士说。“为了解决这个问题，我们结合了单细胞测序和靶向单分子深度测序。这种方法不仅验证了突变，还测量了数千个细胞的精确突变频率。”
化疗领域的一个重要问题是，耐药突变是否在肿瘤的罕见细胞中预先存在，还是在治疗后自发产生。
“尽管这个问题已经在细菌中研究了几十年，但在大多数人类癌症中仍然知之甚少，”Navin说。“我们的数据表明，大量不同的突变可能在化疗前就存在于肿瘤中。因此，我们预计，测量基因组多样性将对确定哪些患者将产生化疗耐药性具有预后价值。”
研究还表明，基因组多样性也可能在预测肿瘤侵袭、转移和患者低生存率方面具有有用的临床应用价值。
该研究的合作者包括Funda Meric-Bernstam，医学博士，癌症治疗研究部门的主席;韩亮，博士，助理教授，生物信息学与计算生物学;阿莎·穆尔塔尼，遗传学博士，助理教授;Paul Scheet博士，流行病学学系副教授;陈肯，博士，教授，生物信息学与计算生物学系;王勇，遗传学系博士后、博士。
这项研究的资金来源包括美国国立卫生研究院(National Institutes of Health, R21CA174397-01;TR000371;RO1CA172652;U24CA143883);美国国家癌症研究所(1R01CA169244-01;R01CA172652;CA016672;U54CA143798);Damon Runyon-Rachleff Innovator (DRR-25-13);T.C. Hsu和Alice-Reynolds Kleberg基金会; the Center for Genetics & Genomics; the Susan G. Komen for the Cure; the Dell Foundation; and the Cancer Prevention Research Institute of Texas.