茵茵元
部门转化的分子病理学、病理学实验室医学部门的Div
茵茵元
茵茵元教授博士和计算病理学研究项目主管部门转化的分子病理学。乐动体育LDsports中国元实验室的任务是设计impact-driven策略和人工智能(AI)引擎加速的应用人工智能和数据科学病理学。科学的重点在于解释肿瘤微环境如何塑造免疫逃避和耐药性的进化。她的团队正在开发尖端技术研究肿瘤微环境的空间异质性和形状癌症遗传异质性和临床结果。
率领的重点区域——定量分析和洞察力从成像和病理数据提取,数据科学研究所肿瘤,元博士致力于构建病理的计算基础设施和数据科学能力。这将使加速,严谨、科学能力和可操作的方法来构建数据病理转化的影响。愿景是创建一个新范式的技术进步和多学科收敛带路小说数字生物标志物,最终综合诊断的新边疆。
元获得计算机科学学位博士来自中国科学技术大学(科大,BSc)和华威大学(硕士和博士),并已赢得了声望的奖项和奖学金包括初级研究奖学金从沃尔夫森学院,剑桥大学和英国癌症研究职业设立奖学金。乐动体育LDsports中国从2012年到2022年,她领导了计算病理学和综合癌症研究基因组学研究所的团队,伦敦。乐动体育LDsports中国她建立了一个开创性的数字病理之间的接口,机器学习,与强大的临床应用和癌症生物学,被授予2021年计算病理学教授的头衔。她的团队目前领导在几个国际科学人工智能计算病理学的发展项目和财团包括癌症研究这份TRACERx肺肉瘤网络加速器,及早发现骨髓瘤,脑瘤奖Target-GBM, nih亚利桑那州癌症进化中心和乳房癌前阿特拉斯。乐动体育LDsports中国
教育和培训
授予学位教育
2009年 | 华威大学、华威、GBR博士,计算机科学 |
2004年 | 华威大学、华威、GBR女士,计算机科学 |
2003年 | 中国科技大学,中国,中文,b,计算机科学 |
体验和服务
学术任命
平移学系教授、分子病理学、病理分工/实验室医学、德克萨斯大学MD安德森癌症中心,休斯顿,TX, 2022年至今
癌症研究所的教授,伦敦,伦敦,2021 - 2022乐动体育LDsports中国
癌症研究所副教授,伦敦,伦敦,2017 - 2021乐动体育LDsports中国
癌症研究所助理教授,伦敦,伦敦,2012 - 2017乐动体育LDsports中国
行政任命/责任
同僚,关注领域# 1,数据科学研究所肿瘤,德克萨斯大学MD安德森癌症中心,休斯顿,TX, 2022年至今
计算病理学研究项目主任,德克萨斯大学MD安德森癌症中心,休斯顿,TX, 乐动体育LDsports中国2022年至今
荣誉和奖励
2016年 | 英国癌症研究中乐动体育LDsports中国心(CRUK)事业机构奖 |
选定的出版物
同行评议的文章
- Hagos YB, Akarca盟,拉姆齐,罗西RL, Pomplun年代,Ngai V, Moioli, Gianatti,麦克纳马拉C, Rambaldi, Quezada SA楔D, Gritti G,元Y, Marafioti T。高inter-follicular空间co-localization CD8 + FOXP3 + CD4 + CD8 +细胞在滤泡淋巴瘤预测有利的结果。内科杂志杂志40(4):541 - 553年,2022年。e-Pub 2022。PMID: 35451108。
- Pinard CJ,国际Immuno-Oncology生物标志物工作组,现在,Lu FI克莱因J, Oblak ML,萨尔加多R, Cardenas JCP, Brunetti B, Muscatello LV, Sarli G, Foschini MP, Hardas,卡斯蒂略SP,米尔阿卜杜勒贾巴尔K元Y,摩尔哒,Tran WT。在同伴动物比较评价肿瘤浸润淋巴细胞:Immuno-Oncology作为癌症治疗相关的转化模型。癌症(巴塞尔)14(20),2022年。e-Pub 2022。PMID: 36291791。
- Sobhani F, Muralidhar年代,Hamidinekoo,大厅啊,国王LM,标志着小,Maley C, Horlings嗯,黄,元Y。空间相互作用的组织缺氧和t细胞调节导管原位癌。NPJ乳腺癌8 (1):105、2022。e-Pub 2022。PMID: 36109587。
- Anklam E,巴尔MI,球R,乞求RD,科恩J, Fitzpatrick年代,吉拉德P, Halamoda-Kenzaoui B,辛顿D, Hirose, Hoeveler,本间M,豪M,石田年代,卡斯通用电气,小岛H, Krefting我Liachenko年代,刘Y,大师年代,马克思U,麦卡锡T,美世T,帕特里,Pelaez C, Pirmohamed M,广场建筑年代,里贝罗AJ,罗卓克斯合资,Rusyn我Salek RM,市检察院R,席尔瓦P,斯文森主持CN,萨姆纳,唱K, Tagle D, L通,通W, Eijnden-van-Raaij JVD,不同N,王T,沃特顿J,王M,温家宝H, Wishart D元Y,潮浦W。新兴技术及其对管理科学的影响。实验医学杂志(梅伍德)247 (1):1 - 75,2022。e-Pub 2021。PMID: 34783606。
- Sobhani F,罗宾逊R, Hamidinekoo Roxanis我Somaiah N元Y。人工智能和数字病理:对immuno-oncology机会和影响。Biochim Biophys Acta癌症1875 (2):188520、2021。e-Pub 2021。PMID: 33561505。
- Narayanan PL, Raza海,大厅啊,小标志,L,国王西RB,埃尔南德斯L, N孔雀鱼,Dowsett M, Gusterson B, Maley C,黄,元Y。揭露导管原位癌的免疫微生态学与深度学习。NPJ乳腺癌7 (1):2021。e-Pub 2021。PMID: 33649333。
- Pennycuick,特谢拉VH,米尔阿卜杜勒贾巴尔K, Raza海,隆德T, Akarca盟,罗森塔尔R, Kalinke L, Chandrasekharan DP, Pipinikas CP, Lee-Six H, Hynds再保险、高尔“,亨利司法院,米勒FR, Hagos YB, Denais C, Falzon M,摩尔哒,安东尼奥由于年代,Durrenberger PF, Furness AJ,卡罗尔B, Marceaux C, Asselin-Labat ML,拉尔森W,贝茨C, Coussens LM,克拉RM,乔治J, Swanton C, C一样,瑟尔威尔坎贝尔PJ, Marafioti T,元Y, Quezada SA印度N,琼斯SM。免疫监测在临床未扩散鳞状细胞肺癌的回归。癌症越是加大10(10):1489 - 1499年,2020年。e-Pub 2020。PMID: 32690541。
- 米尔阿卜杜勒贾巴尔K, Raza海,罗森塔尔R, Jamal-Hanjani M, Veeriah年代,Akarca,隆德T,摩尔哒,萨尔加多R,艾尔·巴克尔M,萨帕塔L, Hiley CT,官L,塞利诺M,史密斯CR,减量,Hackshaw, Marafioti T, Quezada SA印度N, Le Quesne J TRACERx财团,Swanton C,元Y。地理空间免疫变化了微分进化的肺腺癌。Nat地中海26(7):1054 - 1062年,2020年。e-Pub 2020。PMID: 32461698。
- Ghorani E,阅读杰,亨利司法院,厚重的先生,罗森塔尔R,取代V, Joshi K, Furness五角,本Aissa,赛SK, Ramskov年代,乔治奥,桑德兰MW,黄yn,木栅MV, W, Galvez-Cancino F,贝克尔PD, Uddin我,奥克斯T,伊斯梅尔M, Ronel博士T, Woolston, Jamal-Hanjani M, Veeriah年代,Birkbak新泽西,威尔逊GA, Litchfield K,康德L, Guerra-Assuncao是的,Blighe K, Biswas D,萨尔加多R,隆德T,巴克尔,摩尔哒,Hiley CT,减量,太阳Y, Y元,米尔阿卜杜勒贾巴尔K, Turajilic年代,写到J•T, Hadrup SR, Hackshaw, Peggs KS,印度N, B链TRACERx财团Swanton C, Quezada SA。T细胞分化格局是由肿瘤突变的肺癌。Nat癌症1(5):546 - 561年,2020年。e-Pub 2020。PMID: 32803172。
- Failmezger H, Muralidhar年代,Rullan,德安德烈CE、Sahai E,元Y。拓扑肿瘤图:一个基于空间模型来推断基质招聘黑色素瘤组织学的免疫抑制。80 (5):1199 - 1209,2020。e-Pub 2019。PMID: 31874858。
- 纳瓦兹年代,Trahearn NA, Heindl Banerjee年代,Maley CC, Sottoriva人民币,Y。肿瘤生态平衡的分析,将揭示卵巢癌的依赖资源的适应性策略。EBioMedicine 48:224 - 235, 2019。e-Pub 2019。PMID: 31648981。
- Heindl,斯塔克我,Naidoo K, Cuzick J, Dowsett M元Y。相关性免疫渗透预测风险的空间异质性ER +乳腺癌的内分泌治疗后复发。中华肿瘤杂志110 (2),2018。PMID: 28859291。
- Maley CC, Aktipis,格雷厄姆助教,Sottoriva, Boddy, Janiszewska M,席尔瓦,Gerlinger M元Y, Pienta KJ,安德森KS, Gatenby R, Swanton C, D小波,吴CI Schiffman JD,黄,波里亚克K,安德森ARA,布朗JS,油渣,柴田D。肿瘤的分类进化和生态特征。Nat牧师癌症17(10):605 - 619年,2017年。e-Pub 2017。PMID: 28912577。
- 元Y。肿瘤微环境的空间异质性。冷泉Harb教谕地中海6(8),2016年。e-Pub 2016。PMID: 27481837。
- Mardakheh颗,保罗,坎普,Sadok,帕特森H,麦卡锡,元Y,马歇尔CJ。全球mRNA分析、翻译、和蛋白质定位:当地的翻译是一个关键的调节的细胞突起。Dev细胞35(3):344 - 57,2015年。PMID: 26555054。
- 纳瓦兹年代,Heindl Koelble K元Y。超越免疫密度:关键作用的空间异质性雌激素受体阴性乳腺癌。国防部分册28(6):766 - 77年,2015年。e-Pub 2015。PMID: 25720324。
- 元Y。造型的空间异质性和分子关联三阴性乳腺癌淋巴细胞浸润。J R Soc接口12 (103),2015。PMID: 25505134。
- Worboys JD,辛克莱J,元Y, Jørgensen C。系统评价quantotypic肽人类激酶组进行有针对性的分析。Nat方法11 (10):1041 - 2014。e-Pub 2014。PMID: 25152083。
- 元Y, Failmezger H,埃达OM,阿里人力资源,伯爵年代,下巴科幻,施瓦兹射频,柯蒂斯C,邓宁MJ, Bardwell H,约翰逊N,柯南道尔,Turashvili G, E,普洛Aparicio年代,卡尔达斯C, Markowetz F。定量图像分析在乳腺肿瘤细胞的异质性补充基因组分析。Sci Transl地中海4 (157):157 ra143, 2012。PMID: 23100629。
- 柯蒂斯C,沙SP,下巴科幻,Turashvili G,埃达OM邓宁MJ,速度D,林奇AG) Samarajiwa年代,元Y,伯爵,Ha G, Haffari G, Bashashati,罗素R, McKinney年代,METABRIC集团Langerød,绿色,普洛E, Wishart G,花生米,沃森P, Markowetz F,墨菲L,埃利斯,Purushotham, Børresen-Dale, Brenton JD, Tavare年代,卡尔达斯C, Aparicio年代。2000乳腺肿瘤的基因组和转录组体系结构揭示了小说子组。自然486(7403):346 - 52岁,2012年。e-Pub 2012。PMID: 22522925。
- 元Y,柯蒂斯C,卡尔达斯C, Markowetz F。稀疏的监管网络的人类基因组基因表达揭示了假定的乳腺癌致癌基因。IEEE / ACM反式第一版杂志Bioinform 9 (4): 947 - 2012。PMID: 21788678。
- 元Y,野蛮RS, Markowetz F。针对病人的数据融合定义预后癌症亚型。公共科学图书馆第一版杂志7 (10):e1002227, 2011年。e-Pub 2011。PMID: 22028636。
- 元Y,李CT,威尔逊R。部分混合模型对聚类基因表达的时间进程。BMC生物信息学9:287,2008年。e-Pub 2008。PMID: 18564420。
格兰特&合同支持
标题: | 肺癌的进化 |
资金来源: | CRUK奖学金 |
角色: | 首席研究员 |
标题: | 提高新辅助治疗肉瘤 |
资金来源: | CRUK加速器 |
角色: | 首席研究员 |
标题: | 针对恶性胶质瘤的生物学的漏洞 |
资金来源: | CRUK程序 |
角色: | 首席研究员 |
标题: | 亚利桑那州癌症发展中心 |
资金来源: | NIH / CSBC |
角色: | 首席研究员 |
标题: | 多发性骨髓瘤的早期检测 |
资金来源: | CRUK程序 |
角色: | 首席研究员 |