文义王,博士。
生物信息学与计算生物学系,基础科学划分
关于王博士
王文义教授是一位大数据科学家,拥有统计学和生物学的学术背景。她的主要兴趣在于利用数据争论来理解癌症多组学产生的大数据。她的实验室的统计方法和工具开发是数据驱动的,并以解决重要和新颖的生物学问题为动力。
她的实验网站是:https://din.mdacc.tmc.edu/~ wwang7/.
目前职务及所属单位
主要约会
德克萨斯大学安德森癌症中心定量科学部生物信息学和计算生物学系教授
双/共同/兼职的约会
德克萨斯大学安德森癌症中心生物统计学系定量科学部教授
德州农工大学统计学系教授
乐动体育LDsports中国研究兴趣
实验室目前的主要研究重点是:乐动体育LDsports中国
1)利用转录组和基因组数据(基因组间数据)的计算反褶积,从大样本和单细胞测序数据获得肿瘤异质性和进化。我们的目标是了解a)肿瘤微环境可能导致预后或治疗反应的不同结果,b)正常组织中细胞-细胞相互作用的分子机制。
2)个性化癌症风险预测模型,使用TP53突变相关的Li-Fraumeni综合征作为疾病模型;和新颖的统计建模和研究设计,以进一步了解TP53突变的泛癌影响。
该实验室根据需要使用统计/计算工具箱,包括深度学习方法。我们目前的重点是高维数据中的混合建模和机器学习。
教育和培训
授予教育
2007年 | 约翰霍普金斯大学彭博公共卫生学院,美国巴尔的摩医学博士,生物统计学博士 |
2003年 | 哥伦比亚大学医师和外科医生,纽约,纽约,美国,马,人类营养 |
2001年 | 复旦大学生物学学士 |
体验和服务
行政任命/职责
招生委员会成员,gbs,休斯顿,德克萨斯州,2018 - 2020
定量科学计划联合主任,德克萨斯大学休斯顿,休斯顿,TX,2014 - 2018年生物医学科学研究生院
其他的约会/责任
大学成员,贝勒医学院定量计算生物学研究生课程,休斯顿,TX,2017 - 至今
选定的出版物
同行评议的文章
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- 王伟,王伟.利用逆矩先验对生存数据进行贝叶斯变量选择。北京大学学报(自然科学版),2019,37(2):417 - 418。e-Pub 2020。PMID: 33456641。
- McCarthy DJ,Rostom R,Huang Y,Kunz DJ,DaneCek P,Bonder MJ,Hagai T,Lyu R,Hipsci Consortium,Wang W,Gaffney DJ,Simons Bd,Stegle O,Teichmann SA.Cardelino:体细胞克隆子结构和单细胞转录om的计算集成。NAT方法17(4):414-421,2020。E-PUB 2020. PMID:32203388。
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- Wang Z, Kaseb AO, Amin HM, Hassan MM,王W.,莫里斯js..在无向图形模型中的贝叶斯边缘回归,以表征癌症中的介性异质性。贾斯卡。
- 安静,盛田,王伟*,袁勇*.利用二元共享参数模型对含有信息缺失数据的纵向二元数据进行贝叶斯分析。统计方法:962280217715051。e-Pub 2017。PMID: 28629259。
- nikooienejad a,王W.*,约翰逊已经*。.使用非局部前沿的高维基因组研究中二元成果的贝叶斯变量选择。生物信息学。e-Pub 2016。
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- 方,afshar pt,chibber a,mohiyuddin m,风扇y,mu j,gibeling g,bars,asadi nb,gerstein m,koboldt d,王W.,黄色,林H..一种使用SOMITALSEQ准确地检测SO-Matic突变的集合方法。基因组生物学。e-Pub 2015。
书章节
- 王W.,风扇Y,速度T. DNA变体呼叫目标测序数据。在:统计生物信息学的进步:高吞吐量的模型和综合推理。剑桥大学出版社:纽约,2013年。
补助金支持
标题: | TP53中系列种系突变癌症风险预测的统计方法和工具 |
资金来源: | NIH / NCI. |
角色: | 主要调查员 |
标题: | 神经视网膜的细胞图谱 |
资金来源: | Chan Zuckerberg倡议通过Subaward Bayly医学院 |
角色: | 共同主体调查员 |
标题: | 改进Li-Fraumeni综合征的风险预测:临床卫生保健提供者的实用工具 |
资金来源: | 德州癌症预防与研究所乐动体育LDsports中国 |
角色: | 共同主体调查员 |
标题: | 未分化甲状腺癌的肿瘤内异质性:对新辅助BRAF和免疫定向治疗反应的影响 |
资金来源: | 标志基金会 |
角色: | 共同主体调查员 |
标题: | 原发性和转移性结直肠癌亚克隆扩增和免疫环境特征的整合基因组分析 |
资金来源: | MD Anderson SPORE胃肠道癌症发展研究项目奖乐动体育LDsports中国 |
角色: | 主要调查员 |