Paul Scheet,Ph.D.
流行病学系,癌症预防和人口科学分工
关于Scheet博士
Paul Scheet,Ph.D.,德克萨斯州和德斯逊癌症中心大学流行病学系教授兼主席,并在部门联合任命。基因组医学与平移分子病理学。统计遗传学家患有复杂疾病和癌症基因组学的兴趣,Scheet博士作为MD Anderson的CCSG“风险,检测和结果”计划的领导者。
他领导或共同领导项目以发现胰腺癌的风险等位基因,并研究原发性肺癌转移的进化。近年来特别感兴趣的是检测在低帧内频率下存在的获得的染色体改变,例如当非均相混合物中的小比例细胞表现出这些突变。Scheet的实验室博士帮助先驱方法使用有关染色体上的遗传等位基因的信息来更准确地区分这些改变,即单倍型。在软件HaplOH中实施的这种技术具有癌症基因组学中的应用,早期检测癌症,以及暴露于致癌或衰老的正常或疾病预组织的分析。非空血栓组织(常规,野外癌症或令人健康)的谱可以帮助我们更好地理解在转化的转化中发生的临界分子变化,并利用这些突变作为癌症风险,进展或结果的生物标志物。
在获得生物学学士学位后,Scheet博士在圣路易斯华盛顿大学(Washington University in St. Louis)基因组中心(Genome Center)的人类基因组项目(Human Genome Project)工作,执行桑格测序和信息学。为了补充他在大规模遗传数据和人口遗传学方面的兴趣,他在统计学方面进行了研究,获得了硕士学位(爱荷华州,2000年)和博士学位(华盛顿,2006年),随后在密歇根大学获得博士后奖学金,2008年加入MD安德森。在华盛顿,他开发了一个统计模型,捕捉了一个群体的染色体系谱特征。该模型近似于已建立的“合并”模型的重要特征,但允许从大量参考数据中高效地推断重要特征,如单倍型和缺失基因型。这个模型的软件fastPHASE帮助引入了许多“归因图谱”方法,这些方法已经成为分析全基因组关联研究(GWAS)的标准实践的一部分。
成员德克萨斯大学MD安德森癌症中心UTHealth生物医学研究生院自2008年以来,Scheet博士辅导几个学生,以自己的博士学位的完成以及多家博士在GSBS并在德克萨斯医疗中心等机构委员会。
有关撰写软件的进一步信息可以在他身上找到实验室网站.
目前标题和隶属关系
主要的约会
德克萨斯大学休斯敦分校MD Anderson癌症中心,OVP,癌症预防和人口科学系,流行病学系教授
双/联合/辅助预约
德克萨斯大学生物医学科学研究生院成员,休斯顿,德克萨斯州
乐动体育LDsports中国研究兴趣
爱好:统计基因组学;遗传流行病学;遗传现象的计算方法
关键词:拷贝数变更;肿瘤的异质性;单;基因型污名;肺癌、结肠癌、皮肤癌、胰腺癌;DNA测序,SNP微阵列,rna测序,甲基化;早期检测;药物遗传学统计方法;相关数据;高通量基因组学
学科:人类遗传学、癌症基因组学、计算生物学、生物信息学、流行病学、人口科学
教育与培训
授予学位教育
2006年 | 华盛顿大学,西雅图,WA,美国,博士,统计 |
2000 | 爱荷华大学,爱荷华市,IA,美国,硕士,统计学 |
1995年 | 华盛顿大学,美国密苏里州圣路易斯,生物学学士 |
后训练
2006-2008 | 博士后,密歇根大学统计遗传学,安娜堡,MI |
经验与服务
学术任命
德克萨斯州德克萨斯州德克萨斯州安德森大学病理学/实验室医学司副教授,德克萨斯州和康森大学,休斯顿,TX,2016 - 2018年
行政任命/职责
计划领导者:风险,检测和结果;癌症中心支持赠款(P30:PISTERS),德克萨斯州德克萨斯大学安德森癌症中心,休斯顿,2017年 - 至今
德克萨斯大学休斯敦安德森癌症中心MDA10K科学主任,德克萨斯州,2016
机构委员会的活动
成员,CCSG执行委员会,2017年 - 至今
荣誉与奖励
2015年 | 德克萨斯大学杰出教学奖 |
2014年 | 被高度引用的研究人员(分子乐动体育LDsports中国生物学和遗传学),汤普森路透社 |
2006年 | C.W.科特曼奖,美国人类遗传学学会 |
专业的会员
AACR(。Assoc。癌症研究》)
成员,2012年至今
美国统计协会
成员,2011年至今
国际遗传流行病学学会
会员,2008年至今
美国人类遗传学学会
成员,2004年至今
数学科学研究所
会员,2000年 - 至今
选定的出版物
同行评审文章
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- 普罗科普恩科I,Langenberg的C,弗洛雷斯JC,Saxena先生R,Soranzo N,Thorleifsson G,路斯RJ,曼宁AK,杰克逊AU,Aulchenko Y,波特SC,鄂尔多斯MR,Sanna的S,Hottenga JJ,惠勒E,Kaakinen男,Lyssenko V陈WM,艾哈迈迪K,贝克曼JS,伯格曼RN,Bochud男,Bonnycastle LL,布坎南TA,曹A,塞维诺A,投币L,科林斯FS,Crisponi L,德赫斯EJ,Dehghan A,Deloukas P,多尼AS,埃利奥特P,Freimer N,Gateva V,赫德C,霍夫曼A,休斯TE,亨特S,Illig公司T,井上男,Isomaa B,约翰逊T,孔阿,Krestyaninova男,库希斯托Ĵ,Laakso男,廉N,林德布劳德ù,林德格伦阿CM,McCann的OT,Mohlke KL,莫里斯AD,Naitza S,Orrù男,帕尔默CN,Pouta A,兰德尔Ĵ,拉斯曼W,SaramiesĴ,Scheet P斯科特•LJ Scuteri,锋利的年代,Sijbrands E, Smit JH, K歌,Steinthorsdottir V,斯特林汉姆嗯,Tuomi T, Tuomilehto J, Uitterlinden AG)沃伊特BF, Waterworth D, Wichmann他Willemsen G, Witteman JC,元X,赵JH, Zeggini E, Schlessinger D, Sandhu M, Boomsma DI, Uda M,斯佩克特TD, Penninx BW, Altshuler D, Vollenweider P, Jarvelin先生,Lakatta E,Waeber G, Fox CS, Peltonen L, Groop LC, Mooser V, Cupples LA, Thorsteinsdottir U, Boehnke M, Barroso I, Van Duijn C, Dupuis J, Watanabe RM, Stefansson K, McCarthy MI, Wareham NJ, Meigs JB, Abecasis GR.MTNR1B的变异影响空腹血糖水平。Nat麝猫41(1):77 - 81。e-Pub 2008。PMID: 19060907。
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补助金支持
标题: | PAAR4Kids儿童抗癌药物研究的药物基因组学乐动体育LDsports中国 |
资金来源: | 圣裘德儿童医院 |
角色: | 校长Investigator-MDACC |
标题: | 人口基因组学和“次世代”的测序数据统计方法 |
资金来源: | nih / nhgri. |
角色: | 首席调查员 |
标题: | Sysic硬化和强直性脊柱炎HLA区域的结构 |
资金来源: | uthsc. |
角色: | 校长Investigator-MDACC |
标题: | 氨基酸取代和相互作用对脂质谱和冠心病发病的影响 |
资金来源: | NIH / NCI. |
角色: | 校长Investigator-MDACC |
标题: | 基因型归责的先进策略 |
资金来源: | 斯坦福大学 |
角色: | 校长Investigator-MDACC |
标题: | 鉴定PBC中常见和罕见的基因变体 |
资金来源: | 大学的回应 |
角色: | 校长Investigator-MDACC |
标题: | 下一代测序以鉴定新型结肠直肠癌基因 |
资金来源: | NIH / NCI. |
角色: | 共同调查员 |
标题: | 通过外显子组测序发现胰腺癌的风险位点和基因组学 |
资金来源: | NIH / NCI. |
角色: | 首席调查员 |
标题: | 使用紫外线诱导的表皮镶嵌性预测皮肤癌症风险 |
资金来源: | 邓肯家庭研究所种子基金研究计划拨款乐动体育LDsports中国 |
角色: | 首席调查员 |
标题: | 阐明癌前气道基因组在空间和时间上的进化 |
资金来源: | 德克萨斯州癌症预防研究所(Cprit)乐动体育LDsports中国 |
角色: | 首席调查员 |
标题: | 高通量测序鉴定新的黑色素瘤易感基因 |
资金来源: | NIH / NCI. |
角色: | 共同调查员 |
标题: | 发现作为卵巢癌易感因素的新型罕见变异 |
资金来源: | NIH / NCI. |
角色: | 共同调查员 |
标题: | 风险,检测和结果 |
资金来源: | NIH / NCI. |
角色: | 领袖 |
标题: | 肺癌的发病机制和早期进展-项目3:原发性肺肿瘤到淋巴结转移的演变 |
资金来源: | 德克萨斯州癌症预防研究所(Cprit)乐动体育LDsports中国 |
角色: | 首席研究员 |