尼迪萨尼
基础科学学部表观遗传学和分子癌变学系
目前标题和隶属关系
主要的约会
德克萨斯大学安德森癌症中心表观遗传学和分子致癌学系助理教授,史密斯维尔,德克萨斯州
双/联合/辅助预约
普通会员,在休斯敦,得克萨斯州休斯敦生物医学科学的得克萨斯大学研究生院
德克萨斯大学安德森癌症中心生物信息学和计算生物学系助理教授
教师会员,贝勒医学院,得克萨斯州休斯敦
乐动体育LDsports中国研究兴趣
我们的实验室专注于人类癌症的系统生物学,将高通量实验平台与大规模计算基因组学相结合,以解决现代个性化或精准医疗时代的基本问题。该实验室寻求对癌症异质性和免疫中潜在的遗传和表观遗传畸变的系统层次的理解。我们的目标是识别新的生物标志物和药物靶点,并通过将其转化为更有效的人类癌症预后和治疗来对癌症产生重大影响。
教育和培训
授予学位教育
2010 | 爱荷华州,爱荷华市,IA,美国大学博士,生物学 |
2005 | 新德里,IND,MS,生物科技大学 |
2004 | 德里大学,新德里,工业学士,微生物学 |
研究生培训
2010 - 2016 | 乐动体育LDsports中国哈佛医学院和Dana-Farber癌症研究所研究奖学金,波士顿,马萨诸塞州 |
经验与服务
学术任命
助理教授,系统生物学系,得克萨斯大学MD安德森癌症中心,休斯顿大学,TX,二○一六年至2018年
哈佛医学院和达纳法伯癌症研乐动体育LDsports中国究所博士后研究员,波士顿,马萨诸塞州,2010 - 2016
荣誉和奖励
2020 | 下一代之星,美国癌症研究协会乐动体育LDsports中国 |
2020 | Liz Tilberis早期职业奖,卵巢癌研究联盟乐动体育LDsports中国 |
2019 | 青年研究者奖,乳腺癌联盟 |
2019 | 美国国防部职业发展奖 |
2018 | 斯隆学者研究奖学金,阿尔弗雷乐动体育LDsports中国德·p·斯隆基金会 |
2017 | 尖峰研究奖乐动体育LDsports中国 |
2016 | CPRIT学者奖,德克萨斯癌症预防和研究所乐动体育LDsports中国 |
2016 | 德克萨斯大学系统之星奖 |
2013 | 范可尼贫血研究基金奖乐动体育LDsports中国 |
2012 | NHGRI基因组科学卓越中心旅行奖 |
2009 | 爱荷华州女性创新决赛 |
2008 | 真核细胞杰出青年研究者奖 |
2006 | 发展研究杂交瘤银行奖学金 |
专业的会员
欧洲人类遗传学学会
正式成员,2020年-至今
国际计算生物学学会
专业会员,2020年至今
美国科学促进会(AAAS)
白金会员,2020年至今
美国遗传学学会
正式成员,2020年-至今
美国人类遗传学学会
正式成员,2020年-至今
美国肝病研究协会
正式会员,2016年至今
美国细胞生物学学会
正式会员,2016年至今
美国癌症研究协会乐动体育LDsports中国
活跃会员,2016年至今
选定的出版物
同行评审文章
- 李Y,BURGMAN B,McGrail DJ,孙男,齐d,舒克拉SA,吴E,卡帕索A,林SY,吴CJ,埃克哈特SG,米尔斯GB,李B#,萨尼N #,易党卫军#.癌症中人类免疫组的整合基因组特征。癌症Res80(21):4854-4867,2020年电子酒吧2020 PMID:32855206(#共相应作者)。
- 刘晓东,孔威,Peterson CB, McGrail DJ, huang A, Zhang X, Lam T, Pilie PG, Zhu H, Beckermann KE, Haake SM, Isgandrova S, Martinez-Moczygemba M,撒拉尼N.,林西,Rathmell WK, Jonasch E.PBRM1缺失定义了肾癌中与检查点抑制剂耐药相关的非免疫原性肿瘤表型。Nat Commun11(1): 2135、2020。e-Pub 2020。PMID: 32358509。
- Daniels J, Doukas PG, Escala MEM, Ringbloom KG, Shih DJH, Yang J, Tegtmeyer K, Park J, Thomas JJ, Selli ME, Altunbulakli C, gothaman R, Mo SH, Jothishankar B, Pease DR, Pro B, Abdulla FR, Shea C,撒拉尼N.,格吕AA,皮尔斯BG,Louissaint A,吉塔特Ĵ,彩Ĵ.皮肤γ - δ T细胞淋巴瘤的细胞起源和遗传景观。Nat Commun11(1): 1806、2020。e-Pub 2020。PMID: 32286303。
- McGrail DJ#, Garnett J, Yin J, Dai H, Shih DJH, Lam TNA, Li Y, Sun C, Li Y, Schmandt R, Wu JY, Hu L, Liang Y, Peng G, Jonasch E, Menter D, Yates MS, Kopetz S, Lu KH, Broaddus R, Mills GB萨尼N #林SY#.蛋白质组不稳定性是错配修复缺陷癌症的治疗弱点。癌症细胞37(3):371-386.e12,2020年电子酒吧2020 PMID:32109374(#共相应作者)。
- Li Y, McGrail DJ, Xu J, Li J, Liu NN, Sun M, Lin R, Pancsa R, Zhang J, Lee JS, Wang H, Mills GB, Li X#, Yi S#,萨尼N #.优点:对RNA相互作用结构的突变效应进行系统分析和表征。肝脏病学70(2): 532 - 546年,2019年。e-Pub 2019。PMID: 30153342(#通讯作者)。
- Fang Y, McGrail DJ, Sun C, Labrie M, Chen X, Zhang D, Ju Z, Vellano CP, Lu Y, Li Y, Jeong KJ, Ding Z, Liang J, Wang SW, Dai H, Lee S,撒拉尼N.,梅尔卡多-乌里韦我,金TB,陈K,林SY,彭G,威斯汀SN,刘俊,奥康纳MJ,邑TA,米尔斯GB.与PARP和WEE1抑制剂序贯疗法毒性最小化,同时维持功效。癌症细胞35(6): 851 - 867。e7, 2019年。PMID: 31185210。
- 卢军,徐军,李军,潘涛,白静,王磊,金旭,林旭,张永#,李永#,萨尼N #李X#.瓦楞机:后生染色质监管机构的综合分子和功能特性。核酸Res46(19):10019-10033,2018年PMID:30102398(#共相应作者)。
- Ip CKM, Ng PKS, Jeong KJ, Shao SH, Ju Z, Leonard PG, Hua X, Vellano CP, Woessner R,撒拉尼N.斯科特KL,米尔斯GB.新形态的PDGFRA细胞外结构域驱动突变对PDGFRA靶向治疗具有耐药性。Nat Commun9(1): 4583、2018。e-Pub 2018。PMID: 30389923。
- McGrail DJ, Federico L, Li Y, Dai H, Lu Y, Mills GB, Yi S#, Lin SY#,萨尼N #.多组学分析揭示了复制数驱动的癌症中新抗原独立的免疫细胞浸润。Nat Commun9(1): 1317、2018。e-Pub 2018。PMID: 29615613(#通讯作者)。
- Ng PK,李J, Jeong KJ,邵年代,陈H,曾荫权YH,森古普塔年代,王Z, Bhavana VH, Tran R, Soewito年代,Minussi,莫雷诺D,香港K, Dogruluk T,卢H,高J, Tokheim C,周,约翰逊,曾庆红J, Ip CKM Ju Z,西风M, Yu年代,李Y, Vellano CP,舒尔茨N, Karchin R,丁L,陆Y,张轻型,陈K,肖KR, Meric-Bernstam F,斯科特•KL易#,萨尼N #,梁H#,米尔斯.在癌症的体细胞突变的系统功能注释。癌症细胞33(3): 450 - 462。e10, 2018年。PMID: 29533785(#共同通讯作者)。
- 李Y,李力,王Z,潘T,撒拉尼N.,金旭,王刚,李军,郑旭,张勇,徐杰,易胜,李晓霞.LncMAP:长链非编码rna介导的转录网络扰动的泛癌图谱。核酸Res46(3):1113至1123年,2018年PMID:29325141。
- 易小号#,刘NN,胡升,王H,萨尼N #.使用功能性variomics癌症突变的基本分辨率分层。NAT PROTOC.12(11): 2323 - 2341年,2017年。e-Pub 2017。PMID: 28981122(#通讯作者)。
- 李Y,萨尼N *, Pancsa R, McGrail DJ, Xu J, Hua X, Coulombe-Huntington J, Ryan M, Tychhon B, Sudhakar D, Hu L, Tyers M, Jiang X, Lin SY, Babu MM#, Yi S#.揭示癌症中广泛可变剪接干扰的决定因素。细胞代表21(3): 798 - 812年,2017年。*主要联系人及通讯作者;#共同通讯作者)。
- 郑超英,Khurana V,易S,撒拉尼N., Loh KH, Auluck PK, Baru V, Udeshi ND, Freyzon Y, Carr SA, Hill DE, Vidal M, Ting AY, Lindquist S.原位过氧化物酶标记和质谱将α -突触核蛋白直接连接到神经元内吞运输和mRNA代谢。细胞系统4(2):242-250.e4,2017年电子酒吧2017 PMID:28131823。
- Karras GI, Yi S,撒拉尼N.,费男,解Ĵ,维达尔男,D'安德烈AD,怀特塞尔L,林德基斯特小号.HSP90塑造了人类遗传变异的后果。细胞168(5):856-866.e12,2017年电子酒吧2017 PMID:28215707。
- Sun S, Yang F, Tan G, Costanzo M, oughtrred R, Hirschman J, Theesfeld CL, Bansal P,撒拉尼N., Yi S, Yu A, Tyagi T, Tie C, Hill DE, Vidal M, Andrews BJ, Boone C, Dolinski K, Roth FP.一组扩展的基于酵母的功能测定法的准确地识别人类疾病的突变。基因组Res26(5): 670 - 80年,2016年。e-Pub 2016。PMID: 26975778。
- Barrera LA, Vedenko A, Kurland JV, Rogers JM, Gisselbrecht SS, Rossin EJ, Woodard J, Mariani L, Kock KH, Inukai S, Siggers T, Shokri L, Gordân R,撒拉尼N., Cotsapas C, Hao T, Yi S, Kellis M, Daly MJ, Vidal M, Hill DE, Bulyk ML.对人类转录因子变异的调查揭示了普遍的DNA结合变化。科学351(6280): 1450 - 2016。e-Pub 2016。PMID: 27013732。
- Yang X, Coulombe-Huntington J, Kang S, Sheynkman GM, Hao T, Richardson A, Sun S, Yang F, Shen YA, Murray RR, Spirohn K, Begg BE, Duran-Frigola M, MacWilliams A, Pevzner SJ, Zhong Q, Trigg SA, Tam S, Ghamsari L,撒拉尼N., Yi S, Rodriguez MD, Balcha D, Tan G, Costanzo M, Andrews B, Boone C, Zhou XJ, Salehi-Ashtiani K, Charloteaux B, Chen AA, Calderwood MA, Aloy P, Roth FP, Hill DE, Iakoucheva LM, Xia Y, Vidal M.通过选择性剪接广泛扩展蛋白质相互作用能力。细胞164(4): 805 - 2016。PMID: 26871637。
- 撒拉尼N.易年代,Taipale M, Fuxman低音,Coulombe-Huntington J,杨F,彭J,为了J。卡拉GI,王Y, Kovacs IA, Kamburov, Krykbaeva我,林MH,塔克G, Khurana V,沙玛,刘YY, Yachie N,钟Q,沈Y, Palagi, san miguel A, C,粉丝Balcha D, Dricot,乔丹DM,沃尔什JM,沙AA,杨X, Stoyanova AK,雷顿,Calderwood妈,Jacob Y, Cusick ME, Salehi-Ashtiani K, Whitesell LJ, Sunyaev S, Berger B, Barabási AL, charlotte B, Hill DE, Hao T, Roth FP, Xia Y, Walhout AJM, Lindquist S, Vidal M.广泛大分子相互作用扰动人类遗传性疾病。细胞161(3): 647 - 2015。PMID: 25910212。
- Fuxman低音,撒拉尼N., Shrestha S, Garcia-Gonzalez A, Mori A, Bhat N, Yi S, Hill DE, Vidal M, Walhout AJM.人类基因中心的转录因子网络的增强和疾病的变种。细胞161(3):661-73,2015年PMID:25910213。
- Rolland T*, Tasan M*, Charloteaux B*, Pevzner SJ*,钟强*,萨尼N *,易S *,Lemmens I,Fontanillo C,莫斯卡R,Kamburov A,Ghiassian SD,羊X,Ghamsari L,Balcha d,贝格BE,布劳恩P,布雷默男,Broly MP,Carvunis AR,Convery-祖潘d,CorominasR,Coulombe-亨廷顿Ĵ,达恩E,德雷兹男,Dricot A,番C,Franzosa E,Gebreab女,Gutierrez的BJ,哈迪MF,金男,康S,基罗斯R,林GN,运气K,MacWilliams A,MencheĴ,默里RR,Palagi A,波林MM,Rambout X,RaslaĴ,赖克特P,Romero的V,Ruyssinck E,Sahalie JM,肖尔茨A,沙AA,夏尔马A,沉Y,Spirohn K,担S,特赫达AO,特里格SA,Twizere JC,织女星K,沃尔什Ĵ,库斯克ME,夏Y,BarabásiAL,Iakoucheva LM,Aloy P,代拉斯·里瓦斯Ĵ,尼埃Ĵ,考尔德伍德MA,山DE,郝T,罗斯FP,比达尔中号.人类互动组网络的蛋白质组比例图。细胞159(5): 1212 - 1226年,2014年。PMID: 25416956(*共同第一作者)。
- 作者简介:夏旭,Owen MS, Dricot A, Zack TI,撒拉尼N., Jacob Y, Hao T, McKinney KM, Clark AP, Reyon D, Tsai SQ, jung JK, Beroukhim R, Marto JA, Vidal M, Gaudet S, Hill DE, Livingston DM.系统筛选揭示了BRCA1在转录相关DNA损伤反应中的作用。基因开发28(17):1957至1975年,2014年PMID:25184681。
- Li Y, Burgman B, Khatri IS, Pentaparthi SR, Su Z, McGrail DJ, Li Y, Wu E, Eckhardt SG,萨尼N #,易党卫军#.E-MutPath:计算模型揭示了基因突变重新布线相互作用组学网络的功能景观。核酸Res.E-2020酒吧结论:33211847(#共同通讯作者)。
邀请的文章
- Li Y McGrail DJ, Latysheva N, Yi S#, Babu MM#,萨尼N #.信号网络中的通路扰动:基因型与表型的联系。Semin Cell Dev Biol99:3-11, 2020年。e-Pub 2018。PMID: 29738884(#通讯作者)。
- 李Y,McGrail DJ,徐军,米尔斯GB,萨尼N #,易#.基因调控网络的扰动由遗传和表观遗传变异。趋势生物化学科学43(8): 576 - 592年,2018年。e-Pub 2018。PMID: 29941230(#共同通讯作者)。
- 李毅,林胜,赵伟,米尔斯,萨尼N #.功能变异组学和网络扰动:在癌症中连接基因型和表型。Nat牧师麝猫18(7): 395 - 410年,2017年。e-Pub 2017。PMID: 28344341(#通讯作者)。
社论
- 易#,萨尼N #.Regulome网络和肝癌突变的景观:一个翔实路径精度药。肝脏病学66(1):280-282,2017年PMID:28422313(#corresponding作者)。
- 易胜,陈胜,张丽,撒拉尼N..信号转导与调控:对进化的洞察。生物医学RES诠释2016年8604245,2016年PMID:27525280。
授权与合同支持
标题: | 癌症基因组的系统的功能性variomics |
资金来源: | 德克萨斯州癌症预防研究所(Cprit)乐动体育LDsports中国 |
角色: | 首席研究员 |
标题: | 癌症基因组突变的功能分析和特征分析 |
资金来源: | 阿尔弗雷德·p·斯隆基金会 |
角色: | 首席研究员 |
标题: | 增强信号通路改变在肝癌发生中的作用 |
资金来源: | 美国协会为肝脏疾病的研究 |
角色: | 首席研究员 |
标题: | 新系统生物学方法解码可行动的靶点,以克服胃肠道癌症单药治疗的耐药性 |
资金来源: | 国防部(国防部) |
角色: | 首席研究员 |
标题: | 系统方法为在卵巢癌基于PARP-新颖组合疗法 |
资金来源: | 卵巢癌研究联盟乐动体育LDsports中国 |
角色: | 首席研究员 |
标题: | 癌症中致癌驱动因素畸变的综合生物信息学和功能特征 |
资金来源: | NIH / NCI |
角色: | 共同 |