来认识一下尼古拉斯·纳文博士。
尼古拉斯·纳文博士。
基础科学划分遗传学系
关于纳文博士
Navin博士是MD Anderson癌症中心的副教授，在生物信息学部门担任联合任命。他是德克萨斯大学MD安德森癌症中心uthehealth生物医学科学研究生院的教员。他还是CPRIT单细胞基因组中心(Single Core)的主任和MD Anderson的先进技术基因组核心(ATGC)的联合主任。
在Michael Wigler博士的指导下，他在冷泉港实验室进行了研究生训练和博士后训练。在此期间，他发明了第一种用于哺乳动物细胞基因组测序的单细胞DNA测序方法(single - nucleus - sequencing) (Navin et al. 2011, Nature.)。这项工作对建立单细胞基因组学领域起到了关键作用。Navin实验室继续走在单细胞癌症基因组学领域的前沿，他们在三阴性乳腺癌中发现了一个复制数进化的点状模型(Gao et al. 2016，Nature Genetics)，并阐明了乳腺癌进化中的角色突变表型和亚克隆突变(Wang et al. 2014, Nature)。
Navin博士的团队继续引领着单细胞DNA和RNA测序新技术的开发，以及分析大规模数据集的创新计算和统计方法。这些方法正在被应用于在侵袭、转移和治疗耐药性的背景下研究癌症进化。他的实验室与MD Anderson的顶尖肿瘤学家和病理学家密切合作，将这些技术转化为临床，在那里它们将对降低人类患者的发病率产生重大影响。
Navin博士的工作获得了许多声望很高的奖项，包括Damon-Runyon革新者奖、AAAS瓦赫特尔奖、ACS研究学者奖、Wilson Stone奖、Randall革新者奖和MD Anderson总裁研究卓越奖。乐动体育LDsports中国
访问Navin博士的实验室网站．查看的完整列表纳文博士的出版物．纳文博士,谷歌学术
目前职务及工作关系
主要约会
德克萨斯州德克萨斯州德克萨斯州安德森大学基础科学研究科学研究部副教授乐动体育LDsports中国
Cprit Currit Single Cell Genomics Center，德克萨斯州德克萨斯州德克萨斯州和德克萨斯群岛癌症中心基础科学研究系遗传学系乐动体育LDsports中国
德州大学安德森癌症中心基础科学研究部遗传学系高级技术基因组学核心副主任乐动体育LDsports中国
双/共同/兼职的约会
德克萨斯大学安德森癌症中心生物信息与计算生物学副教授
德克萨斯大学MD安德森癌症中心uthehealth生物医学科学研究生院副教授
乐动体育LDsports中国研究兴趣
单细胞基因组学;癌症演变;液体活检基因组学;计算生物学
我们的团队率先开发单细胞基因组测序技术，应用该技术了解人类癌症的复杂生物学过程，包括肿瘤起始、侵袭、转移和治疗耐药性。我们研究癌症是一个进化过程，在这个过程中，克隆体面对选择压力而经历选择和扩张。我们理解肿瘤是一个复杂的生态系统，它是由肿瘤细胞和基质细胞类型之间复杂的相互作用维持的。我们的任务是获得癌症进化的新知识，可以用来提高生活质量和降低癌症患者的发病率。在MD安德森，我们在将基因组技术应用于临床方面具有独特的地位，在癌症患者的早期检测、诊断和治疗策略方面将产生重大影响。
教育和培训
授予学位教育
| 2010 | 冷泉港实验室和石溪大学，冷泉港，纽约，美国，博士，分子遗传学 |
| 2003 | Skidmore学院，萨拉托加斯普林斯，美国，纽约，细胞生物学学士 |
研究生培训
| 2010-2011 | 博士后研究员，癌症遗传学，冷泉港实验室，冷泉港，纽约 |
体验和服务
学术任命
德州大学安德森癌症中心生物信息学与计算生物学助理教授，数量科学部，德克萨斯州休斯顿，2011 - 2016
德州大学安德森癌症中心遗传学助理教授，基础科学研究部，休斯顿，德克萨斯州，2011 - 2016乐动体育LDsports中国
2011 - 2016年，德克萨斯大学生物医学科学研究生院，德克萨斯大学MD安德森癌症中心助理教授
荣誉与奖励
| 2019 | 德州大学安德森癌症中心校长卓越研究奖乐动体育LDsports中国 |
| 2019 | BlavaTnik颁发生命科学，国家入围者 |
| 2018 | 德克萨斯大学安德森癌症中心教师教育奖 |
| 2018 | 德州大学安德森癌症中心基础研究达拉斯/沃斯堡传奇教员成就奖乐动体育LDsports中国 |
| 2017 | 兰德尔家族基金会颁发的杰克和贝弗利兰德尔癌症治疗卓越奖 |
| 2017 | 挑战奖，前列腺癌基础 |
| 2017 | 斯托尼布鲁克大学40岁以下青年奖 |
| 2016 | 总统德克萨斯大学德克萨斯大学安德森癌症中心学者奖 |
| 2016 | 沙宾奖学金、安德鲁沙宾家族基金 |
| 2016 | 美国癌症乐动体育LDsports中国协会研究学者 |
| 2016 | 德州大学安德森癌症中心校长表彰杰出教师 |
| 2016 | 德克萨斯大学安德森癌症中心教授学者奖 |
| 2015 | 美国科学促进会马丁和罗斯·瓦赫特尔奖 |
| 2014 | 德克萨斯大学安德森癌症中心教师教育奖 |
| 2013 | 徐道昌奖，青年研究员奖 |
| 2013 | 威尔逊S. Stone Memorial奖 |
| 2013 | 石奖，威尔逊石基金会 |
| 2013 | 达蒙-鲁尼恩创新者奖，达蒙-鲁尼恩拉克利夫基金会 |
| 2010 | 基因组技术杂志青年研究者奖 |
| 2009 | 美国国家癌症研究所NCI研究员 |
| 2009 | 亚伯拉罕奖，石溪大学 |
| 2008 | 石溪大学的金和米勒奖学金 |
| 2006 | 科学海报奖，分子遗传学研讨会，石溪，纽约 |
| 2005 | 林德赛-戈德堡奖学金，冷泉港实验室 |
选定的出版物
同行评议的文章
- 戴维斯A，高R，纳文N．SCOPIT：单细胞测序实验的样本大小计算。BMC BioInformatics 20（1）：566,2019。PMID：31718533。
- Zafar H, Navin N, Chen K, Nakhleh L．SICLONEFIT：来自单细胞基因组测序数据的肿瘤克隆人口结构，基因型和文学的贝叶斯推断。Genome Res（11）：1847-1859,2019。PMID：31628257。
- 王芳，梁绍峰，库马尔，纳文，陈凯．SCMarker:用于单细胞转录组分析的从头标记选择。PLoS compput bio15 (10):e1007445, 2019。PMID: 31658262。
- 玉米pg，heath ei，zurita a，ramesh n，xiao l，sei e，li-ning-tapia e，tu sm，sumudhi sk，王x，王x，efstathiou e，thompson tc，troncoso p，navin n，logothetisCJ，Aparicio Am．卡巴他杉醇加卡铂治疗转移性去雄抗性前列腺癌男性:一项随机、开放标签的1-2期试验。Lancet Oncol 20(10):1432-1443, 2019。PMID: 31515154。
- 张勇，熊森，刘斌，Pant V, Celii F, Chau G, Elizondo-Fraire AC, Yang P, You MJ, El-Naggar AK, Navin NE, Lozano G . [10．体细胞Trp53突变不同地驱动乳腺癌和转移的进化。Nat commen 9(1):3953, 2018。e-Pub 2018。PMID: 30262850。
- Kim C和Gao R, Sei E, Brandt R, Hartman J, Hatshek T, Crosetto N, Foukakis T和Navin N。．单细胞测序揭示的三阴性乳腺癌的化疗耐药进化。细胞173(4):879 - 893年,2018年。PMID: 29681456。
- Casasent AK, Schalck A, Gao R, Sei E, Long A, Pangburn W, Casasent T, Meric-Bernstam F, Edgerton ME, Navin NE．乳腺肿瘤多克隆侵袭性的地形图单细胞测序。细胞172(2):205 - 217年,2018年。PMID: 29307488。
- 梁茂林，Davis A, Gao R, Casasent A, Wang Y, Sei E, Vilar E, Maru D, Kopetz, Navin, N．单细胞DNA测序揭示了转移性结直肠癌晚期扩散模型。基因组研究27(8):1287-1299,2017。PMID: 28546418。
- Gao R, Davis A, McDonald TO, Sei E, Shi X, Wang Y, Tsai PC, Casasent A, Waters J, Zhang H, Meric-Bernstam F, Michor F, Navin NE．三重阴性乳腺癌的标点拷贝数演化与克隆瘀滞。NAT Genet 48（10）：2016年1119-30. E-PUB 2016. PMID：27526321。
- Mann KM, Newberg JY, Black MA, Jones DJ, Amaya-Manzanares F, Guzman-Rojas L, Kodama T, Ward JM, Rust AG, van der Weyden L, Yew CC, Waters JL, Leung ML, Rogers K, Rogers SM, McNoe LA, Selvanesan L, Navin N, Jenkins NA, Copeland NG, Mann MB．用SBCapSeq分析单个髓系白血病细胞的肿瘤异质性和驱动基因。自然生物技术34(9):962-72,2016。PMID: 27479497。
- Zafar H，Wang Y，Nakhlem L，Navin N，Chen K.．单核：单细胞中的单核苷酸变体检测。自然方法，2016. PMID：27088313。
- 梁明林，王勇，金诚，高瑞，蒋杰，塞恩，纳文东北．从单一核的高度复用靶向DNA测序。NAT PROTOC 11（2）：214-35,2016。E-PUB 2016. PMID：26741407。
- 梁m，王y，waters j，navin n．单核外显子组测序。基因组生物学25(16):55,2015。PMID: 25853327。
- 王永强，王永强，王永强，王永强，王永强，王永强．Ploidy-Seq:通过多倍体肿瘤亚群测序推断突变年代。基因组医学7(1):6,2015。PMID: 25729435。
- 王颖，Waters J, Unruh A, Roh W, Shi X, Chen K, Scheet P, Vattathil S, Liang H, Multani A, Zhang H, Zhao R, Michor F, Meric-Bernstam F, Navin NE。．单核基因组测序揭示乳腺癌的克隆演变。自然512（7513）：2014年155-60,2014. PMID：25079324。
- Baslan T, Kendall J, Troge J, stesteansky A, Wigler M, Navin N, Hicks J．单细胞的基因组拷贝数分析。自然协议7（6）：1024-41,2012。PMID：22555242。
- Navin N、Kendall J、Troge J、Rodgers L、Cook K、stesteansky A、Levy D、Lee Y、Esposito D、Muthuswamy L、Hicks J、Wigler M．单细胞测序推断肿瘤进化。自然7(472):90 - 2011。PMID: 21399628。
- Malihi PD, Graf RP, Rodriguez A, Ramesh N, Lee J, Sutton R, Jiles R, Ruiz Velasco C, Sei E, Kolatkar A, Logothetis C, Navin NE, Corn P, Aparicio AM, Dittamore R, Hicks J, Kuhn P, Zurita AJ．单细胞循环肿瘤细胞分析显示基因组不稳定性是侵袭性前列腺癌的一个显著特征。Clin Cancer res e-Pub 2020。PMID: 32341031。
邀请的文章
- 王莹，王永平，王永平．单细胞测序技术进展及应用。Molecular Cell 58(4):598-609, 2015。PMID: 26000845。
补助金支持
| 标题: | 集成单细胞基因组学核心设施 |
| 资金来源: | 德州癌症防治研究所乐动体育LDsports中国 |
| 角色： | 首席研究员 |
| 标题: | 用单细胞测序研究TNBC乳腺癌患者的化疗耐药演化 |
| 资金来源: | 莱夫科夫斯基基础 |
| 角色： | 首席研究员 |
| 标题: | 转移性乳腺癌和前列腺癌组学和多维空间图谱(OMS图谱) |
| 资金来源: | NIH / NCI |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | 使用新的测序技术表征癌症基因组不稳定性和平移影响 |
| 资金来源: | 德州癌症防治研究所乐动体育LDsports中国 |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | 研究TNBC的突变进化和肿瘤内异质性 |
| 资金来源: | 美国癌症协会(ACS) |
| 角色： | 首席研究员 |
| 标题: | 立即防止导管癌患者侵入性过度处理 - 精度 |
| 资金来源: | 英国癌症研究中乐动体育LDsports中国心 |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | LC170171小细胞肺癌(SCLC)的肿瘤异质性和治疗耐药性 |
| 资金来源: | 国防部(DOD) |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | 乳腺癌月球照片 |
| 资金来源: | UTMDACC登月计划 |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | 前列腺癌月球探测器 |
| 资金来源: | UTMDACC登月计划 |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | AML / MDS登月计划 |
| 资金来源: | UTMDACC登月计划 |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | 通过EGLN抑制转化肠道放射反应，从而改善不可切征胰腺癌的临床结果 |
| 资金来源: | NIH / NCI |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | 利用单细胞基因组学划定乳腺癌抗患者对患者的抗性的演变 |
| 资金来源: | 姐妹机构网络基金，UTMDACC |
| 角色： | 首席研究员 |
| 标题: | 转移性乳腺癌患者治疗耐药性的空间组学分析 |
| 资金来源: | NIH / NCI |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | 人类乳腺细胞图谱种子网络 |
| 资金来源: | 陈扎克伯格倡议 |
| 角色： | 协调pi. |
| 标题: | 用单细胞基因组学划定多器官转移中多器官转移的演变 |
| 资金来源: | 埃默森集体基金，UTMDACC |
| 角色： | 首席研究员 |
| 标题: | 用单细胞基因组学描述乳腺癌化疗耐药性的进化和生态 |
| 资金来源: | NIH / NCI |
| 角色： | 首席研究员 |
| 标题: | 利用空间单细胞基因组学研究乳腺癌前期的肿瘤起始和侵袭 |
| 资金来源: | NIH / NCI |
| 角色： | 首席研究员 |