约翰·a·泰纳博士。
分子和细胞肿瘤学部门,部门副总裁,研究乐动体育LDsports中国
现在的标题和归属
主要的约会
教授,分子和细胞肿瘤学部门,分工基础科学研究,德克萨斯大学MD安德森癌症中心,休斯顿,德克萨斯州乐动体育LDsports中国
乐动体育LDsports中国研究兴趣
我整合生物物理学和生物化学,帮助解决相关医学和生物技术的挑战。我努力描述高分子复合物包括构象和交互控制生物从力学上看结果告知癌症生物学和治疗策略。我的团队通过开发和采用多学科的生物物理方法与生物合作加入结构生物学。重要的是,我的项目通知以及融合彼此,所以我们更能够成功地和有效地了解大分子复合物在细胞和人类和道路交叉口的影响结果。除了假说驱动的研究,我的实验室开发先进技术来消除这种乐动体育LDsports中国差异从分子结构到定量,预测细胞生物学:我们通过创建、测试和提供技术见解对动态影响生物大分子构象和交互结果包括基于结构的设计和microbially-inspired挑战人类健康的解决方案。
我开发资助项目,结构生物学关注医疗相关的挑战,比如我的DNA修复结构生物学(SBDR) NCI计划项目。我RO1实验室项目中心细胞应激反应(DNA修复影响基因组完整性和肿瘤发生,活性氧监管机构、发病因素,近年,RNA,加酶和抑制剂的设计)。我的研乐动体育LDsports中国究和培训包括先进的方法开发技术定义复合物和溶液中的构象和高分辨率。我设计、构建和运行同步加速器beamline女预言家在先进的光源(ALS)集成小角x射线散射(粉煤灰)和高分辨率的晶体结构预测生物学——看到www.bl1231.als.lbl.gov。女预言家了~ 1200用户在过去的5年,> 15日前组。
我们的工作在结构生物学和一枝包括引入新的方程分析x射线散射数据柔性大分子复合物。我们引入了一个新颖的一枝不变,Porod不变的60年前以来的首次发现。此外,我们开发新的指标来准确的结构、构象和组件的解决方案。我们分析更好地评估的灵活性,提供参数测量分子间距离和数据模型协议,减少假阳性,定义分辨率。
我女预言家设施建造和运行(由我和迈诺斯IDAT项目)支持高效的开发和测试技术的进展和在描述蛋白质相互作用,复合物,在溶液中构象和高分辨率。这些资源支持我们日益增长的利益解决方案和单晶的方法应用到基于结构的抑制剂设计与开发化学淘汰赛中补充基因淘汰赛,以及最终的疗法。基础研究和技术进步之间的协同作用是允许我们为基本知识乐动体育LDsports中国和进步与人类疾病相关。
总的来说,我的小组的研究和技术开发旨在弥乐动体育LDsports中国合差距从分子结构到定量,机械,和预测生物细胞生物学。我认为这是细胞生物学的时代与测序进展和系统生物学开放游戏对抗人类疾病变化的贡献和应用生物技术。缺失的元素需要当前的科学贡献更强大的机械的理解在分子水平上,利用序列信息和提供了一个自下而上的客观定量和预测知识与系统生物学。因此,我的目标是开发工具和技术来解决生物学大挑战,和连接动态结构生物的结果。我运用合成生物学和抑制剂设计更多地了解生物系统如何工作,并为医学和纳米技术开发有用的代理。利用我的项目战略合作的努力,我的目标是帮助应用这些进展为病机、治疗退化性疾病和癌症,在人类和生物技术用于可持续健康。
教育和培训
授予学位教育
| 1982年 | 美国杜克大学、杜伦大学、数控,博士,生物化学和结构生物学 |
| 1974年 | 三一学院的艺术与科学,杜克大学,杜伦大学,数控、美国、BA、动物学、人类学 |
研究生培训
| 1982 - 1984 | 结构生物学博士后,斯克里普斯研究所,拉霍亚,CA乐动体育LDsports中国 |
体验和服务
学术任命
客座教授,生命科学分工,加州大学劳伦斯伯克利国家实验室,加州大学伯克利分校,2000 - 2009
教授,斯克里普斯研究所,拉霍亚,CA, 199乐动体育LDsports中国4 - 2015
行政任命/责任
导演,集成衍射分析技术计划的部门,加州大学劳伦斯伯克利国家实验室,伯克利分校,2004年至今
导演,加州大学劳伦斯伯克利国家实验室,伯克利分校,2001年至今
导演,加州大学劳伦斯伯克利国家实验室,伯克利分校,2000年至今
化学生物学研究所主任Skaggs斯克里普斯研究所,拉霍亚,CA, 1996年至今乐动体育LDsports中国
赋予职位
罗伯特·韦尔奇,基础科学研究的部门,德克萨斯大学MD安德森癌症中心,休斯顿,TX, 2乐动体育LDsports中国015年至今
选定的出版物
同行评议的文章
- Berroyer, Bacolla,锡箔JA,金正日N。我Cleavage-defective拓扑异构酶突变体大幅增加G-quadruplex-associated基因组不稳定。活细胞9 (3):52 - 68,2022。e-Pub 2022。PMID: 35291312。
- 哈梅尔M,锡箔农协。x射线散射显示无序链接器和动态界面复合物和DNA双链断裂修复机制影响细胞和癌症生物学。蛋白质科学30(9):1735 - 1756年,2021年。e-Pub 2021。PMID: 34056803。
- 哈梅尔M,罗森博格DJ, Bierma J, Hura GL,塔帕尔R, Lees-Miller SP,锡箔农协。可视化功能的动态性依赖dna的蛋白激酶全酶dna - pk的复杂与低温电子显微镜通过集成一枝。学监Biophys s0079杂志- 6107 (20):30091 - 2021。e-Pub 2020。PMID: 32966823。
- Brosey CA, Houl JH Katsonis P Balapiti-Modarage滤波器,Bommagani年代,Arvai, Moiani D, Bacolla,链接T,监狱长LS, Lichtarge O,琼斯DE,艾哈迈德Z,锡箔农协。针对SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain结构的见解从人类聚(ADP-ribose) glycohydrolase与抑制剂(PARG)结构。学监Biophys 163:171杂志- 186年,2021年。e-Pub 2021。PMID: 33636189。
- 许你们Z,年代,Y, Bacolla,赛义德·A, Moiani D,蔡CL,沈问,彭G,伦纳德PG,琼斯DE,王B,锡箔是的,艾哈迈德Z。MRE11 GRB2执行homology-directed修复启动。Sci副词7(32),2021年。e-Pub 2021。PMID: 34348893。
- Hambarde年代,蔡CL, Pandita RK, Bacolla, Maitra,查拉卡V,亨特CR, Kumar R,地狱啊,Le Meur R, Chazin WJ, Tsutakawa SE,罗素P, Schlacher K, Pandita TK,锡箔农协。EXO5-DNA结构和BLM交互直接DNA切除ATR-dependent复制重新启动的关键。摩尔细胞81 (14):2989 - 3006。e9, 2021年。e-Pub 2021。PMID: 34197737。
- 周J, Gelot C, Pantelidou C,李,Yucel H,戴维斯再保险,Farkkila, Kochupurakkal B,赛义德,夏皮罗GI,锡箔是的,布拉格BSJ Ceccaldi R D 'Andrea广告。θfirst-in-class聚合酶抑制剂选择性目标Homologous-Recombination-Deficient肿瘤。Nat癌症2(6):598 - 610年,2021年。e-Pub 2021。PMID: 34179826。
- 杨Bacolla,森古普塔年代,Z, C, Mitra J, De-Paula RB,对冲基金ML,艾哈迈德Z,莫特M,库珀DN,密特拉,锡箔农协。氧化DNA的遗传模式基本修复恰逢pre-targeting修复复合物的开放的染色质。核酸Res 49(1): 221 - 243年,2021年。PMID: 33300026。
- 你们Z, Y, Lees-Miller SP,锡箔农协。功能和DNA损伤反应免疫的分子机制和癌症免疫疗法。前面Immunol 12:797880, 2021年。e-Pub 2021。PMID: 34970273。
- Tsutakawa SE, Bacolla Katsonis P会,哈姆丹SM, Lichtarge O,泰纳杰,蔡CL。解码癌症变异意义不明的Helicase-Nuclease-RPA复合物编排在转录和复制DNA修复。前摩尔Biosci 8:791792, 2021年。e-Pub 2021。PMID: 34966786。
- Moiani D、链接TM Brosey CA, Katsonis P, Lichtarge O,金正日Y, Joachimiak,马Z,金正日本土知识,艾哈迈德Z,琼斯DE, Tsutakawa SE,锡箔农协。高效的化学检测方法,基于结构的核酸酶抑制剂针对DNA修复合成界面和SARS CoV-2。方法Enzymol 661:407 - 431, 2021。e-Pub 2021。PMID: 34776222。
- 塔帕尔R,王杰哈梅尔M R,梁K,太阳C, Hnizda,梁年代,胃党卫军,李L,比利亚雷亚尔H, Forrester我,方年代,蔡女士,Blundell TL,戴维斯AJ,林C, Lees-Miller SP,击球TR,锡箔农协。有效的机制由长非编码RNA双链断裂修复。核酸Res 48(19): 10953 - 10972年,2020年。PMID: 33045735。
- 侯J,赵R,夏W,常连续波,你Y,许JM,聂L,陈Y,王YC,刘C,王WJ,吴Y,柯B,许莱托,黄K, Z,杨Y,夏X, Y,李娜连续波,邵B,锡箔是的,挂MC。PD-L1-mediated gasdermin C表达式开关pyroptosis癌细胞和促进肿瘤细胞凋亡坏死。Nat细胞杂志22(10):1264 - 1275年,2020年。e-Pub 2020。PMID: 32929201。
- 你们王Eckelmann BJ, Bacolla A, H, Z,格雷罗州,江W, El-Zein R,对冲基金ML, Tomkinson AE,锡箔是的,密特拉。XRCC1促进复制重启,新生的叉退化和诱变在BRCA2-deficient细胞DNA修复。NAR癌症2 (3):zcaa013, 2020年。e-Pub 2020。PMID: 32776008。
- Tsutakawa SE,衬衣啊,Ng C, Arvai,胫骨DS, Shih B,江年代,Thwin AC,蔡女士,Willcox, MZ, Trego KS, Raetz AG)、罗森博格D, Bacolla,哈梅尔M,格里菲斯JD,库珀PK,锡箔JA。人类XPG核酸酶结构、装配和活动与见解神经退化和癌症的致病突变。《美国国家科学院刊年代117(25):14127 - 14138年,2020年。e-Pub 2020。PMID: 32522879。
- Houl JH, Z, Brosey CA, Balapiti-Modarage滤波器,Namjoshi年代,Bacolla, Laverty D,沃克提单,Pourfarjam Y,监狱长LS,先生Chinnam N, Moiani D,斯蒂拉,陈可挂MC,内格尔ZD, Ellenberger T,金正日本土知识,琼斯DE,艾哈迈德Z,锡箔JA。选择性小分子PARG抑制剂导致复制叉停滞和癌症细胞死亡。Nat Commun(1):5654,2019。e-Pub 2019。PMID: 31827085。
- 柴田,Moiani D, Arvai,佩里J,哈丁SM, Genois MM, Maity R, van Rossum-Fikkert年代,Kertokalio, Romoli F,伊斯梅尔,Ismalaj E, Petricci E,尼尔乔丹,布里斯托RG,马森司法院,Wyman C, Jeggo PA,锡箔JA。DNA双链断裂修复途径的选择是由不同MRE11核酸酶的活动。摩尔细胞53(1):7日至18日,2014年。e-Pub 2013。PMID: 24316220。
- 兰博RP,锡箔JA。准确评估的质量,由小角度散射模型和决议。自然496(7446):477 - 81年,2013年。PMID: 23619693。
- 肖段元X, Y, Y,太阳K,气Y, Y,艾哈迈德·Z Moiani D,姚明J,李H,张L, Yuzhalin AE,李P,张C, Badu-Nkansah,齐藤Y,刘X,郭西城,应H,太阳SC, Chang JC,锡箔是的,余D。维生素E能提高癌症免疫疗法重振树突细胞通过针对SHP1检查站。癌症。e-Pub 2022。PMID: 35420681。
格兰特&合同支持
| 标题: | DNA修复机器结构细胞生物学(SBDR) |
| 资金来源: | NIH / NCI |
| 角色: | 项目领导人 |
| 标题: | 迈诺斯(核酸大分子见解优化散射) |
| 资金来源: | NIH /美国 |
| 角色: | 首席研究员 |
| 标题: | Mre11 / Rad50 Nbs1结构生物学的DNA损伤反应 |
| 资金来源: | NIH / NCI |
| 角色: | 首席研究员 |
| 标题: | 结构生物学XPB和XPD解旋 |
| 资金来源: | NIH / NCI |
| 角色: | 首席研究员 |
| 标题: | 结构生物化学的DNA脱烷基化作用 |
| 资金来源: | NIH / NCI |
| 角色: | 首席研究员 |
| 标题: | IDAT -集成衍射分析技术 |
| 资金来源: | 能源部门 |
| 角色: | 首席研究员 |
| 标题: | 结构生物化学的DNA碱基切除修复 |
| 资金来源: | NIH /美国 |
| 角色: | 首席研究员 |
| 标题: | Fen-1复合物和人类基因组的稳定 |
| 资金来源: | NIH / NCI |
| 角色: | 首席研究员 |
| 标题: | 超氧化物歧化酶结构和卢伽雷氏症 |
| 资金来源: | NIH /美国 |
| 角色: | 首席研究员 |
| 标题: | IV型菌毛和相关系统 |
| 资金来源: | NIH / NIAID |
| 角色: | 首席研究员 |
| 标题: | DNA修复抑制剂癌症研究和翻译乐动体育LDsports中国 |
| 资金来源: | 癌症预防与得克萨斯研究所(CPRIT)乐动体育LDsports中国 |
| 角色: | 首席研究员 |
| 标题: | 保利(ADP-RIBOSE)代谢的药理调制 |
| 资金来源: | NIH / NCI |
| 角色: | 共同 |