来认识一下尼古拉斯·纳文博士。

尼古拉斯·纳文博士。
基础科学划分遗传学系
关于纳文博士
Navin博士是MD Anderson癌症中心的副教授,在生物信息学部门担任联合任命。他是德克萨斯大学MD安德森癌症中心uthehealth生物医学科学研究生院的教员。他还是CPRIT单细胞基因组中心(Single Core)的主任和MD Anderson的先进技术基因组核心(ATGC)的联合主任。
他在迈克尔威廉博士的指导下,在寒冷的春天港实验室进行了他的研究生培训和博士后训练。在此期间,他发明了第一单细胞DNA测序方法(单核测序),用于测序哺乳动物细胞的基因组(Navin等,2011,性质。)。这项工作在建立单细胞基因组学领域时发挥了关键作用。Navin实验室继续处于单细胞癌基因组学领域的最前沿,他们发现了三阴性乳腺癌中的拷贝数演化的标点模型(Gao等,2016年,自然遗传学),并阐明了角色致素phentoypes乳腺癌进化中的亚基突变(Wang等,2014年,性质)。
Navin博士的团队继续引领着单细胞DNA和RNA测序新技术的开发,以及分析大规模数据集的创新计算和统计方法。这些方法正在被应用于在侵袭、转移和治疗耐药性的背景下研究癌症进化。他的实验室与MD Anderson的顶尖肿瘤学家和病理学家密切合作,将这些技术转化为临床,在那里它们将对降低人类患者的发病率产生重大影响。
Navin博士的工作获得了许多声望很高的奖项,包括Damon-Runyon革新者奖、AAAS瓦赫特尔奖、ACS研究学者奖、Wilson Stone奖、Randall革新者奖和MD Anderson总裁研究卓越奖。乐动体育LDsports中国
访问纳文博士的实验室网站.查看完整列表纳文博士的出版物.纳文博士,谷歌学术
目前职务及工作关系
主要约会
德克萨斯州德克萨斯州德克萨斯州安德森大学基础科学研究科学研究部副教授乐动体育LDsports中国
德克萨斯大学安德森癌症中心基础科学研究部遗传学系CPRIT单细胞基因组学中心主任乐动体育LDsports中国
德州大学安德森癌症中心基础科学研究部遗传学系高级技术基因组学核心副主任乐动体育LDsports中国
双/联合/辅助预约
德克萨斯大学安德森癌症中心生物信息与计算生物学副教授
德克萨斯大学MD安德森癌症中心uthehealth生物医学科学研究生院副教授
乐动体育LDsports中国研究兴趣
单细胞基因组学;癌症进化;液体活检基因组学;计算生物学
本集团开创了单细胞基因组测序技术的发展,我们申请了解人类癌症中的复杂生物过程,包括肿瘤起始,侵袭,转移和治疗性。我们将癌症作为一种进化过程,其中克隆响应选择性压力而持续选择和扩张。我们理解肿瘤作为一种复杂的生态系统,其通过肿瘤细胞和基质细胞类型之间的复杂的相互作用而维持。我们的使命是获得对癌症演变的新知识,可以利用来提高癌症质量和降低癌症患者的发病率。在MD Anderson,我们是独特的定位,以将基因组技术转化为诊所,在那里他们准备对癌症患者的早期检测,诊断和治疗策略产生重大影响。
教育与培训
授予学位教育
2010年 | 冷泉港实验室和石溪大学,冷泉港,纽约,美国,博士,分子遗传学 |
2003年 | Skidmore学院,萨拉托加斯普林斯,美国,纽约,细胞生物学学士 |
研究生培训
2010-2011 | 博士后研究员,癌症遗传学,冷泉港实验室,冷泉港,纽约 |
体验和服务
学术任命
德州大学安德森癌症中心生物信息学与计算生物学助理教授,数量科学部,德克萨斯州休斯顿,2011 - 2016
助理科学研究系助理教授,德克萨斯州德克萨斯州德克萨斯州德克萨斯州德克萨斯州,TX,2011年休斯顿,2016年乐动体育LDsports中国
德克萨斯州德克萨斯州德克萨斯州博士大学助理教授Uthealth生物医学科学院,休斯顿,TX,2011年 - 2016年
荣誉与奖励
2021. | 2021年美国癌症研究协会基础癌症研究杰出成就奖乐动体育LDsports中国 |
2019年 | 主席德克萨斯大学德克萨斯大学卓越奖卓越奖乐动体育LDsports中国 |
2019年 | BlavaTnik颁发生命科学,国家入围者 |
2018年 | 德克萨斯大学安德森癌症中心教师教育奖 |
2018年 | 达拉斯/沃思堡德克萨斯大学德克萨斯大学德克萨斯大学德克萨斯州癌症中心基础研究的达拉斯/沃思堡乐动体育LDsports中国 |
2017年 | 兰德尔家族基金会颁发的杰克和贝弗利兰德尔癌症治疗卓越奖 |
2017年 | 挑战奖,前列腺癌基础 |
2017年 | 40岁以下40岁,Stoney Brook大学 |
2016年 | 总统德克萨斯大学德克萨斯大学安德森癌症中心学者奖 |
2016年 | Sabin奖学金,安德鲁萨宾家族基金会 |
2016年 | 美国癌症乐动体育LDsports中国协会研究学者 |
2016年 | 德州大学安德森癌症中心校长表彰杰出教师 |
2016年 | 教师学者奖,德克萨斯大学M.D.安德森癌症中心 |
2015年 | AAAS Martin&Rose Wachtel奖,美国促进科学促进协会 |
2014年 | 德克萨斯大学安德森癌症中心教师教育奖 |
2013年 | 徐道昌奖,青年研究员奖 |
2013年 | 威尔逊S. Stone Memorial奖 |
2013年 | 达蒙-鲁尼恩创新者奖,达蒙-鲁尼恩拉克利夫基金会 |
2010年 | 基因组技术杂志青年研究者奖 |
2009年 | 美国国家癌症研究所NCI研究员 |
2009年 | 亚伯拉罕奖,石溪大学 |
2008年 | 国王和米勒奖学金,石溪大学 |
2005年 | 林德赛-戈德堡奖学金,冷泉港实验室 |
选定的出版物
同行评审文章
- Minussi DC,Nicholson MD,Ye H,Davis A,Wang K,Baker T,Tarabichi M,Sei E,Du H,Rabbani M,Peng C,Hu M,Bai S,Lin Yw,Schalck A,Multani A,MA J,麦当劳到,赌场A,Barra A,陈H,Lim B,Arun B,Meric-Bernstam F,Van Loo P,Michor F,Navin Ne.乳腺肿瘤在扩张期间维持亚克间多样性的储层。自然592(7853):302-308,2021. E-PUB 2021. PMID:33762732。
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- Naffar-Abu Amara S,Kuiken HJ,Selfors LM,Butler T,Leung Ml,Leung CT,Kuhn EP,Kolarova T,Hage C,Ganesh K,Panayiotou R,Foster R,Rueda Br,Aktipis A,Spellman P,Ince Ta,XIU J,Oberley M,Gatalica Z,Navin N,Mills GB,Bronson RT,Brugge JS.瞬态共生克隆相互作用可以驱动肿瘤转移。NAT Commun 11(1):5799,2020。PMID:33199705。
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- Mitra,安德鲁斯MC,卢武铉W·德·马赛MP,哈金斯连续波,Carapeto F,辛格年代,鲁本,王F,毛泽东X, X,万尼K, Tippen年代,Ng KS, Schalck, Sakellariou-Thompson哒,陈E, Reddy SM,斯宾塞CN, Wiesnoski D, LD, Gumbs C,库珀咱,伯顿EM,胡P,戴维斯,张J, Bernatchez C, Navin N Sharma P, Allison JP,沃戈是的,绮C,Tetzlaff MT, Hwu WJ, Lazar AJ, Futreal PA.空间解决分析链接基因组和免疫多样性,并揭示黑色素瘤中不利的中性粒细胞激活。NAT Comment 11(1):1839,2020。PMID:32296058。
- Rozenblatt-Rosen O,Regev A,Oberdoerffer P,Nawy T,Hupalowska A,Rood Je,Ashenberg O,Cerami E,Coffey RJ,Demir E,Ding L,Esplin Ed,福特JM,Goecks J,Ghosh S,Gray JW,Guinney J,Hanlon Se,Hughes Sk,Hwanges Sk,Hwang Es,Iacobuena-Donahue Ca,Jané-valbuena J,Johnson,Lau Ks,Lau Ks,Mazzilli Sa,Pe'er D,Santagata S,Shalek Ak,Schapiro D,Snyder MP,Sorger PK,Spira Ae,Srivastava S,Tan K,West RB,Williams EH.人类肿瘤图谱网络:在单细胞分辨率绘制跨越空间和时间的肿瘤转移。细胞181(2):236 - 249年,2020年。PMID: 32302568。
- 戴维斯A,高R,纳文N.SCOPIT:单细胞测序实验的样本量计算。生物信息学20(1):566,2019。PMID: 31718533。
- Zafar H,Navin N,Chen K,Nakhleh L..SICLONEFIT:来自单细胞基因组测序数据的肿瘤克隆人口结构,基因型和文学的贝叶斯推断。Genome Res(11):1847-1859,2019。PMID:31628257。
- 王芳,梁绍峰,库马尔,纳文,陈凯.SCMarker:用于单细胞转录组分析的从头标记选择。PLoS compput bio15 (10):e1007445, 2019。PMID: 31658262。
- 玉米pg,heath ei,zurita a,ramesh n,xiao l,sei e,li-ning-tapia e,tu sm,sumudhi sk,王x,王x,efstathiou e,thompson tc,troncoso p,navin n,logothetisCJ,Aparicio Am.Cabazitaxel Plus Carboplatin用于治疗转移性阉割的前列腺癌症的男性:随机,开放标签,第1-2期试验。柳叶刀牛舞型20(10):1432-1443,2019。PMID:31515154。
- 张勇,熊森,刘斌,Pant V, Celii F, Chau G, Elizondo-Fraire AC, Yang P, You MJ, El-Naggar AK, Navin NE, Lozano G . [10.体细胞Trp53突变不同地驱动乳腺癌和转移的进化。Nat commen 9(1):3953, 2018。e-Pub 2018。PMID: 30262850。
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- Gao R, Davis A, McDonald TO, Sei E, Shi X, Wang Y, Tsai PC, Casasent A, Waters J, Zhang H, Meric-Bernstam F, Michor F, Navin NE.三重阴性乳腺癌的标点拷贝数演化与克隆瘀滞。NAT Genet 48(10):2016年1119-30. E-PUB 2016. PMID:27526321。
- Mann KM, Newberg JY, Black MA, Jones DJ, Amaya-Manzanares F, Guzman-Rojas L, Kodama T, Ward JM, Rust AG, van der Weyden L, Yew CC, Waters JL, Leung ML, Rogers K, Rogers SM, McNoe LA, Selvanesan L, Navin N, Jenkins NA, Copeland NG, Mann MB.用SBCapseq分析单髓性白血病细胞中肿瘤异质性和驾驶员基因。自然生物科技34(9):962-72,2016。PMID:27479497。
- Zafar H,Wang Y,Nakhlem L,Navin N,Chen K..单核:单细胞中的单核苷酸变体检测。自然方法,2016. PMID:27088313。
- 梁明林,王勇,金诚,高瑞,蒋杰,塞恩,纳文东北.单核高度多路复用目标DNA测序。Nat协议11(2):214- 35,2016。e-Pub 2016。PMID: 26741407。
- 梁敏,王颖,王永明,王永明.SNES:单核外壳测序。基因组BIOL 25(16):55,2015。PMID:25853327。
- Molhatra A,王Y,Waters J,Hall I,Navin N.倍增性SEQ:通过测序多倍体肿瘤群推断突变年表。Genomic Med 7(1):6,2015。PMID:25729435。
- 王颖,Waters J, Unruh A, Roh W, Shi X, Chen K, Scheet P, Vattathil S, Liang H, Multani A, Zhang H, Zhao R, Michor F, Meric-Bernstam F, Navin NE。.单核基因组测序揭示乳腺癌的克隆进化。自然512(7513):155 - 2014。PMID: 25079324。
- Baslan T, Kendall J, Troge J, stesteansky A, Wigler M, Navin N, Hicks J.单细胞的基因组拷贝数分析。自然协议7(6):1024-41,2012。PMID:22555242。
- Navin N、Kendall J、Troge J、Rodgers L、Cook K、stesteansky A、Levy D、Lee Y、Esposito D、Muthuswamy L、Hicks J、Wigler M.单细胞测序推断肿瘤演进。自然7(472):90-4,2011。PMID:21399628。
- Gao R,Bai S,Henderson YC,Lin Y,Schalck A,Yan Y,Kumar T,Hu M,Sei E,Davis A,Wang F,Shaitelman SF,Wang Jr,Chen K,Moulder S,Lai Sy,Navin Ne.描绘人肿瘤中的拷贝数和克隆子结构来自单细胞转录组。NAT BIOTECHNOL。E-PUB 2021. PMID:33462507。
- Malihi PD,Graf RP,Rodriguez A,Ramesh N,Lee J,Sutton R,Jile R,Ruiz Velasco C,Sei E,Kolatkar A,洛奇卢比C,Navin Ne,Corn P,Aparicio Am,Dittamore R,Hicks J,KuhnP,Zurita AJ.单细胞循环肿瘤细胞分析显示基因组不稳定性是侵袭性前列腺癌的一个显著特征。Clin Cancer res e-Pub 2020。PMID: 32341031。
邀请的文章
- Schalck A,Bernatchez C,Navin N.居民乳房T细胞:部队已经存在。趋势MOL MED 10:2018。E-PUB 2018. PMID:30077643。
- 王莹,王永平,王永平.单细胞测序技术的进展与应用。分子细胞58(4):598-609,2015。PMID:26000845。
补助金支持
标题: | 用单细胞测序研究TNBC乳腺癌患者的化疗耐药演化 |
资金来源: | Lefkofsky基金会 |
角色: | 主要调查员 |
标题: | 研究TNBC的突变进化和肿瘤内异质性 |
资金来源: | 美国癌症协会(ACS) |
角色: | 主要调查员 |
标题: | 集成单细胞基因组学核心设施 |
资金来源: | 德州癌症防治研究所乐动体育LDsports中国 |
角色: | 主要调查员 |
标题: | 使用新的测序技术表征癌症基因组不稳定性和平移影响 |
资金来源: | 德州癌症防治研究所乐动体育LDsports中国 |
角色: | 共同调查员 |
标题: | 转移乳腺癌和前列腺癌的OMIC和多维空间地图集(OMS Atlas) |
资金来源: | NIH / NCI. |
角色: | 共同调查员 |
标题: | 利用空间单细胞基因组学研究乳腺癌前期的肿瘤起始和侵袭 |
资金来源: | NIH / NCI. |
角色: | 主要调查员 |
标题: | 用单细胞基因组学划定乳腺癌中化学抑制的演变与生态学 |
资金来源: | NIH / NCI. |
角色: | 主要调查员 |
标题: | 人类乳腺细胞图谱种子网络 |
资金来源: | Chan Zuckerberg主动 |
角色: | 主要调查员 |
标题: | 转移性乳腺癌患者治疗耐药性的空间组学分析 |
资金来源: | NIH / NCI. |
角色: | 共同调查员 |
标题: | 利用单细胞基因组学划定乳腺癌抗患者对患者的抗性的演变 |
资金来源: | 姐妹机构网络基金,UTMDACC |
角色: | 主要调查员 |
标题: | EGLN抑制介导肠辐射保护改善不可切除胰腺癌的临床预后 |
资金来源: | NIH / NCI. |
角色: | 共同调查员 |
标题: | AML / MDS Moon Shot |
资金来源: | UTMDACC Moon Shot Program |
角色: | 共同调查员 |
标题: | 前列腺癌月球探测器 |
资金来源: | UTMDACC Moon Shot Program |
角色: | 共同调查员 |
标题: | 乳腺癌月球照片 |
资金来源: | UTMDACC Moon Shot Program |
角色: | 共同调查员 |
标题: | LC170171小细胞肺癌(SCLC)中肿瘤异质性和治疗性 |
资金来源: | 国防部(国防部) |
角色: | 共同调查员 |
标题: | 立即防止导管癌患者侵入性过度处理 - 精度 |
资金来源: | 英国癌症研究中乐动体育LDsports中国心 |
角色: | 共同调查员 |