来认识一下尼古拉斯·纳文博士。
尼古拉斯·纳文博士。
基础科学划分遗传学系
关于纳文博士
纳温博士是MD Anderson癌症中心的副教授，在生物信息学系联合任命。他是德克萨斯大学MD安德森癌症中心UthalthHealthEngalEngalStudio生物医学系的教员。他也是CPRIT单细胞基因组中心（单核）的主任。以及MD安德森高级技术基因组学核心（ATGC）的联合主任。
在迈克尔·维格勒博士的指导下，他在冷泉港实验室进行了研究生培训和博士后培训。在此期间，他发明了第一种单细胞DNA测序方法（单核测序），用于对哺乳动物细胞的基因组进行测序（Navin et al.2011，Nature.）。这项工作在建立单细胞基因组学领域中发挥了关键作用。纳文实验室继续站在单细胞癌症基因组学领域的前沿，他们发现了三阴性乳腺癌中拷贝数进化的间断模型（Gao等人，2016，自然遗传学），并阐明了突变表型和亚克隆突变在乳腺癌进化中的作用（Wang等人，2014，《自然》杂志）。
Navin博士的团队继续致力于开发单细胞DNA和RNA测序的新技术，以及用于分析产生的大规模数据集的创新计算和统计方法。这些方法正被应用于肿瘤侵袭、转移和治疗耐药性的研究。他的实验室与MD安德森的领先肿瘤学家和病理学家密切合作，将这些技术转化为临床，在那里他们准备对降低人类患者的发病率产生重大影响。
Navin博士获得了许多著名的奖项，以表彰他的工作，包括Damon-Runyon创新者奖、AAAS Wachtel奖、ACS研究学者奖、Wilson Stone奖、Randall创新者奖和MD Anderson总裁卓越研究奖。乐动体育LDsports中国
参观纳文博士实验室的网站．查看的完整列表纳文博士的出版物纳文博士-谷歌学术
现在的头衔和隶属关系
主要约会
德克萨斯州德克萨斯州德克萨斯州安德森大学基础科学研究科学研究部副教授乐动体育LDsports中国
Cprit Currit Single Cell Genomics Center，德克萨斯州德克萨斯州德克萨斯州和德克萨斯群岛癌症中心基础科学研究系遗传学系乐动体育LDsports中国
德克萨斯大学安德森癌症中心遗传学、基础科学研究部门高级技术基因组核心联席主任乐动体育LDsports中国
双重/联合/附属任命
休斯敦德克萨斯大学安德森癌症中心生物信息学与计算生物学系副教授
德克萨斯大学医学博士，安德森癌症中心副教授，休斯敦生物医学研究所
乐动体育LDsports中国研究兴趣
单细胞基因组学;癌症演变;液体活检基因组学;计算生物学
我们的团队率先开发了单细胞基因组测序技术，我们应用该技术来理解人类癌症的复杂生物学过程，包括肿瘤的起始、侵袭、转移和治疗耐药性。我们把癌症作为一个进化过程来研究，在这个过程中，克隆体在选择压力下进行选择和扩展。我们认为肿瘤是一个复杂的生态系统，它是由肿瘤细胞和基质细胞类型之间复杂的相互作用维持的。我们的使命是获得癌症进化的新知识，可以用来提高生活质量和降低癌症患者的发病率。在MD安德森，我们在将基因组技术应用于临床方面处于独特的地位，这些技术将对癌症患者的早期检测、诊断和治疗策略产生重大影响。
教育和培训
授予学位教育
| 2010 | 冷泉港实验室和石溪大学，冷泉港，纽约，美国，博士，分子遗传学 |
| 2003 | 美国纽约萨拉托加斯普林斯Skidmore学院，理学学士，细胞生物学 |
研究生培训
| 2010-2011 | 博士后研究员，癌症遗传学，冷泉港实验室，冷泉港，纽约 |
体验与服务
学术任命
2011 - 2016年，德克萨斯大学安德森癌症中心定量科学部生物信息学和计算生物学系助理教授
德克萨斯大学基础医学研究所遗传学系助理教授，休斯敦MD安德森癌症中心，德克萨斯州，2011—2016乐动体育LDsports中国
助理教授，德克萨斯大学MD安德森癌症中心UTHealth生物医学科学研究生院，休斯顿，德克萨斯州，2011 - 2016
荣誉与奖励
| 2019 | 德克萨斯大学卓越研究奖，德克萨斯大学医学博士乐动体育LDsports中国安德森癌症中心 |
| 2019 | BlavaTnik颁发生命科学，国家入围者 |
| 2018 | 教师教育家奖，德克萨斯大学安德森癌症中心 |
| 2018 | 达拉斯/沃斯堡活着的传奇教师成就奖在基础研究，德克萨斯大学医学博士安德森癌症中心乐动体育LDsports中国 |
| 2017 | 杰克和贝弗利兰德尔杰出癌症治疗奖，兰德尔家庭基金会 |
| 2017 | 挑战奖，前列腺癌基础 |
| 2017 | 斯托尼布鲁克大学40岁以下青年奖学金 |
| 2016 | 总统德克萨斯大学德克萨斯大学安德森癌症中心学者奖 |
| 2016 | 萨宾奖学金，安德鲁·萨宾家庭基金会 |
| 2016 | 美国癌症乐动体育LDsports中国协会研究学者 |
| 2016 | 德克萨斯大学安德森癌症中心院长表彰杰出教师 |
| 2016 | 德克萨斯大学安德森癌症中心教授学者奖 |
| 2015 | 美国科学促进会马丁·罗斯·瓦赫特尔奖 |
| 2014 | 教师教育家奖，德克萨斯大学安德森癌症中心 |
| 2013 | 徐廷春奖，青年研究员奖 |
| 2013 | 威尔逊S. Stone Memorial奖 |
| 2013 | 达蒙Runyon创新者奖，达蒙Runyon雷切莱夫基金会 |
| 2010 | 青年研究者奖，基因组技术杂志 |
| 2009 | T32 NCI奖学金，国家癌症研究所 |
| 2009 | 亚伯拉罕奖，石溪大学 |
| 2008 | 石溪大学金和米勒奖学金 |
| 2005 | 冷泉港实验室Lindsey-Goldberg研究员 |
选定的出版物
同行评议文章
- 戴维斯A，高R，纳文．SCOPIT：单细胞测序实验的样本大小计算。BMC BioInformatics 20（1）：566,2019。PMID：31718533。
- Zafar H, Navin N, Chen K, Nakhleh L．SICLONEFIT：来自单细胞基因组测序数据的肿瘤克隆人口结构，基因型和文学的贝叶斯推断。Genome Res（11）：1847-1859,2019。PMID：31628257。
- 王峰，梁绍峰，陈凯．SCMarker：用于单细胞转录组分析的AB Initio标记选择。PLOS计算BIOL 15（10）：E1007445,2019。PMID：31658262。
- 玉米pg，heath ei，zurita a，ramesh n，xiao l，sei e，li-ning-tapia e，tu sm，sumudhi sk，王x，王x，efstathiou e，thompson tc，troncoso p，navin n，logothetisCJ，Aparicio Am．卡巴他赛联合卡铂治疗转移性去雄耐药前列腺癌:一项随机、开放标签、1-2期试验Lancet Oncol 20(10):1432-1443, 2019。PMID: 31515154。
- 张勇，熊胜，刘斌，潘V, Celii F, Chau G, Elizondo-Fraire AC, Yang P, You MJ, El-Naggar AK, Navin NE, Lozano G．体细胞Trp53突变差异驱动乳腺癌和转移的进化。土木工程学报9(1):3953,2018。e-Pub 2018。PMID: 30262850。
- Kim C & Gao R, Sei E, Brandt R, Hartman J, Hatshek T, Crosetto N, Foukakis T和Navin N。．用单细胞测序描述三阴性乳腺癌的耐药进化。细胞173(4):879 - 893年,2018年。PMID: 29681456。
- Casasent AK, Schalck A, Gao R, Sei E, Long A, Pangburn W, Casasent T, Meric-Bernstam F, Edgerton ME, Navin NE．乳腺肿瘤多克隆侵袭的单细胞测序。细胞172(2):205 - 217年,2018年。PMID: 29307488。
- Leung ML，Davis A，Gao R，Casasent A，Wang Y，Sei E，Vilar E，Maru D，Kopetz，Navin，N单细胞DNA测序揭示转移性结直肠癌的晚期扩散模式。基因组研究报告27（8）：1287-12992017。PMID:28546418。
- Gao R, Davis A, McDonald TO, Sei E, Shi X, Wang Y, Tsai PC, Casasent A, Waters J, Zhang H, Meric-Bernstam F, Michor F, Navin NE．三重阴性乳腺癌的标点拷贝数演化与克隆瘀滞。NAT Genet 48（10）：2016年1119-30. E-PUB 2016. PMID：27526321。
- 曼恩KM、纽伯格JY、布莱克马、琼斯DJ、阿玛亚·曼扎纳雷斯F、古兹曼·罗哈斯L、科达玛T、沃德·JM、Rust AG、范德韦登L、红豆杉CC、沃特斯JL、梁ML、罗杰斯K、罗杰斯SM、麦克诺伊·拉、塞尔瓦南L、纳文、詹金斯纳、科普兰N、曼恩MB. 用SBCapSeq分析单粒细胞白血病细胞的肿瘤异质性和驱动基因。自然生物科技34（9）：962-722016。采购经理人指数：27479497。
- Zafar H，Wang Y，Nakhlem L，Navin N，Chen K.．单核：单细胞中的单核苷酸变体检测。自然方法，2016. PMID：27088313。
- 梁美玲，王毅，金灿，高R，蒋杰，Sei-E，Navin-NE．从单一核的高度复用靶向DNA测序。NAT PROTOC 11（2）：214-35,2016。E-PUB 2016. PMID：26741407。
- 梁m，王y，waters j，navin n. SNES：单核外显子组测序。基因组生物学25（16）：552015。采购经理人指数：25853327。
- Molhatra A, Wang Y, Waters J, Hall I, Navin N《倍体序列：通过对多倍体肿瘤亚群进行测序推断突变年代》。基因组医学7（1）：62015。PMID:25729435。
- Wang Y, Waters J, Unruh A, Roh W, Shi X, Chen K, Scheet P, Vattathil S, Liang H, Multani A, Zhang H, Zhao R, Michor F, Meric-Bernstam F, Navin NE。．单核基因组测序揭示乳腺癌的克隆演变。自然512（7513）：2014年155-60,2014. PMID：25079324。
- Baslan T, Kendall J, Troge J, stephansky A, Wigler M, Navin N, Hicks J．单细胞的基因组拷贝数分析。自然协议7（6）：1024-41,2012。PMID：22555242。
- Navin N, Kendall J, Troge J, Rodgers L, Cook K, stephansky A, Levy D, Lee Y, Esposito D, Muthuswamy L, Hicks J, Wigler M．通过单细胞测序推断肿瘤的进化。自然7(472):90 - 2011。PMID: 21399628。
- Malihi PD, Graf RP, Rodriguez A, Ramesh N, Lee J, Sutton R, Jiles R, Ruiz Velasco C, Sei E, Kolatkar A, Logothetis C, Navin NE, Corn P, Aparicio AM, Dittamore R, Hicks J, Kuhn P, Zurita AJ．单细胞循环肿瘤细胞分析显示基因组不稳定性是侵袭性前列腺癌的一个显著特征。Clin Cancer Res. e-Pub 2020。PMID: 32341031。
邀请的文章
- 王颖，纳文．单细胞测序技术的进展与应用。中国生物医学工程学报，2017,30(4):598-609。PMID: 26000845。
补助金支持
| 标题: | 用单细胞测序法研究TNBC乳腺癌患者的耐药性演变 |
| 资金来源: | 莱夫科夫斯基基础 |
| 角色： | 首席研究员 |
| 标题: | TNBC的突变进化和肿瘤内异质性研究 |
| 资金来源: | 美国癌症协会 |
| 角色： | 首席研究员 |
| 标题: | 集成单细胞基因组学核心设施 |
| 资金来源: | 德克萨斯州癌症预防与研究所（CPRIT）乐动体育LDsports中国 |
| 角色： | 首席研究员 |
| 标题: | 使用新的测序技术表征癌症基因组不稳定性和平移影响 |
| 资金来源: | 德克萨斯州癌症预防与研究所（CPRIT）乐动体育LDsports中国 |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | 转移性乳腺癌和前列腺癌的组学和多维空间图谱(OMS图谱) |
| 资金来源: | NIH / NCI |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | 利用空间单细胞基因组学研究癌前乳腺癌的肿瘤起始和侵袭 |
| 资金来源: | NIH / NCI |
| 角色： | 首席研究员 |
| 标题: | 用单细胞基因组学描述乳腺癌化疗耐药的进化和生态 |
| 资金来源: | NIH / NCI |
| 角色： | 首席研究员 |
| 标题: | 人类乳腺细胞图谱种子网络 |
| 资金来源: | 陈扎克伯格倡议 |
| 角色： | 首席研究员 |
| 标题: | 转移性乳腺癌患者治疗耐药性的空间组学分析 |
| 资金来源: | NIH / NCI |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | 利用单细胞基因组学划定乳腺癌抗患者对患者的抗性的演变 |
| 资金来源: | 姐妹机构网络基金，UTMDACC |
| 角色： | 首席研究员 |
| 标题: | 通过EGLN抑制转化肠道放射反应，从而改善不可切征胰腺癌的临床结果 |
| 资金来源: | NIH / NCI |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | AML / MDS登月计划 |
| 资金来源: | UTMDACC登月计划 |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | 前列腺癌登月计划 |
| 资金来源: | UTMDACC登月计划 |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | 乳腺癌登月疫苗 |
| 资金来源: | UTMDACC登月计划 |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | 小细胞肺癌(SCLC)的肿瘤异质性和治疗耐药 |
| 资金来源: | 国防部 |
| 角色： | 共同调查员 |
| 标题: | 立即防止导管癌患者侵入性过度处理 - 精度 |
| 资金来源: | 英国癌症研究所乐动体育LDsports中国 |
| 角色： | 共同调查员 |