汉梁博士。
生物信息学与计算生物学系,基础科学部
关于梁博士
Liang博士是Barnhart家族靶向治疗特聘教授,德克萨斯大学MD安德森癌症中心生物信息学和计算生物学副系主任。他也是系统生物学系的教授。2001年获得北京大学化学学士学位,2006年获得美国普林斯顿大学定量与计算生物学博士学位。随后,梁博士在芝加哥大学(University of Chicago)完成了进化和计算基因组学的博士后培训。他加入MD安德森癌症中心担任助理教授,并于2009年成立了自己的小组。
在MD Anderson, Liang博士的团队专注于生物信息学工具开发、整合癌症基因组分析、RNA调控/修饰和癌症系统生物学。他在增强子调控、RNA编辑、功能蛋白质组学、性效应、癌症驱动基因突变等方面的系统研究对生物医学研究产生了深远影响,引起了《华尔街日报》、《新闻周刊》等媒体的广泛关注。乐动体育LDsports中国他的团队开发的生物信息学工具(如TCPA、TANRIC、FASMIC、DrBioRight)在全球共有> 11万活跃用户。2010年以来,在《Cell》、《Cancer Cell》、《Nature Genetics》、《Nature Biotechnology》、《Nature Methods》等顶级期刊上发表通讯作者论文> 160篇(总被引>3万次),其中通讯作者论文>40篇。
梁博士曾在大型癌症联盟项目中担任领导角色,包括癌症基因组图谱(TCGA)PanCanAtlas工作组的c hair、国际癌症基因组联盟(ICGC)泛癌症全基因组分析项目的一名共同领导者,以及NCI基因组数据共享(GDC)QC工作组的一名共同主席。他获得了多项奖项,包括MD安德森R.Lee克拉克研究员奖(2014),德克萨斯大学系统明星奖(2015),MD安德森学院学者奖(2018)和AACR团队科学奖(2020)。他是美国科学进步协会(AAAS)的当选会员。有关更多信息,请访问http://odin.mdacc.tmc.edu/~hliang1/。现在的头衔和隶属关系
主要的约会
巴恩哈特家族靶向治疗特聘教授,德克萨斯大学安德森癌症中心基础科学研究部生物信息学和计算生物学系乐动体育LDsports中国
德克萨斯大学安德森癌症中心基础科学研究部生物信息学和计算生物学系教授乐动体育LDsports中国
德克萨斯大学安德森癌症中心基础科学研究部生物信息学和计算生物学系副主任乐动体育LDsports中国
双重/联合/附属任命
德克萨斯大学安德森癌症中心系统生物学系基础科学研究部教授乐动体育LDsports中国
德克萨斯大学休斯敦休斯敦生物医学研究所普通会员
贝勒医学院教员,休斯顿,德克萨斯州
教育与培训
授予学位教育
2006 | 普林斯顿大学,数量与计算生物学博士 |
2001 | 北京大学,北京,中国,理学士,化学 |
体验与服务
学术任命
美国德克萨斯大学MD安德森癌症中心生物信息学和计算生物学系副教授,休斯敦,2014,2018
德克萨斯大学安德森癌症中心系统生物学系副教授,休斯顿,德克萨斯州,2014 - 2018
德克萨斯大学定量医学研究所助理教授,德克萨斯大学MD Anderson癌症中心,休斯敦,2009,2014
芝加哥大学生态与进化学系博乐动体育LDsports中国士后研究学者,芝加哥,伊利诺伊州,2006 - 2009
荣誉和奖励
2020 | AACR团队科学奖 |
2020 | 美国科学促进会AAAS会员 |
2018 | 德克萨斯大学安德森癌症中心教授学者奖 |
2017 | MD安德森出版物画廊,德克萨斯大学MD安德森癌症中心 |
2016 | 布拉瓦特尼克奖机构提名人 |
2015 | STARS奖,德克萨斯大学系统 |
2014 | 德克萨斯大学安德森癌症中心李·克拉克研究员奖 |
2012 | 子宫孢子职业发展奖,NIH/NCI |
2011 | 玫琳凯研究基金机构提名人乐动体育LDsports中国 |
2008 | SMBE旅游奖,SMBE协会 |
2007 | RNA会议旅行奖学金,RNA协会 |
2005 | 普林斯顿大学研究生校友旅行奖学金协会 |
2001 | 最佳毕业论文奖,北京大学,中国 |
2000 | 中国北京大学优秀学生奖 |
1998 | 中国北京大学杜邦研究员 |
精选出版物
同行评议文章
- 李俊,陈浩,王颖,陈明敏,梁H. 针对组学数据的下一代分析。癌症细胞39(1): 3 - 6, 2021年。e-Pub 2020。PMID: 32976776。
- 李赵W, J,陈MM,罗Y, Z Ju, nes NK, Johnson-Camacho K,小旅店的CT,劳伦斯Y,潘德NT,戴维斯,Herlyn M, Muranen T, Zervantonakis本土知识,冯Euw E,舒尔茨,Kumar SV Korkut,首位PT, Akbani R, Slamon DJ,灰色JW,布鲁日JS,陆Y,米尔斯GB,梁H.肿瘤细胞系中临床相关蛋白药物反应的大规模表征。癌症细胞38(6): 829 - 843。e4, 2020年。e-Pub 2020。PMID: 33157050。
- 陈H,,梁H.一份高分辨率的人类增强子RNA位点图谱,描述了癌症中的超级增强子活动。癌症细胞38(5):701-715.E52020。电子酒吧2020。PMID:33007258。
- Yuan Y, Ju YS, Kim Y, Li J, Wang Y, Yoon CJ, Yang Y, Martincorena I, Creighton CJ, Weinstein JN, Xu Y, Han L, Kim HL, Nakagawa H, Park K, Campbell PJ,梁H, PCAWG财团.人类癌症中线粒体基因组的全面分子特征。Nat麝猫52(3): 342 - 352年,2020年。e-Pub 2020。PMID: 32024997。
- 彭高李Z, X, X,也许陈MJ,李Z,魏B,温家宝X,魏B,董Y, Z Bu,吴,吴问,唐L,李Z,刘Y,张L,贾年代,张L,掸族F,张J,吴X, X霁,霁K,吴X, J,兴X,吴J, Lv G,沈L,霁X,梁H *霁J. 胃癌分子特征的多组学特征与新辅助化疗反应相关。Sci副词6(9):EAAY42112020年。电子酒吧2020。PMID:32133402*共同通讯作者。
- Chen H, Li J, Wang Y, Ng PK, Tsang YH, Shaw KR, Mills GB梁H. 预测癌症驱动基因突变的计算算法的综合评估。基因组生物学21(1): 2020。e-Pub 2020。PMID: 32079540。
- Gao GF,Parker JS,Reynolds SM,Silva TC,Wang LB,Zhou W,Akbani R,Bailey M,Balu S,Berman BP,Brooks D,Chenniack AD,Demchok JA,Ding L,Felau I,Gaheen S,Gerhard DS,Heiman DI,Hernandez KM,Hoadley KA,Jayasinghe R,Kemal A,Knijnenburg TA,Laird PW,Mensah MKA,Mungall AJ,Robertson AG,Shen H,Tarnuzzer R,Wang Z,Wyczalkowski M,杨莉,曾克伦森JC,张Z,基因组数据分析网络,梁H *,高贵的女士.前后:传统和协调TCGA基因组数据共享数据的比较。细胞系统9(1): 24到34。e10, 2019年。主要通讯作者。
- 叶颖,胡强,陈华,梁凯,袁勇,向勇,阮华,张铮,宋安,张华,刘丽,刁玲,娄阳,周波,王丽,周松,高杰,Jonasch E,林舒,夏勇,林超,杨玲,Mills GB,梁H *L,汉族.辅助低氧靶向治疗的低氧相关分子特征的表征。Nat金属底座1(4): 431 - 444年,2019年。e-Pub 2019。通讯作者。
- 陈华,李超,周智,梁H. 快速进化的人类特异性神经增强剂与衰老相关疾病相关。细胞系统6(5): 604 - 611。e4, 2018年。PMID: 29792826。
- 陈华,李超,彭旭,周智,Weinstein JN,癌症基因组图谱研究网络,乐动体育LDsports中国梁H.近9000例患者增强子表达的泛癌分析细胞173(2):386-399.E1212018。PMID:29625054。
- 葛智,Leighton JS, Wang Y, Peng X, Chen Z, Chen H, Sun Y, Yao F, Li J, Zhang H, Liu J, Shriver CD, Hu H, Cancer Genome Atlas Res乐动体育LDsports中国earch Network, Piwnica-Worms H, Ma L,梁H.癌症类型中泛素途径的整合基因组分析。细胞代表23(1):213-226.e3,2018年。PMID:29617661。
- Ng PK,李J, Jeong KJ,邵年代,陈H,曾荫权YH,森古普塔年代,王Z, Bhavana VH, Tran R, Soewito年代,Minussi,莫雷诺D,香港K, Dogruluk T,卢H,高J, Tokheim C,周,约翰逊,曾庆红J, Ip CKM Ju Z,西风M, Yu年代,李Y, Vellano CP,舒尔茨N, Karchin R,丁L,陆Y,张轻型,陈K,肖KR, Meric-Bernstam F,咦,斯科特•KL萨尼N,梁H *,米尔斯GB.癌症体细胞突变的系统功能注释。癌症细胞33(3):450-462.E102018。PMID:29533785*首席通讯作者。
- Wang Y, Xu X, Yu S, Jeong KJ, Zhou Z, Han L, Tsang YH, Li J, Chen H, Mangala LS, Yuan Y, Eterovic AK, Lu Y, Sood AK, Scott KL, Mills GB,梁H. 人类癌症microRNA中A-to-I RNA编辑热点的系统表征。基因组Res27(7): 1112 - 1125年,2017年。e-Pub 2017。PMID: 28411194。
- 张Y, Kwok-Shing Ng P, Kucherlapati M,陈F,刘Y,曾荫权YH,德•贝拉斯科G, Jeong KJ, Akbani R,哈德吉潘,Pantazi,布里斯托,李E, Mahadeshwar HS,唐J,张J,杨L,赛斯,李年代,任X, X,太阳H,塞德曼J, Luquette LJ, Xi R,下巴L, Protopopov,韦斯特布鲁克TF,雪莱CS, Choueiri TK, Ittmann M, Van电波C,温斯坦约,梁H、Henske EP、Godwin AK、Park PJ、Kucherlapati R、Scott KL、Mills GB、Kwiatkowski DJ、Creighton CJ.PI3K/AKT/mTOR通路改变的全癌蛋白基因组图谱。癌症细胞31日(6):820 - 832。2017年e3。e-Pub 2017。PMID: 28528867。
- 林安,胡强,李超,邢铮,马刚,王超,李军,叶勇,姚军,梁坤,王胜,Park PK, Marks JR,周勇,周军,洪mc,梁H,胡震,沈华,Hawke DH,韩磊,周勇,林超,杨玲. LINK-A lncRNA与PtdIns(3,4,5)P3相互作用,过度激活AKT,并对AKT抑制剂产生耐药性。Nat细胞生物19(3): 238 - 251年,2017年。e-Pub 2017。PMID: 28218907。
- Li J, Zhao W, Akbani R, Liu W, Ju Z, Ling S, Vellano CP, Roebuck P, Yu Q, Eterovic AK, Byers LA, Davies MA, Deng W, Gopal YN, Chen G, von Euw EM, Slamon D, Conklin D, Heymach JV, Gazdar AF, Minna JD, Myers JN, Lu Y, Mills GB,梁H.反相蛋白阵列对人类癌症细胞系的特性研究。癌症细胞31(2): 225 - 239年,2017年。PMID: 28196595。
- 李超,王胜,邢铮,林安,梁坤,宋杰,胡强,姚坚,陈智,Park PK, Hawke DH,周杰,周勇,张胜,梁H,洪司仪,葛高立,韩力,林C,杨力.ROR1-HER3-lncRNA信号轴调节hippoyap通路来调节骨转移。Nat细胞生物19(2):106-119, 2017. 2017年电子酒吧。PMID:28114269。
- 袁勇,刘丽,陈浩,王勇,徐勇,毛华,李俊,米尔斯国标,舒勇,李丽,梁H.男性和女性癌症患者分子差异的综合特征。癌症细胞29日(5):711 - 2016。PMID: 27165743。
- 刘旭,肖志东,韩丽,张杰,李文文,王伟,李华,庄丽,陈杰,林鸿杰,王杰,梁H氮化镓B. LncRNA NBR2通过调节能量应激下的AMPK参与代谢检查点。Nat细胞生物18(4): 431 - 2016。e-Pub 2016。PMID: 26999735。
- 林安,李超,邢振,胡强,梁坤,韩磊,王超,Hawke DH,王胜,张勇,魏勇,马刚,Park PK,周军,周勇,胡振,周勇,Marks JR,梁H,洪mc,林超,杨玲.LINK-A lncRNA在三阴性乳腺癌中激活常氧HIF1α信号。Nat细胞生物18(2):213-24, 2016. 2016年电子酒吧。PMID:26751287。
- 李杰,韩力,罗巴克P,刁力,刘力,袁毅,温斯坦JN,梁H.TANRIC:探索lncrna在癌症中的作用的交互式开放平台。癌症Res75(18): 3728 - 2015。e-Pub 2015。PMID: 26208906。
- LW, Yu S, Zhang D, Li J, Ng PK, Panupinthu N, Mitra S, Ju Z, Yu Q,张梁H, Hawke DH, Lu Y, Broaddus RR, Mills GB.自然发生的新形态PIK3R1突变激活MAPK通路,决定对MAPK通路抑制剂的治疗反应。癌症细胞26(4):479-94, 2014. 电子酒吧2014。采购经理人指数:25284480。
- 张鹏,魏勇,王丽,Debeb BG,袁勇,张娟,袁娟,王明,陈东,孙勇,Woodward WA,刘勇,Dean DC,梁H,胡勇,昂克康,洪mc,陈杰,马琳.atm介导的ZEB1稳定通过CHK1促进DNA损伤反应和抗辐射能力。Nat细胞生物16(9): 864 - 75年,2014年。e-Pub 2014。PMID: 25086746。
- Wang Y, Waters J, Leung ML, Unruh A, Roh W, Shi X, Chen K, Scheet P, Vattathil S,梁H张洪,赵R, Michor F, Meric-Bernstam F, Navin NE.单核基因组测序揭示乳腺癌的克隆进化。自然512(7513):155-60, 2014. 电子酒吧2014。PMID:25079324。
- Yuan Y, Van Allen EM, Omberg L, Wagle N, Amin-Mansour A, Sokolov A, Byers LA, Xu Y, Hess KR, Diao L, Han L, Huang X, Lawrence MS, Weinstein JN, Stuart JM, Mills GB, Garraway LA, Margolin AA, Getz G,梁H. 评估癌症基因组和蛋白质组数据在不同肿瘤类型中的临床应用。纳特生物技术公司32(7): 644 - 652年,2014年。e-Pub 2014。PMID: 24952901。
- 朴海林,袁勇,王敏,孙勇,梁H,马.α-catenin通过抑制NF-κB信号通路在e -cadherin阴性基底样乳腺癌中起肿瘤抑制作用。Nat细胞生物16(3): 245 - 2014。e-Pub 2014。PMID: 24509793。
- 杨勇,韩磊,袁勇,李俊,黑宁,梁H.基因共表达网络分析揭示了不同癌症类型的预后基因的共同系统水平特性。纳特公社5:3231, 2014年。PMID: 24488081。
- 韩磊,袁勇,郑胜,杨勇,李俊,Edgerton ME,刁磊,徐勇,Verhaak RG,梁H.伪基因表达的泛癌分析揭示了生物学和临床相关的肿瘤亚型。纳特公社5:3963, 2014年。e-Pub 2014。PMID: 24999802。
- Omberg L, Ellrott K, Yuan Y, kandothc, Wong C, Kellen MR, Friend SH, Stuart J,梁H, Margolin AA. 在癌症基因组图谱中实现12种肿瘤类型的透明和协作计算分析。Nat麝猫45(10):1121-6, 2013. PMID:24071850。
- 梁H *张力华、李杰、朱子强、余S、斯特姆克·黑尔K、多格鲁卢克T、卢Y、刘X、古C、郭W、舍勒SE、卡特H、威斯汀南区、戴尔MD、维哈克RG、张F、卡钦R、刘CG、卢KH、布罗德杜斯RR、斯科特吉隆坡、轩尼诗BT、米尔斯GB.全外显子组测序结合功能基因组学揭示了新的子宫内膜癌候选驱动基因。基因组Res22日(11):2120 - 2012。e-Pub 2012。PMID: 23028188(*通讯作者)。
- 陈德、孙毅、魏毅、张平、热再安、阿华、特鲁亚·费尔德斯坦、古普塔S、,梁H,林港,洪mc,马琳.LIFR是一种乳腺癌转移抑制因子,位于hippoyap通路上游,是一种预后标志物。Nat地中海18(10): 1511 - 2012。e-Pub 2012。PMID: 23001183。
- 李俊,罗巴克P, Grünewald S,梁H.一个网络服务器,用于识别与患者生存数据最相关的基于网络的生物标志物。核酸Res40 (W): w123 - 126, 2012。e-Pub 2012。PMID: 22570412。
- Han L, dil, Yu S, Xu X, Li J, Zhang R, Yang Y, Werner HM, Eterovic AK, Yuan Y, Li J, Nair N, Minelli R, Tsang YH,张LW, Jeong KJ, Roszik J, Ju Z, Woodman SE, Lu Y, Scott KL, Li JB, Mills GB,梁H.人类癌症中A-to-I RNA编辑的基因组景观和临床相关性。癌症细胞28(5): 515 - 28。e-Pub 2015。PMID: 26439496。
- Li J, Lu Y, Akbani R, Ju Z, Roebuck PL, Liu W, Yang JY, Broom BM, Verhaak RG, Kane DW, Wakefield C, Weinstein JN, Mills GB,梁H.TCPA:癌症功能蛋白质组学数据资源。Nat方法10(11): 1046 - 1047。e-Pub 2013。PMID: 24037243。
邀请的文章
- 梁H金,你怎么.通过下一代测序确定胃癌的分子驱动因素。癌症列托人340(2): 241 - 2013。e-Pub 2012。PMID: 23178814。
社论
- 梁H.双编码区译码:影响含双orf转录本翻译潜能的关键因素。细胞Res20(5):508-9, 2010. PMID:20436511。
授权与合同支持
标题: | 功能蛋白质组数据的综合生物信息学资源 |
资金来源: | NIH / NCI |
角色: | 首席研究员 |
标题: | 整合分析来自反向相蛋白阵列(RPPA)平台的蛋白表达数据 |
资金来源: | NIH / NCI |
角色: | 共同 |
标题: | 德克萨斯大学MD安德森癌症中心孢子黑素瘤核心3 |
资金来源: | NIH / NCI |
角色: | 核心领导人 |
标题: | 对治疗压力的适应性反应机制图以优化组合疗法 |
资金来源: | 通过osu获得NCI |
角色: | 首席研究员 |
标题: | 肿瘤中m6A RNA甲基化的表征和建模 |
资金来源: | NIH / NCI |
角色: | 首席研究员 |