RPPA

核心定义了一套标准裂解物，用于每个阵列的数据生成和分析的质量控制(QC)。一套算法和定制软件应用程序已开发，以提高量化和质量控制。

• 成本效益:一个高吞吐量的方法同时测试和量化超过1000个样本在一个信号幻灯片。
• 敏感:适用于非常小的样本量(ng的蛋白裂解物，检测特异性蛋白的分子)，小于10个细胞当量。它检测并量化了在40 ug细胞裂解液中表达水平和修饰状态的数百种不同的蛋白质。
• 定量：重组蛋白/磷酸肽使蛋白质表达和改性水平的绝对定量能够。
• 简单:不需要直接标记裂解液样品。

MD Anderson的RPPA核心是科学界的宝贵资源，因为它具有其RPPA管道各方面的独特和持续的验证和质量控制，包括以下：

• 对每个样品进行连续稀释，以捕获线性抗体/抗原反应，以进行准确的数据分析
• 一个持续的和高度严格的抗体验证过程，以选择和保持最高质量的抗体用于RPPA分析
• 打印在每张幻灯片上的48个独特细胞裂解物的“锚”作为对照，用于开发基于复制的标准化，用于数据生成和分析的质量控制，以及不同幻灯片上的RPPA数据合并
• 一系列严格的质量控制流程为我们的RPPA数据分析开发、实施和优化，为客户提供可靠的数据:空间校正算法、抗体检测的质量控制、蛋白装载校正、基于复制的归一化和抗体批次的质量
• 用于减少手工劳动力，人为错误和客户周转的RPPA管道流程的自动化程序
• 一组算法和自定义软件应用程序，以提高量化和质量控制
  

RPPA表示肿瘤组织和培养细胞的基于抗体的功能蛋白质组学分析。RPPA表征基础蛋白表达和修饰水平，生长因子或配体诱导的效果，以及适合于系统生物学分析的时间分辨反应。它提供了整合癌症中遗传畸变的结果，以验证治疗靶标，证明药物和偏离靶向活动，并评估药物药效。