关联数据科学家(Pavan Bachireddy博士的实验室)

关联数据科学家

总结
我们正在寻找一个有才华和高度动机的关联数据科学家感兴趣的理解进化论癌症和肿瘤微环境中免疫细胞之间的相互作用。我们实验室使用无偏,高维技术解码规则的相互作用在不同的细胞类型肿瘤环境决定病人结果癌症免疫疗法,主要是在血液恶性肿瘤。

关键功能
新一代测序的数据分析和部署Immunogenomic工具:
* *运行体细胞突变,复制和转录改变管道数量匹配肿瘤/正常对全基因组外显子组/和RNA-seq数据。* *运行单克隆估计和突变发展史推理工具。* *执行单点和连续分析单细胞RNA-seq ATAC-seq CITE-seq和TCR / BCR-seq数据。* *创建管道包括一套广泛的内部和外部的免疫反褶积,HLA推论,neoantigen预测,T和b细胞剧目分析软件。* *编写自定义脚本提高免疫原性方法在实验室开发。包工具使用码头工人和Conda应用程序。

协助和教别人:
*协助分析和发展形式,算法和软件。*与方向,开发和维护软件工具和基础设施来解决具体问题。*维护管道进行测序数据的分析。*有助于发展的过程和在新的程序提出建议;通过杂志俱乐部有助于知识氛围,分享他人的想法和建设性的反馈报告,和协作。

支持正在进行的研究项目:乐动体育LDsports中国
* *提供生物信息学和基本统计支持正在进行的研究项目包括/突变基因差异表达分析、基因集富集和路径分析,自定义序列比对等。* *下载乐动体育LDsports中国和分析TCGA公开的数据集,如,CCLE, GTEx和地理。* *生成定制的分析结果的可视化。* *组织数据和文档和代码为每个项目开发* *分配的其他职责。

能力
系统地分析思考,收集相关信息;将问题分解成简单的组件;声音做决定。

创新思维方法问题的好奇心和开放性;提供新的想法,解决方案和/或选项。

技术/功能的专业知识-展示技术熟练程度要求做这项工作;掌握最新的专业知识;提供专业技术。

面向服务
提供服务给我们的利益相关者,包括患者,护理人员,和同事,在一个安全的,礼貌的,负责任的,有效的和创新的方式包括:
•促进包容性和同僚合作,展示了尊重和专业对我们的利益相关者
•安全建模,道德行为,降低风险的机构通过合理的商业实践,坚持MD安德森的行为标准,机构的政策和程序
•及时响应请求时主动沟通过程、预期服务的到来,或项目可交付成果的利益相关者
•使用治愈的步骤(听、移情、地址和学习)当服务补救的关系是必要的